第二天一早，天堂岛地下的秘密基地的忍者神龟寝室。
米开朗基罗坐在床上看漫画、拉斐尔练狂打沙袋、多纳泰罗坐在椅子上研究，而达芬奇则无所事事的靠在墙壁站着。乌贼娘走了进来看着达芬奇：“喂！就你在这畅快，难道你就不应该做点事不行吗？”
达芬奇不为所动，因为他并不清楚接下来要该怎么做？
乌贼娘无语的认为：“达芬奇你根本就是忍者神龟小队中的一颗木头，难道就不应该做点事情可做吗？。”
达芬奇却提醒乌贼娘：“虽然这几天来都没有黑翼军团的行动，但我还是担心，世界在进步的时代无法缓步下去。他选择还是静静的等着，知道灾难发生的那一刻。”
乌贼娘无奈的离开了。米开朗基罗抱怨达芬奇：“你不能对一个小女孩说这样的话！”
达芬奇无语的说道：“她是女孩子吗......”
光之美少女寝室。青木丽华拿起画板和水彩笔对墙上的画框内的山林画画、日野茜和绿川直一起下棋、黄濑弥生在一旁看青木丽华画画、唯独星空美幸躺在床上傻傻的看着天花板。
日野茜对星空美幸无奈的说道：“你这样躺在床上什么都不做，有用吗？”
星空美幸说道：“有用个屁！我们现在都已经成了黑翼军团的眼中钉肉中刺，我到底该怎么想也不会弄得清楚些！因为他们都在到处抓我们，一出来就是被捉了。”
日野茜埋怨星空美幸没有了以前打败皮耶罗的荣光。
星空美幸却认为：“如果这个世界永远失去了笑容，那我这个光之美少女还不如不做呢！”
绿川直也在一旁指责星空美幸：“大家都想不出办法，难道我们非要在这等死吗？”
青木丽华认为：“星空美幸说的很有道理，我们不能一味地在这坐以待毙下去，我们现在最主要就是该如何把黑翼军团赶下台。”
黄濑弥生赞同青木丽华的意见。
星空美幸听了这句话，不仅感到悲哀，而且她再一次起来说：“青木丽华非常有见识。无论如何，我们都不能再让黑翼军团为所欲为了！我们是光之美少女，我们要阻止他们！”
日野茜和绿川直也站起来支持星空美幸。
喜羊羊坐在会客厅的沙发上，到底怎么想都不明白对付黑翼军团为什么会这么难？
阿尔托莉雅在一旁安慰道：“他们个个都是我们以前认识的老朋友。而现在，他们却成了梦原希的走狗.....喜羊羊看着阿尔托莉雅，阿尔托莉雅回应：别这样，我不会和他们一样！”
喜羊羊知道阿尔托莉雅是个看清事实的人，说：“我一早就清楚你这种个性不会与黑翼军团为伍。我想知道对于那件事，我已经考虑了半天，我还是觉得......”
喜羊羊话还没说完，柯南突然出现打断了他们的对话。喜羊羊很惊讶的提醒柯南：“不要再这个时候出现好不好？”
柯南却告知两人：“黑翼军团虽然是岛上唯一的统治者。但只要时间一过，他们也会自行崩溃并且迅速瓦解对吧？”
阿尔托莉雅不解的问：“你凭什么知道这一点？”
柯南只说了一句：“因为真相只有一个！”就走了。
喜羊羊和阿尔托莉雅感到好生奇怪。
柯南走到外面的走廊上遇见了小樱。小樱想问下柯南：“你是不是随便就这么一说就把他们两个说服了？”
柯南答道：“还差得远呢！”
美美野来未在指挥中心看着显示屏上的对比斯科迪共和国的公主米尔希欧蕾支持尼罗帝国的采访。
红秀丽走了进来看着叹息的美美野来未，说：“一切都会大不如前的。”
美美野来未认为：“对于连一国的公主也沦为了梦原希的仆从，我心里实在是不快啊！”
红秀丽安慰的说：“黑翼军团所制定的政策导致一个个来自异世界的英雄都成了他们的爪牙，我不知道为何就没人起身反对梦原希的统治呢？”
愤愤不平的美美野来未说：“如果换成是我，就绝不会允许自己这么做的！”
然后她就从门口离开了，柯南和小樱进来看见恼火的美美野来未，都想问：“到底是什么事让她受了这么大的打击？”红秀丽低声叹气......
莲音和法音的寝室。法音为莲音做了一株特别漂亮的钻石项链。
莲音充满喜悦地让法音给自己戴上，法音把钻石项链戴在莲音脖子上，莲音发现项链上的吊坠放着她与法音的小照片。
法音说：“这是我熬夜给你做的，做这个是为了纪念我们两个的姐妹情。”
莲音听了这句话，感动地流泪。法音看见莲音哭了，吓得慌了起来劝莲音：“别哭，我知道我自己做的不好......”
莲音打断了法音的话，说：“我知道法音为了我做了太多辛苦。”她不得一下子上前搂在了法音的怀中。听了这句话，法音也流泪了......
