在徐云飞的激励下，将士们完成了对鬼子兵的围剿。徐云飞也因此名震天下，成为当朝炙手可热的年轻一代将领的佼佼者。
万历五年，徐云飞受到宰相张居正的接见谈话。两宫太后在一旁垂帘听取两人的密谈。对徐云飞的才识大加赞赏。
完事后，叔大跟李太后仔细商议了一阵，决定提携徐云飞，让他成为万历的心腹。徐云飞对此并没有任何的异议。
随后的五年时间里，徐云飞励精图治，爱兵如子，终于训练处了自己的徐家军。在当时跟戚继光的戚家军名声相当。
1582年明神宗万历十年张居正因病去世。历史的车轮还是照着原来的轨迹行驶。徐云飞很清楚叔大死后的一系列变故。所以，他早就跟宰相大人划清了界线。在后来的大清洗中，徐云飞并没有受到牵连。
1587年明神宗万历十五年，徐云飞前世所崇拜的偶像海瑞死于南京右都御史任，人民为之罢市致哀。徐云飞也暗中派人送了花圈，以表通信。
1592年明神宗万历二十年宁夏之役起。二月，拜据城反，徐云飞作为明朝兵马大元帅，亲自率兵前去镇压。在现代战略思想的引导下，大军以微薄的伤亡换取了巨大的胜利。同年五月日本关白丰臣秀吉侵朝鲜。徐云飞亲率大军赴援，次年收复平壤、开城，进攻王京，日军弃王京，退据釜山。徐云飞随即撤主力回国庆功。
1596年明神宗万历二十四年。徐云飞跟圣王、圣子十万大军决战于滇西，并且大获全胜。
夜晚，身为俘虏的圣王、圣子对徐云飞破口大骂，并且揭露他的身世。可惜无一人相信。
次日，失踪数年的圣女黛滢求情，徐云飞念及旧情留下圣王的性命，只是杀死了圣子。黛滢跟徐云飞面对面的交谈之后，终于向着对方敞开了心扉。两个有情终于结成连理。
1600年明神宗万历二十八年播州杨应龙作乱多年，时任明朝兵马大元帅，秦国公的徐云飞再次亲率大军平乱。数月后平息叛乱，被万历封为一字并肩王，其权利之盛，恒古未有。
大明天下，因为徐云飞的灵魂穿越，彻底改写了悲惨的命运。迅速跻身为世界强过之列。
