孙仲平在漳州创立大越国，朝廷根据熊文灿的汇报，调重兵入闽讨伐，思宗更是拿出八十万两内币，江西、湖广的兵马纷纷进入福建。可是明军还未展开军事行动，福建漳、泉两府突然爆发大规模的瘟疫，瘟疫范围囊括了孙仲平控制的主要城镇。疫情之严重，在短短数周的时间，便有近万人死亡，此次瘟疫来势凶猛异常，其以福建为中心，向邻近各省扩散，甚至进入了台湾，瘟疫突然爆发，彻底打乱了双方的部署。
福建暴发重大疫情，全省范围内死亡数字直线上升。村子里的人向镇上跑，镇子上的人向县城跑，县城的向州府跑。
“这次鼠疫也太厉害了吧，前后不到三天就挺了，不会是变种吧。”
“可能是，不过一切要等我解剖后才知道，今天我教你病理学。”
“我老婆最近有反映了，我要去照顾她。”
“你说你黄琼英老婆又有了。”
“好像是吧，早上的时候他呕吐不止。”
“嗯，那你是要好好照顾她，去吧。”刘陵已经将死人的肚子里肝脏取了出来，放在了一边的托盘中，这一举动让刘明跑到外面狂吐不止。刘明不怕杀人，别看他年纪不大，但是他身上已经背了近百条人命，如果放在我们伟大祖国，他早就被和谐了，哪里还有机会在这里吐哇。
数天后，刘陵使用一系列的专业术语，最后告诉刘明瘟疫发生突变。
面对这种情况刘明感到非常害怕，台中的疫情虽然没有福建那边那么严重，但是镇外已经收治了近4000人，死亡病例322人。
承天州那边的疫情更为严重，因为福建方面的新近移民全都被安置在这一地区。
刘明的意思是彻底停止移民活动，切断福建方面的病源，可是你不将福建的百姓移到台湾，难道他们就不会自己过来吗？
战乱、瘟疫、干旱，福建省内民不聊生，在他们看来能吃饱饭的台湾就是天堂。
对于刘明招募百姓去台湾以及百姓自发去台湾的举动得到了熊文灿巡抚默许，现在福建省内流民无数，只要一个小小地火星就能将坐在火yao桶上的熊文灿炸飞，所以堵不如疏。
漳、泉甚至福流传妈祖在台湾显圣，所以前往台湾的百姓都是以万计。
瘟疫自福建的灾民身上传入台湾，并且大范围的扩散，刘陵赶赴北港，刘明想跑也跑不掉，他现在可是台湾的负责人。
“你去不就行了，我去了又能做什么呢？”
“你是朝廷任命的台中宣慰使，在台湾你最大，你不去谁去。”
刘明只好硬着头皮一起赶赴北港，但是具体赈灾工作由刘陵全权负责。
作为北港的元老杨天生、陈衷纪等人，在刘明、刘陵到达北港后不久，便乘船离开了这个重灾区前往金、厦。
在赈灾的过程中按照刘陵的指示，所有来台新移民必须接受被隔离，接受卫生检查，他们必须洗头、洗澡，移民司会给予这些新移发新衣服，如果一个星期内没有情况，移民司将被分散安置到各囤田处。
刘陵率领她的天主教教济会频繁地出现在灾民的中间，宣扬上帝。
刘明不明白刘陵为什么这么热衷于宣传上帝，难道她精神空虚。
北港的疫情在刘陵来到后得到了一定的扼制，可就在这个时候鼠疫发生二次突变，鼠疫向台湾中部地区蔓延，不仅仅如此，鼠疫跟随商船队顺利通过海关进入了大日本帝国以及西班牙人控制下的吕宋岛。
东亚爆发大规模的黑死病，吓得从巴达维亚赶来的荷兰舰队不战而逃。
黑死病在中世纪的欧洲杀了一半人口，而且每隔几十年就来上一次，每次不死个百十万人，简直就是对不起上帝他老人家。欧洲人谈黑死病能为之色变。
热兰遮总督彼得·努易兹彻底绝望了，
这船队一走，不可何年、何月、何日、何时才能回来。
