十一月癸亥（十四日），定远平寇大将军贝子章泰、征南大将军都统赖塔等奏：『十月初八日臣等统率满、汉官兵进薄云南省城下，并力环攻，贼势惶迫无措。二十八日夜，伪将军线緎、吴国柱、吴世吉、黄明、原任都统何进忠、原任巡抚林天擎等谋擒逆首吴世璠、郭壮图以献；吴世璠闻变自杀，郭壮图及其子郭宗汾自刎死。二十九日，线緎率众出城降，遂擒首谋献计之伪大学士方光琛及其子方学潜、侄方学范至军前磔之。戮吴世璠尸，传首京师。伪官弁一千五百八十余员、兵五千一百三十余名俱投诚：云南平』。得旨：『览贝子等奏，统领满、汉官兵遵奉成命恢复云南省城，疆宇荡平。具见筹划周详，调度有方，剿抚并用，克奏肤功；朕心深为嘉悦！着从优议叙具奏』。
十二月戊子（初九日），叙恢复海澄、厦门、金门十九寨功，授福建提督杨捷三等阿达哈哈番。
癸巳（十四日），召议政王大臣、大学士、学士、九卿、詹事、科道等官至干清门，命大学士勒德洪等传谕曰：『顷九卿等以大憝既除、寰宇底定，奏请上朕尊号。朕思曩者平南王尚可喜奏请回籍时，朕与阁臣面议，图海言断不可迁移；朕以三藩俱握兵柄，恐日久滋变，驯致不测，故决意撒回。不图吴三桂背恩反叛，天下骚动；伪檄一传，四方响应。八年之间，兵民交困。赖上天眷佑、祖宗福庇，逆贼荡平。倘复再延数年，百姓不几疲敝耶！忆尔时惟有莫洛、米斯翰、明珠、苏拜、塞克德等言应迁移，其余并未言迁移、吴三桂必致反叛也。议事之人至今尚多，试问当日曾有言吴三桂必反者否？及吴逆倡叛、四方扰乱，多有退而非毁，谓因迁移所致。若彼时朕诿过于人，将会议言应撤者尽行诛戮，则彼等含冤泉壤矣！朕素不肯诿过臣下，即令部院事有错误，朕亦自任。朕自少时以三藩势焰日炽，不可不撤；岂因吴三桂反叛，遂诿过于人耶！今乱贼虽已削平，而疮痍尚未全复；君臣宜益加修省，恤兵养民，布宣德化，务以廉洁为本，共致太平。若遂以为功德，崇上尊称，滥邀恩赏，实为可耻』！
康熙二十一年壬戌（一六八二）春正月戊辰（二十日），议政王大臣会议「逆贼耿精忠等分别凌迟处斩」具题。得旨：『耿精忠革去王爵，着即凌迟处死。其子耿显祚革去散秩大臣，着即处斩。徐文耀、王世瑜、白显中、江元勋、曾养性、王振邦、蒋得〈车宏〉、刘进忠，俱即凌迟处死。黄国瑞、林芳孙、廖廷云、李似桂、夏季旺、吕应斗、武灏、司定猷、沈伟、郭景汾、罗万里、祖宏勋、陈仪、陈斌、吕八，俱着即处斩。耿精忠、刘进忠首级，着枭示。田起蛟、金镜、李学诗、陈梦雷，俱从宽免死。内系旗人，给与伊本主为奴；系民，入官给披甲新满洲为奴。余如议』。
二月丙戌（初八日），调董国兴为福建巡抚。
辛卯（十三日），叙恢复海澄、厦门、金门功，给福建总督姚启圣拜他喇布勒哈番又一拖沙喇哈番。
夏四月甲午（十七日），先是，福建提督施琅奏：『贼〈舟宗〉久泊澎湖，悉力固守。当此冬、春之际，飓风时发，我舟骤难过洋。臣见在练习水师；又遣间谍通臣旧时部曲，使为内应。请俟明年三、四月间进兵，可获全胜』。上允之。至是，施琅奏：『夏至南风盛发，不可进兵；请至十月大举』。上命议政王大臣集议，佥谓师期不便屡迁，应檄总督姚启圣、提督施琅克期于夏至后进取台湾。得旨：『进剿海寇，关系重大。总督姚启圣、提督施琅身在地方，将海面形势，贼中情状审察确实，如有可破、可剿之机，着协谋合虑酌行剿抚，毋失机会』！
五且乙亥（二十八日），安塘笔帖式报称：『大兵进取台湾，以风大不得前；总督姚启圣尚驻铜山，提督施琅移泊云霄。闻海贼刘国轩等扼守澎湖诸隘，瞷我兵前进，即钞袭其后』。于是议政王大臣等会议：『请檄总督姚启圣、提督施琅：若目前风大，未便进剿，即统官兵回汛，整饬舟师，相机再举』。从之。
