短暂的低潮
在2002-03赛季，科比场均可以得到30分并且完成了连续9场比赛拿到40+，整个2月份场均得到40。6分。
另外，他还能场均贡献6。9个篮板，5。9次助攻和2。2次抢断，均为生涯新高。科比再一次同时入选NBA最佳阵容和最佳防守阵容的第一阵容，在MVP的票选中排名第三。
在常规赛取得50胜32负之后，湖人队在季后赛西部半决赛6场比赛后输给了当年最终的总冠军圣安东尼奥马刺队。
接下来的2003-04赛季，湖人队获得了全明星球员卡尔·马龙和加里·佩顿，再次冲击总冠军。
在赛季开始前，科比因为性侵犯指控被捕。这导致了科比因为出庭缺席了一些比赛；或是某天的早些时候出庭，在同一天的晚些时候赶去参加比赛。
在常规赛的最后一场比赛，湖人队对阵开拓者队。科比用两次绝杀带领湖人取胜，并赢得了太平洋赛区的冠军。在第四节的最后时刻，科比投中三分球扳平比分，将比赛拖入加时赛。比赛最后进入了第二个加时，科比又投中压哨三分帮助湖人105-104获得了胜利。
拥有四名未来篮球名人堂球员，奥尼尔、马龙、佩顿和布莱恩特，湖人队最终杀入NBA总决赛。
在总决赛中，湖人队被底特律活塞队在5场比赛中击败，后者自1990年第一次获得总冠军。总决赛系列赛中，科比场均贡献22。6分，还有4。4次助攻，命中率只有可怜的35。1%。
菲尔·杰克逊没有与湖人队续签合同，接替他教练职务的是鲁迪·汤姆贾诺维奇。奥尼尔被交易至迈阿密热火队，换来了拉玛尔·奥多姆、卡隆·巴特勒、布莱恩·格兰特。
第二天，科比拒绝了洛杉矶快船队提供的合约，与湖人队续签了一份长达7年价值1亿3640万美元的合同。
2005-06赛季是科比篮球生涯的转折点。尽管之前与科比有分歧，菲尔·杰克逊还是选择重回湖人执教。[74]科比对此举动表示赞同，各种表现证明，这二位的第二次合作还不错，带领湖人队重新回到了季后赛。科比的个人得分数据也是其职业生涯中最好的一个赛季。
在2005年12月20日湖人vs达拉斯小牛队的比赛中，科比在前三节比赛中独得62分（第四节未出场），在他下场时个人得分62分竟比小牛全队61分的得分还高，科比是自24秒计时器引入以来的第一位做到此的球员。
2006年1月16日，湖人队面对热火队，科比与奥尼尔在赛前的握手和拥抱成为了当日的头条，标志着这两名球员之间的矛盾逐渐发生改变。
一个月之后的2006年NBA全明星赛上，这两个人被看到在一起说笑。2006年1月22日，在对阵多伦多猛龙队的比赛中科比得到了职业生涯新高的81分。
除了打破之前由埃尔金·贝勒创造的71分的纪录，科比单场81分还是NBA历史上单场第二高分，仅次于威尔特·张伯伦于1962年创造的单场100分纪录。
在同一个月内，科比还成为了自1964年以来第一位连续4场比赛得到45分或更多得分的球员，成为继张伯伦与贝勒后第三位可以做到此的球员。
整个1月份，科比场均可以得到43。4分，排在NBA历史单月场均得分第8位，以及除张伯伦外个人单月场均得分第一位。2005-06赛季结束时，科比创造了湖人队史单赛季取得40+场次最多的纪录以及最多得分的纪录。
科比凭借场均35。4的得分第一次获得了联盟得分王的头衔。
在2006年NBA最有价值球员奖评选中排名第四，但他获得了22张第一名的选票--仅次于最后的胜者史蒂夫·纳什。湖人队打出了45胜37负的常规赛战绩，比前一个赛季多赢了11场。
8号→24号该赛季的晚些时候，有报道称科比将从2006-07赛季开始改变自己的球衣号码，从8号改为24号。他在高中的第一件球衣就是24号，之后改穿33号。
科比在TNT电台采访时说，他曾打算在新秀赛季选择24号，但是无法实现，而33号球衣已经随同卡里姆·阿布杜尔-贾巴尔退役了。
科比曾在AdidasABCD训练营身穿143号，所以最后选择了三个数字之和8作为自己的号码。在季后赛第一轮，湖人队做得足够出色，他们在系列赛中以3-1领先菲尼克斯太阳队，其中第4场比赛凭借科比投入的两记关键球击败了对手。
在第6场比赛中，他们仅差6秒就可以将二号种子太阳队淘汰出局，但是最终还是在加时赛中以118-126输掉了比赛。
尽管科比在系列赛中场均可以得到27。9分，但是湖人最终在7场大战中输给了太阳。在第7场90-121负于太阳的比赛中，科比因为在下半场仅有3次出手而受到指责。
在2006年的休赛期，科比进行了膝盖手术，使得他无法参加2006年世界男子篮球锦标赛。
他自己曾说：“24号的意义就是24小时，我希望把自己的所有精力都投入到篮球当中，这就是我选择24号的原因。如果不能全身心认真投入，我就不是科比。24是我的最佳诠释。”
第二次获得NBA全明星赛最有价值球员奖。整个赛季，科比卷入了一系列的球场事故之中。
1月28日，科比在投出一记可能制胜的跳投后，手肘打在了马刺队后卫马努·吉诺比利的面部。
经过联盟的重新审查，科比被禁止参加随后在麦迪逊广场花园与纽约尼克斯队的比赛。这次禁赛的依据则是科比向后挥动手臂是“一个反常的动作”。
之后，在3月6日，他好像又重复了这样的动作，而这一次打到了明尼苏达森林狼队后卫马科·贾里奇。
3月7日，NBA给科比开出了第二次禁赛一场的罚单。
3月9日，在他回归的第一场比赛中，他又肘击到凯尔·科沃尔的面部，赛后该行为被追加为一级恶意犯规。
3月16日，科比在主场对阵开拓者队的比赛中得到赛季最高的65分，帮助湖人队结束了7连败。这是他11年职业生涯第二好的得分表演。
接下来的一场比赛，对阵森林狼队科比得到50分，之后一场比赛，科比在战胜孟菲斯灰熊队的比赛中得到60分—成为第二位连续3场取得50+得分的湖人球员，也是继1987年迈克尔·乔丹后第二次有这样的表演。
另一位可以做到这样的湖人球员是埃尔金·贝勒，他在1962年12月连续三场得到50+。
第二天，在一场对阵新奥尔良黄蜂队的比赛中，科比得到50分，成为继张伯伦之后NBA历史上第二位取得连续4场50+得分的球员，连续50+场次最多的纪录是张伯伦创造的7场。
赛季结束，科比总共拿到10次50+，成为继张伯伦在1961-62和1962-63赛季后唯一能在单赛季做到此的球员他还连续第二年获得了得分王头衔。
在2007年季后赛中，湖人队再次在季后赛第一轮以1-4输给了太阳队。
MVP
2007年12月23日，科比在麦迪逊广场花园对阵纽约尼克斯队的比赛中成为史上最年轻的达到20000分的球员（29岁122天）。
尽管在2008年2月5日的比赛中右手小拇指韧带撕裂，科比并没有选择手术，而是打满了常规赛的82场比赛。谈及他的伤势，科比说道，“我更喜欢在湖人赛季结束或今夏北京奥运会后再进行手术。现在我和队医必须继续每日观察我的伤情”。
科比带领球队打出西部最佳的57-25的成绩，在第一轮横扫丹佛掘金队。
2008年5月6日，官方正式宣布科比荣获NBA最有价值球员奖，是他职业生涯的第一次。他说道，“这真是一次漫长的旅途。我很自豪能够代表这支球队，代表这座城市。”
将科比带到湖人队的杰里·韦斯特也出席了科比接受MVP奖杯的新闻发布会。他说，“科比配得上这座奖杯。他只是又打出了一个伟大的赛季。我一点也不惊讶。”
除了获得MVP奖项之外，在5月8日，科比还是唯一一名全票入选NBA最佳阵容的球员，这是他连续第三年入选第一阵容，职业生涯第六次。
之后，他又与凯文·加内特领衔NBA最佳防守阵容第一阵容，科比总共获得52分包括24张第一名选票，这是他第八次入选。
湖人队以西部第一名进入季后赛，首轮对手是掘金队。第一场比赛中，大部分时间作为诱饵的科比在比赛的最后8分钟拿到了他32分中的18分，确保湖人队保持领先。
湖人队在首轮4-0击败掘金队，使掘金成为自2004年灰熊队被马刺队首轮横扫后第一支获得50胜的球队在首轮被横扫。
在第二轮对阵爵士队的第一场比赛中，科比得到38分帮助湖人击败爵士。湖人同样赢下了第二场比赛，但是输掉了第3和第4场比赛，虽然科比场均可以得到33。5分。
湖人赢下了接下来的两场比赛，用6场比赛赢下了西部半决赛。湖人在西部决赛的对手是马刺队。湖人队用5场比赛击败了马刺队，闯进NBA总决赛对阵波士顿凯尔特人队。
这是科比生涯第5次，也是第1次在没有奥尼尔的情况下进入总决赛。
最后湖人队在6场比赛后输给了波士顿凯尔特人队。