彼得·努易兹派出代表与北港谈判，可是北港方面不和他们谈判，看到这帮荷兰人出来的时候，城外的军士极其惊恐。这些荷兰代表被当场杀死，而且还被火烧成了灰后深埋。
通过翻译他才得知这些中国人认为瘟疫是他们带来了，他们是邪恶的魔鬼。所以，那些中国人最近才会在周围竖立那么多十字架，他们是要用十字架的法力镇住他们这些红毛妖怪。
“这些野蛮的东方人。”
热兰遮城陷入了恐慌之中，城内的荷兰人个个神经高度紧张，就算轻轻的咳嗽声，也会被误认为是黑死病的前照而当场被人打死。
彼得·努易兹在巨大的精神压力下同意了高达八十万银洋的赔款，为此，彼得·努易兹总督代表荷兰与刘明全权签订了《台南协约》。
刘明拿到相当于四十万赔款后解除了对热兰遮的海上封锁。
彼得·努易兹在第一时间将《台南协约》传回巴达维亚。
这艘带着《台南协约》根本就没有机会进入巴达维亚港，因为所有的人都相信他们身带着黑死病，这一船的人最后全都死了，伴随着熊熊的烈火，《台南协约》成为一堆灰末沉下了爪洼海。
在澎湖刘明的老兄弟杨天生、陈衷纪同他们的战船一起沉入了海底。
不知是处于对瘟疫的惊恐，还是贪图杨、陈两位当家所带财物，李魁奇将杨、陈和他们的手下杀了一个精光，并且毁烧了他们的战船。
只有少数人趁乱逃回了台湾。
他们中间以杨天生的侄子杨宏、陈衷纪的族弟陈国华为代表请求刘明讨伐李魁奇。
刘明派人前往金、厦将这件事报知郑芝龙，另一方面派人到澎湖询问事由。
李魁奇可是一个老海盗，坐镇澎湖多年，实力雄厚，他不怕郑芝龙，更不惧刘明，他把刘明派来问罪使者砍了，刘明大怒发檄文讨伐李魁奇，袭击来往台海之前李氏的船只，并广造战船、大肆练兵，远在澎湖的李魁奇都有所耳闻。
李魁奇也不示弱，与刘香，杨六、杨七等人结盟讨伐刘明。
郑芝龙厦门得知杨天生、陈衷纪被害，失声痛哭，誓杀李魁奇为了杨、陈两位当家的报仇。
熊文灿曾令将郑芝龙肃清沿海的海盗，杨六、杨七等人与李魁奇结盟讨伐刘明，郑、刘现有姻亲，郑芝龙于公于私都要鼎立相助，遂誓师讨伐杨六、杨七。
自刘明出世以来顺风顺水，从来没有打过败仗，可是这次讨伐李魁奇遭到了人生以来第一大败。
澎湖一役，林福、陈松等十二名头领，在老海盗杨洪率领下先胜后败，七十五艘战船，仅有七艘幸免，败的可谓是惨不忍睹，回来的这些头领们哭的泣不成声。
来日，李魁奇亲自率领百五十四船来北港问侯刘明，吓的刘明不敢接战。
李魁奇这初生之犊的确有两把刷子，刘明不会水战自然不敢和他打，而他手下这些头领虽说都是水战的好手，却没有一个统领人物，手下的大将康劲此时正在金、厦协助郑芝龙封锁漳州府。
“大当家，此事何不请二当家出手。”
被林可正、徐其才两位幕僚这么一提醒，刘明赶紧去找刘陵，进屋便泪流满面。
“刘备的那招对我没有用，收起你的眼泪吧！”
“你这么多兵马连一个李魁奇对付不了，我堂堂圣女去对付李魁奇多没面子。”
“我说大姐，那李魁奇极善海战。”
“极善海战，这年头的海战无非就是冲撞和接弦。”
“可是你知道我晕船。”
连这个借口都用上了刘陵也只好勉为其难的出手了，真要让李魁奇进了门烦心的事还不知有多少。
听闻刘明要亲自出战，李魁奇大笑起来，“来日必生擒小儿。”
澎湖虽处台海咽喉，却没有多少发展空间。李魁奇早闻台湾在刘明的治理下民众物丰，此次正好夺之做为根基，到那时郑芝龙何足为惧，日后这片大海便是他李魁奇的天下了。