秋七月癸酉（二十八日），谕大学士等：『天道关于人事，彗星上见，政事必有阙失。其应行、应革者，令九卿、詹事、科道会议以闻』。于是尚书介山、侍郎沙赖、科尔坤等奏：请安插裁汰各省兵丁，令其得所。尚书魏象枢奏：请察裁兵中或有效力行间者，不令裁汰。尚书梁清标奏：今天下太平，凡事不宜开端，当以安静为主。左都御史徐元文奏：请暂停台湾进剿。侍郎杜臻奏：请全复浙省运丁裁扣钱粮。汉给事中、御史等奏：请潼关收税免差。少詹事及满给事中等奏：大同、宣府宜设满州官兵，则无田产满兵皆有裨益。上曰：『裁兵务使得所，慎勿汰及效力之人；另降谕旨。梁清标所言凡事不宜开端、当安静，甚得为治之要。近总督姚启圣奏称十月进剿台湾，可暂行停止；俟十月后再行定夺。复运丁钱粮及免差潼关收税，令各所司议奏。大同、宣府设满洲官兵事，宜令该部于议覆凯音布、噶尔泰等条奏时，一并确议以闻』。
八月壬寅（二十七日），福建总督姚启圣奏：『闽省有绿旗兵，又有汉军甲兵；进取台湾、防守地方，业已足用。大兵似宜撤回』。上命将军喇哈达等尽率福建大兵还京师。
冬十月己卯（初六日），福建提督施琅奏：『臣于水师营中简精兵二万余、战船三百艘，已足破灭海寇。请令督、抚赶办粮饷给臣军；而独任臣以讨贼，无拘时日。臣整理舟师，时加操练；但遇风利，即可进兵』。得旨：『进剿海寇，关系紧要。着该督、抚同心协力催趱粮饷，勿致迟误。前姚启圣具题「功罪定例」，交与施琅遵行。海寇固无能为，郑锦在时犹苟延抗拒；郑锦死，首寇既除，余党彼此稽疑、各不相下，众皆离心，乘此扑灭甚易。施琅相机自行进剿，极为合宜』。
丁酉（二十四日），兵部奏：『议叙应升京堂刑部郎中姚仪，奉有「才干素优，准改武职」之旨。查郎中与参领对品，参领既以总兵官用，郎中姚仪应授为都督佥事，以总兵官推用』。从之。
康熙二十二年癸亥（一六八三）春三月丙辰（十四日），以金鋐为福建巡抚（由督捕右侍郎迁）。
丁卯（二十五日），福建提督施琅奏：『进剿台湾，选派水陆官兵已足办贼。平阳总兵官朱天贵所部之兵，似不必更留福建，虚糜粮饷；请发回原汛』。议政王大臣议如所请。得旨：『提督施琅进剿台湾，深入海岛；朱天贵及原带官兵仍留福建，在后策应，听施琅调遣』。
夏四月己亥（二十七日），议政王大臣等会议：『都统喇哈达自到浙江，并不前进剿贼；及降谕严趣，方进衢州。闽省初定，又不能攻破海澄县贼众。功罪相抵，应革去都统及恩诏所得拜他喇布勒哈番佐领。其父兄之三等阿达哈哈番，与应袭之人承袭』。上曰：『喇哈达不能攻海澄贼众，以致贼众围困海澄；其后赖塔虽至，亦不能救援，情罪颇重。但随康亲王平闽有功，又历任年久，能胜都统职任，且多有劳绩；从宽降五级，留都统任并所袭阿达哈哈番，革去拜他喇布勒哈番佐领』。
五月甲子（二十三日），先是，福建总督姚启圣奏：『海贼刘国轩遣伪官黄学赍书至，请照琉球、高丽等外国例，称臣进贡，不薙发登岸；应否如所请，请旨定夺』。上曰：『台湾贼皆闽人，不得与琉球、高丽比。如果悔罪薙发归诚，该督、抚等遴选贤能官前往招抚。或贼闻知大兵进剿，计图缓兵，亦未可料。共审察确实，倘机有可乘，可令提督即遵前旨进兵』。至是，姚启圣奏：『遣福州副将黄朝用往谕刘国轩等，仍如前言』。上乃趣施琅速进兵。
闰六月戊午（十八日），福建总督姚启圣奏报：提督施琅进剿台湾，克取澎湖。
己巳（二十九日），福建水师提督施琅奏报：『台湾逆贼刘国轩知臣等将乘南风进剿，倾巢而来，坚守澎湖。凡沿海之处小船可以登岸者，尽筑短墙，安置腰铳。臣总统舟师，于六月十六日进发。署右营游击蓝理等以鸟船首先攻敌，时值潮水正发，前锋数船被贼围困；臣亲驾船冲入，杀退贼〈舟宗〉。兴化镇臣吴英继后夹攻，焚杀伪将军沈诚等大小贼目七十余员、贼兵三千余名。十八日，进取虎井、桶盘屿。二十二日，遣总兵官陈蟒、魏明等领船五十只为奇兵，直入鸡笼屿、四角山夹攻；又遣随征总兵官董义、康玉等驾船五十只为疑兵，直入牛心湾牵制。又将大鸟船五十六只居中，分为八队，每队驾船七只，各作三迭；留船八十只为后援。