“哟！挺浪漫的啊......”两姐妹看见茵蒂克丝走了进来，赶紧分开！
茵蒂克丝对法音说：“不知道你们是为了什么才这样的？但我还是先告诉你，我们要做的事还没完成，你最好还是和你的好姐妹莲音乖乖的滚回彩云国企业。”
法音却说：“我们两姐妹的事用得着让你来管吗？你不要没事找事。”
说完，她要茵蒂克丝赶紧离开。茵蒂克丝无奈的走出去了。
茵蒂克丝气愤地走在走廊上认为：“那两姐妹有什么能耐斥责我？我可是修女啊！”
乌贼娘走在走廊上看着气愤的茵蒂克丝，想过去问茵蒂克丝：“到底怎么了？”
茵蒂克丝却直说“气人”，然后就走了。
乌贼娘不解的问：“什么是气人？”
城堡高塔的办公室内，梦原希坐在办公桌前的旋转王座上看着桌上的文件。
拉达曼迪斯突然走了进来告知梦原希：“我的人在水之城发现了入侵者，可看起来好像是一只狼。”
梦原希对于突如其来的消息问道：“狼？沃夫伦的同类？”拉达曼迪斯回答：“不是，看起来应该和那只羊一样都穿着盔甲，而且他还成了那里的反抗者的领导......”
梦原希命令拉达曼迪斯道：“马上通知在水之城的黑翼军团。抓到他，把其他的入侵者也给引出来！”
拉达曼迪斯便离开了。梦原希无情的说道：“我会让你看到这个新时代的来临，美美野来未！”
喜羊羊和阿尔托莉雅走在往指挥中心的走廊上。喜羊羊问道：“尽管黑翼军团控制的尼罗帝国日渐猖獗，为什么就没有任何一个国家出来谴责它呢？”
阿尔托莉雅说：“尼罗帝国拥有由彩云国企业及多个武器重工集团资助的超级武器，它们会随时干掉眼前的敌人。各国不想惹火上身，关闭了在天堂岛的驻屯基地保持中立。”
喜羊羊认为：“这此举就是坐以待毙。”
两人进入指挥中心再次遇见了五个光之美少女、乌贼娘、茵蒂克丝、四个忍者神龟、柯南、小樱等人。美美野来未在显示屏前向大家告诉一个惊天的消息：“我发现了黑翼军团秘密进入天堂岛南部的货仓准备抢走被封闭的各国驻屯军队的武器，那样他们的‘伊斯雷之日’计划就可能会容易的完成全球征服。”
众人大惊，星空美幸率先认为：“要是一旦那些武器真的落在了黑翼军团的手里，那么我们的努力就全白费了！”
喜羊羊也一致建议：“我们得在他们来之前赶到货仓，伏击他们！一不做二不休，彻底歼灭黑翼军团！”
阿尔托莉雅支持喜羊羊的建议，众人也一致赞同。美美野来未见此情形，便说：“既然各位的意见一致，那么我们就立即起身，黑翼军团必须被阻止！”
白天，黑翼军团的车队绕过货仓外围的门口进入了货仓中心。众人在草丛后边商议该如何悄悄地潜入货仓。
多纳泰罗认为：“我们得分几个小队散开这些黑翼军团。日野茜、拉斐尔、乌贼娘去门口挑衅黑翼军团，喜羊羊、阿尔托莉雅、星空美幸、绿川直、达芬奇、米开朗基罗则拆开外围偷偷进入货仓，而我和柯南、小樱、黄濑弥生、青木丽华、茵蒂克丝、美美野来未等待在原地见机行事。”
于是众人分成三队各自离去。
日野茜、拉斐尔、乌贼娘三人跑到黑翼军团门口辱骂把守的黑翼军团，黑翼军团愤而袭击三人，三人便与黑翼军团交战。
喜羊羊、阿尔托莉雅、星空美幸、达芬奇、绿川直、米开朗基罗等人则到货仓外围，达芬奇手持两把RB刀将外围砍成大洞。六人在没被巡逻的黑翼军团发现的情况下悄悄地潜入3号货仓内。
六人躲在箱子堆后边看见美川文迦、麻仓叶、紫龙、索尼克、沙鲁等人命令众士兵在拆开武器箱的盖子，拿走了大量的常规武器及投掷武器，米开朗基罗见状欲上前被达芬奇制止。
没想到，紫龙看见箱子堆后边有动静，将箱子堆拿开看见喜羊羊等人在这。喜羊羊等人被逼无奈只好准备开打，美川文迦怒不可遏，他与其他人率领黑翼军团攻击喜羊羊等人，喜羊羊等人被迫与美川文迦等人及其带领的黑翼军团在里面交战。
期间美川文迦说：“我要你去死，然后再替你写几篇死后文给给你的家人。”
喜羊羊反驳美川文迦的说：“我的家人已经当我死了！”
阿尔托莉雅在质疑索尼克说：“你什么时候加入了黑翼军团？”
索尼克回应：“这个时代在进步，加入他们也是理所当然的。”
阿尔托莉雅却说：“你此举就是违背了大义，现在我要把你的头板正。”
麻仓叶知星空美幸也和梦原希一样是光之美少女，就说：“我劝你们马上投降，我想看到两个光之美少女一起合作征服世界。”
星空美幸反驳麻仓叶的话，说：“梦原希早已经抛弃了光之美少女的原则，现在的她只不过是凶恶的毒蛇！”
达芬奇警告沙鲁：“不要为梦原希那个臭婆娘卖命。”沙鲁说：“我既离开了格罗博士，理应就要从了梦原希为新的主人。”绿川直就骂骂他是：“反复无常的狗！”。
几个分钟后，喜羊羊等人终于打败了黑翼军团。阿尔托莉雅想从美川文迦身上知晓关于尼罗帝国所有的信息。
美川文迦却突然傻笑起来说：“那可真是不得了了。”
众人好生奇怪，为何美川文迦会说出这么让人心寒的话？
突然，米开朗基罗遭到背后的神秘人物的袭击打飞在地。众人转过身发现居然是原来施莱德的走狗，紫龙帮的头目——韩！
