在青瓦台国宾馆宾主分主次坐下后，卢武铉首先致词表示欢迎，接下来安倍发言，表示感谢东道主的热情接待，重复他访问的目的：“日本是亚洲国家，我非常珍视同亚洲邻国的交流。因此，我在就任首相之后，选择中国和韩国作为我首次出访的国家。”随后一下子就入了正题。“今天北朝鲜竟敢冒天下之大不韪，悍然进行核试验，是可忍，孰不可忍。我提议我们发表个共同声明以示抗议。”说完，他尽管听不懂韩文，但仍饶有兴趣地侧耳细听翻译将他的话翻译给卢武铉。安倍觉得很得意，他觉得这简直是上帝赐给他的良机，使他可以很轻松地绕过日韩之间那些沉重的话题，虽然如何应对北朝鲜的核试验，日韩之间还没有来得及协商，但是安倍觉得很有把握，卢武铉不会拒绝自己建议的，这样他就能先声夺人，先得一分。
“不，安倍先生，建构未来志向的关系，最大的课题是历史问题。”还没等翻译全部译完，卢武铉总统一下子就打断了安倍的话。“我们两国之间是有许多共同的课题。但是，我认为更重要的，也是到目前为止一直在妨碍我们两国关系的，仍是悬而未决的历史问题。参拜靖国神社、历史教科书、慰安妇等问题，是阻碍韩日关系的重要问题，只有解决好这些问题，才能开拓未来。”
听他这么一说，安倍首相也不便直接反驳，只好点点头，显得有点尴尬地应道：“卢总统所言正是，不过这些以前已经都交换过意见了。我们日本正视历史，继续走作为和平国家的道路，我国过去给亚洲各国人民造成了很多损害与痛苦并留下了伤痕。在对此深刻反省的基础上，日本走过了战后60年的步伐。这一心情是经历了过去60年的人们以及我的共同心情，这一心情今后也不会改变。”
“关于参拜靖国神社，我想向卢总统说明一下我的想法，首先我将不谈及是否参拜过靖国神社以及将来会不会参拜的问题，因为这一问题已经成为政治、外交方面的问题。我希望我们在此基础上，从克服政治困难的角度出发，妥善对待历史问题，促进两国健康地发展。”
“首先日韩之间最大的共同问题之一就是北朝鲜问题。今天我想向各位说明一下日本政府对于朝鲜问题的立场。日本与朝鲜之间存在着绑架问题、核与导弹等悬而未决的问题。另外，利用这个机会，我想重申一下我国在有关绑架问题上的立场，绑架问题是关系到我国国民生命安全和国家主权的重大问题。这一问题不解决便不可能与北朝鲜实现邦交正常化。根据这一方针，我们将利用日朝一揽子磋商和一切机会，强烈要求北朝鲜立即允许受害者回国，查清事实真相，引渡绑架实施犯，使绑架问题真正得以解决。”安倍首相继续谈道：“北朝鲜所进行的核试验，是对东亚以及国际社会的和平与安全的严重威胁、是绝对不能容忍的，应要求北朝鲜采取克制的态度。与此相关，我们还一致对10月6日安理会主席声明给予肯定。双方表示希望通过日中两国间的合作及两国与有关国家的合作，使北朝鲜无条件重返六方会谈，并且，我希望作为六方会谈成员国之一，韩方能做出更大的努力。不管怎样，关于北朝鲜的核试验问题，我们是绝不允许的，为此今后我们将进一步努力合作。我认为作出强烈表态，要求北朝鲜回应国际社会的要求，是非常重要的。”安倍首相非常强调这一点，卢武铉总统也表示：“朝鲜的核爆炸行为严重危害到东北亚的安全，也背叛了韩国人民的期望，这将影响南北关系。在国际社会要求制裁朝鲜的呼声中，韩国政府很难继续对朝鲜推行包容政策。韩国将和国际社会紧密合作，严厉处理朝鲜核爆炸问题。”
安倍首相与韩国总统卢武铉进行高峰会谈的时间比预定延长了一些，到5点多才结束。随后立即在青瓦台举行记者招待会，由安倍单独向日本及外国记者说明访韩的感想。在回答记者提问之前，安倍先就北朝鲜核试验发表意见说：“我和卢武铉总统一直认为，如果北朝鲜的核试验属实的话，这将是对日韩两国及其他周边各国安全的重大挑战。同时也是对国际和平与安全的重大威胁。我们绝对不能容忍北朝鲜进行核武器的开发和研制，必须以严肃的态度来对待这一问题。不容置疑的是，北朝鲜的核武将大大改变东亚地区安保环境，我们将进入一个更加危险的、新的核时代。”他以非常强烈的语气宣布：“日本政府立即开始研究对北朝鲜实施严厉制裁的措施。”尽管安倍首相周围的人都劝他讲话时尽量慢些，免得给人留下一个强硬的“鹰派”形象，但是，在首尔的记者招待会上，他已经顾不得那么多了。
记者会见结束后，安倍首相的访韩进入最后一个日程，出席了卢武铉总统主持的晚宴。晚宴后，安倍首相又到日本驻韩国大使馆官邸，与美国总统布什通了电话，两人一致认为“对北朝鲜的核爆炸，绝对不能容忍”。
安倍首相事后在他的博客网上表露，他只有在卢武铉总统主持的晚餐会上，才感受到心情真正地平静下来，可见这次高峰会谈谈得十分艰巨。而且会谈结束后，没有按日韩首脑会谈结束后由双方首脑一起举行新闻发布会的惯例举行发布会，也就充分说明了这次日韩首脑会谈的成果不理想。不少媒体对会谈能否取得实质进展表达了忧虑，韩国的《文化日报》在9日的报道中就预测，由于韩国总统把会谈重点放在历史问题上，而日本则重点想讨论朝鲜核试验，因此会谈后很可能不会像中日那样发表联合新闻公报。事实上，安倍访韩结束后，日韩确实没有发表联合公报。一位新闻发言人称：“总统并未说两国之间历史问题的分歧缩小了”，暗示两国在此问题上依然存在分歧。
在会谈结束后的另一个新闻发布会上，卢武铉表示，安倍在会晤中告诉他将会认真对待历史问题，并对日本过去的殖民统治给韩国等国造成的巨大损失和痛苦表示“反省”。卢武铉强调说：“参拜靖国神社、历史教科书、慰安妇等问题，是阻碍韩日关系的重要问题，只有解决好这些问题，才能开拓未来。”尽管如此，卢武铉总统还非常照顾客人的面子，在发布会上表示他已经与安倍达成共识，将在“适当”的时间访问日本。
晚上9点，日本政府专机载着安倍首相离开了韩国首都首尔机场，结束了闪电般的中韩之行返国日本。
