黄子澄是最先接近建文帝朱允炆的人，不是他有多么了不起，而是他有一个特殊的身份——东宫伴读，也就是太子的老师。在中国古代权力系统当中，东宫伴读并不是一个小角色。尤其在帝国命运走到一个转弯地带，他往往能够起到扭转乾坤的大作用，当然这也和个人能力大小有关。在这个职位上想要默默无闻都很难做到，如果太子能够在将来的某一天顺利继承大统，那么他这个东宫伴读很有可能会拽着新皇的权力尾巴扶摇直上，只手遮天也未可知。
正因为这种利害关系摆在那里，东宫伴读往往是太子的铁杆粉丝。在太子接任帝国权柄的道路上，他们会逢山开道，遇水搭桥，与太子结下一荣俱荣一损俱损的亲密关系。而当时的黄子澄与朱允炆就结下了这种非一般的关系，朱允炆有了“难题”，也要去请教黄子澄。
有一天，朱允炆坐在明皇宫的东角门，脸上布满了忧愁的神色。这时候，黄子澄走了过来，师生二人就在东角门定下削藩的政治主张。两人当时只是务虚，本没有碰撞出多少智慧的火花，更谈不上具体的实施办法。
时过境迁，现在朱允炆已经是大明的皇帝，没有谁能阻挡自己对武力削藩的向往。他决定实施师生二人当年定下的主张，用汉景帝的武力削藩的方式，将分散在藩王手中的权力一一收回。武力削藩不是无理取闹，它需要一个理由。论辈分，这些藩王都是自己的叔叔，他们既没有造反，又不能乱政，虽然有人在背后说他们图谋不轨，可抓不到把柄，也不好削夺他们的权力。
建文帝想解决藩王问题，但又不想引起不必要的麻烦，所以他在极小范围内秘密地进行削藩问题的讨论，没想到小范围的活动却引发大范围的关注。朝中那些政治嗅觉灵敏的官员也参与到削藩的专题研讨中来，由此在帝国的中央权力结构中形成了三方不同的意见。
一方削藩强硬派。这一派呈梯队作战模式，在最前方摇旗呐喊的是黄子澄和齐泰等人，而背后谋篇布局的是方孝孺，建文帝则是最大的支持者。按照黄、齐、方三人的意思，既然已经开始磨刀，那索性就以迅雷不及掩耳之势将藩王势力连根拔除。
另一方是削藩温和派。这一派虽然不反对削藩，但他们还是为暴力削藩蒙上了一层温情的面纱。他们觉得这些藩王都是先皇的子嗣，做法不可过于冷血。他们不赞成连根拔除，认为可以借鉴汉武帝对待藩王那样实行“推恩令”。也就是在各个亲王原有封国领地上，除了嫡长子继承亲王头衔外，其他的儿子也都给封地和郡王头衔，长此以往，郡王会越来越多，他们的封地会越来越少，自然力量也就越来越薄弱。这么做既保证了帝国权力根基不会被动摇，同时也保全了皇族之间的亲情。客观地说，这一派提出的方案非常符合实际，且操作性强。
还有一方是削藩反对派。这一派的观点也很明确，那就是不但不能削藩，还要对那些藩王们做到有礼有节。这时候舆论大环境已经在逼藩王造反。为了缓和矛盾，建文帝应该立即打消削藩的念头，摆出一副与他们修好的姿态。
洪武三十一年（1398）六月，户部侍郎卓敬秘密上奏建文帝：燕王雄才大略，极似太祖，且兵精马强，北平又是战略要地，宜及早剪除，杜绝后患。否则，待其准备就绪，浩浩大军建瓴南下，难以挽回危局。
建文帝在看完卓敬的奏本后，并无声张。但没有不透风的墙，建文帝削藩的政治谋划还是外泄到了诸藩王那里。由此可见，当时朝廷削藩已经不仅仅局限于建文帝和三两个君臣之间的谋划，而藩王们在京城的势力已经无孔不入，就算是最高机密也逃不开他们的耳目。
朱允炆君臣在紧锣密鼓地进行当中，那藏于内廷的窃窃私语还是引发了藩王们极度的不安与警觉。他们并不愿意做待宰的羔羊，更何况他们手里有兵还有枪。你在京城磨刀，我就可以在边疆搞搞军演。藩王们恃仗军事武力，不断地向中央施压。藩王们之间互相串联，众口一致，将矛头对准武力削藩派的主干齐泰和黄子澄。
他们提醒建文帝，不要受外人蛊惑。他们这么做，也是为将来彻底翻脸寻找一个可以说服天下人的借口，无非就是“清君侧”。为江山社稷计，就要将皇帝身边的小人都除掉。
这些藩王们越施加压力，建文帝就愈加坚定他的削藩决心。既然已经箭在弦上，那索性就冲着靶心而去。对于建文帝来说，那些削藩强硬派就是他的政治盟友。在他还未登基的时候，就在试探自己的老师黄子澄。
黄子澄虽然只是个儒学书生，但是在宫廷里呆了这么多年，什么场面没有见过。他当然明白在当前的局势下皇帝问这句话的用意何在，建文帝曾经命他与兵部尚书齐泰同参国政。何为同参国政？也就是共同商议国家大事。建文帝重提当年东角门二人密议削藩之事，他很快就领会了其中的深意。
黄子澄找到齐泰，他跟齐泰说：“齐尚书，当今皇上年少，在治国方面没有什么经验，可他的那些叔叔们手握重兵，多行不法，照此发展下去，恐怕我大明危矣。你我都曾受先皇之重托，承蒙当今皇上之厚恩，理应为国分忧啊！”
齐泰也是聪明之人，当然能够听出黄子澄说话的意思。他马上回答说：“为子则孝，为臣则忠，你我如今都是大明股肱之臣，就理应要报效国家。只是削藩之事关系重大，处置不当，恐怕会后患无穷。”
君臣三人最后经过一番合计，决定先从燕王朱棣的亲弟弟周王朱橚的身上下手。
其实黄子澄和齐泰在商议具体削藩时意见还不统一，黄子澄说：“周、齐、湘、代、岷诸王，在先帝时，尚多不法，削之有名。今欲问罪，宜先周。周王，燕之母弟，削周是剪燕手足也。”总体目标是一致的，那就是一定要把燕王拉下马来，而到了实际的实施过程中，齐泰主张首先擒燕，黄子澄不仅不同意还发表了上述的高论，这种打草惊蛇的做法居然得到了最高当局的首肯。从后来的种种大政方针的取向看，虽然建文帝是齐黄并用，实际是更倾向于黄子澄的看法，毕竟是东宫的交情在那里摆着。
然而，这时候卓敬别有一番议论，卓敬给建文帝上奏折说：“燕王智虑绝伦，雄才大略，酷类高帝。北平形胜地，士马精强，金、元年由兴。今宜徙封南昌，万一有变，亦易控制。夫将萌而未动者，几也；量时而可为者，势也。势非至刚莫能断，几非至明莫能察。”卓敬的核心在于不动干戈的情况下先以迁徙的办法消祸乱于无形，应该说是相当高明的一招。而这样做理由光明正大，即使燕王一百个理由也不会不同意，更不会拿出祖制靖难的招牌说事。可是，这么一个“天下至计”竟然得不到建文的任何响应。
卓敬这个人在当时也应该是天下奇才，就连后来杀害他的明成祖朱棣也不得不承认“国家养士三十年，惟得一卓敬”的事实。
朱元璋生前对卓敬是非常看好的，可惜建文帝并没有给予他足够的信任。