臣指挥督率直进扑剿，贼船齐出迎战。总兵林贤、朱天贵等继进夹击，自辰至申，我师奋不顾身，戮力杀贼，击沈大小贼船一百九十四只，焚杀伪官三百余员、贼兵一万二千有奇。刘国轩力不能支，乘快船从吼门潜遁。伪将军杨德等一百六十五员，率贼兵四千八百余名倒戈投降。是役也，以七日夜破数十年盘踞之贼。抵澎之后，海不扬波。进师之时，潮涨四尺，以佐成功：此皆皇上天威所致。至各将土戮力用命，督臣姚启圣亲来厦门、饷运不匮；并请议叙。又总兵官朱天贵、游击赵邦试阵亡，亦请优恤』。得旨：『据奏总统舟师、分配将士，将年久盘踞海逆深入进剿，屡次击败贼众，斩杀甚多，烧毁打沈贼船，克取澎湖，招降伪官兵丁，得获炮位等项：具见卿筹划周详、调度有方，官兵奋勇攻拔海洋险要重地，深为可嘉！在事有功人员，从优议叙。姚启圣亲至厦门弹压，殚心催攒粮运、鼓励将士克奏捷功，亦从优叙。朱天贵等，从优议恤』。
秋七月丙申（二十七日），「海逆」郑克塽遣伪官郑平英等赍降表至提督施琅军前，总督姚启圣转奏请颁赦招抚。上命撰敕发姚启圣同施琅酌行，敕曰：『皇帝敕谕郑克塽、刘国轩、冯锡范等：帝王抚御寰区，仁覆无外；即海隅日出之邦，无不欲其咸登衽席，共享升平。尔祖父自明季以来，出没海洋，盘踞岛屿；本朝定闽之后，尔祖郑成功窃据一隅，甘外王化。以及尔父郑锦，苟延岁月，假息偷生；句引奸徒，窥伺内地。屡经剿抚，仍执迷不悟，顽梗怙终。至尔年方童稚，惑于党类之言，妄思效尔前人，窜伏台湾，恃为窟穴；倚险负固，飘突靡常：以致沿海地方里闬不宁，时遭兵燹之厄。朕念中外兵民皆属赤子，何忍听其久罹兵灾，不加拯救！故特命提督施琅选将练兵，整饬战舰，扬帆进剿，直入大洋。旋据奏报，已克澎湖；尔抗拒大兵者歼灭殆尽，余众败遁台湾。目今舟师进剿，指日荡平。近据总督姚启圣奏：尔等具奏请降，又据来使呈乞恩赦。朕体上天好生之心，薄海内外，率俾安全。特颁敕旨，前往开谕。尔等果能悔过投诚、倾心向化，率所属伪官军民人等悉行登岸，将尔等从前抗违之罪，尽行赦免；仍从优叙录，加恩安插，务令得所。煌煌谕旨，炳如日星，朕不食言。倘仍怀疑畏、犹豫迁延，大兵一至，难免锋镝之危；倾灭身家，噬脐莫及！尔等其审图顺逆，善计保全，以副朕宥罪施仁至意』。
丁酉（二十八日），赠澎湖阵亡左都督平阳总兵官朱天贵太子少保，准一子为荫生。
八月壬子（十三日），福建水师提督施琅奏：『七月十五日，郑克塽遣伪官冯锡珪等，伪侯刘国轩、伪伯冯锡范遣其弟伪副使刘国昌、冯锡韩等赍降表文稿诣臣军前，请缴伪册印，率众登岸，以求安插。臣随遣侍卫吴启爵、笔帖式常在同冯锡珪等持榜示往台湾晓谕伪官兵民，验视薙发；即令郑克塽等缮写降表，并伪册印一并赍送，以便代奏。至台湾虽在海外，地方千余里、户口数十万；或弃、或守，伏候上裁』。得旨：『海洋远徼，尽入版图；积年逋寇，悉皆向化：具见卿筹划周详、剿抚并用，克奏肤功，朕心深为嘉悦！在事有功人员，该部一并从优议叙；余令议政王大臣会议以闻』。寻议：『台湾应弃、应守，俟郑克塽等率众登岸，令侍郎苏拜与该督、抚、提督会同酌议具奏』。从之。
戊辰（二十九日），福建水师提督施琅奏：『臣于八月十一日，率领官兵自澎湖进发；十三日，入鹿耳门，至台湾。十八日，郑克塽及文武官俱已薙发；宣读敕诏，郑克塽等欢呼踊跃，望阙叩头谢恩。所有郑成功之子伪辅政公郑聪等六人，郑锦之子郑克塽及其弟伪恭谨侯郑克塽等九人，伪武平侯刘国轩、伪忠诚伯冯锡范等子弟及明裔朱桓等十七人，并续顺公下官兵家口、海澄公家口，俱拨船配载，官兵陆续护送，移入内地；并移咨侍郎苏拜及督，抚，听其安插。其余伪文武各官家口，见在趣令起行；兵丁有愿入伍及归农者，听其自便。至于江浙、闽、粤各省被获男妇，臣仰体皇仁，已悉令回籍。其册印、扎付，已次第追缴；仓库人民户口册籍、船艘军器，俱令巡海道线一信等察收』。下所司知之。
