盖伦将吴老师对猴哥的理解注入到悟空体内后战斗结束了，但天空却响起了卡尔萨斯的声音，听到他的邀请人们产生了动摇，而莫甘娜也开始了行动。
成长起来的学员们都能够独当一面，而盖伦也当上了新兵班的班长，一本正经的招募阿狸和给女兵们训话，而超神学院的基地现在设立在了海上的巨峡号上，他们也配备了精良的设备。
凯尔受到卡尔萨斯的怂恿前往地球，她的到来不知会带给人类恩赐还是灾难。当超神学院的众人和往常一样训练时警报响了，巨峡号的数据库被入侵，而莫甘娜准备动用核武器来摧毁巨峡号。
卡尔萨斯那晚的宣言让嘉文无法忘记，因为蕾娜的爷爷很可能就是毁灭德诺星系的罪魁祸首。手持闪电戟的恶魔小队开始实行抢夺核弹的计划，探测到的巨峡号立刻展开救援，德班紧急出动。
信爷来到战场就被狙击，对方的狙击手装备了弑神一号装甲弹，这对于盖伦等人非常危险。与此同时，蕾娜带领的女神队正赶往救援装载核弹的运输车。
对战恶魔的雄兵连损失惨重，棘手的闪电戟好不容易被盖伦破坏，但逃走的恶魔却拥有莫甘娜的能力，眼看飞机就要遭到破坏，而前来援助的竟是齐天大圣孙悟空。
超级战士又纳新了，这次来到女神组的是蔚，曾是警察的蔚和大D有私仇，而大D也对自己做过的事情悔恨不已。与大D是朋友的瑞文看不下去了，两个女汉子在巨峡号上打了起来。
蕾娜的爷爷毁灭德诺星系的恶魔缠绕着嘉文，而蕾娜不停的做着嘉文侮辱自己的恶梦，两人直接的猜疑越来越大，而这一切都是莫甘娜的阴谋，梦魇正在侵蚀他们的信念。
大天使凯尔的降临伴随着天地异变，在搜索到莫甘娜坐标后凯尔立即准备施行大审判，而狡诈的莫甘娜将女王号开至巨峡市上方，如果现在发动审判将会牺牲超过百万的人民。
凯尔的大审判蓄势待发，而听到莫甘娜蛊惑的众人情绪都很不稳定，看到这种情况凯尔只能暂时作罢，但这次的事件却让嘉文和蕾娜消除了隔阂。
天使彦找到了超级战士们，弗雷尔卓德星系文明遭到了破坏，这是莫甘娜历练的阿克托斯所为。盖伦即将与彦一起拯救弗雷尔卓德，而与卡尔萨斯勾结的莫甘娜得到了自己的战队群。
和彦一起来到弗雷尔卓德的葛小伦看到的是一片狼藉，忍受恶魔肆虐的人们正等待着他们的到来。与此同时，地球上超级战士们和莫甘娜的战斗也打响了。
葛小伦和彦为了救助弗雷尔卓德继续战斗，而留守监视卡尔萨斯的天使炙心遭到了袭击，莫甘娜与超极战士们的战斗也正式打响了，这个世界将要何去何从。
与莫甘娜的正式交锋让超级战士们损失严重，杜卡奥遭到了狙击生死不明，负责远程治疗的琴女已被掳走，被敌人控制的曙光女神随时都有可能释放出毁灭世界的能量，前去寻找孙悟空的苏小狸又遭到了攻击，这一切难道预示着末日的降临？
卡尔召唤两个巨大机甲与莫甘娜联手弑神凯莎。蕾娜仍被莫甘娜控制，耀文和士兵的不舍之情。莫甘娜开启了蕾娜的中型耀斑轰炸，耀文召唤出巨大的手拖住巨侠号，链条状的石头将船只围住，同时另一只手将蕾娜脱离巨侠号上空。莫甘娜打算用蕾娜来引爆翡翠星。翡翠星产生的能量会将凯莎炸成无数个神圣原子，通过大时钟讲凯莎的原子送至不同的时代。如果凯莎的原子能再定位重组的话最少也要三亿年。大D和萌萌在山洞躲避防御黑暗士兵。莫甘娜此时又想贿赂大D，被大D一口拒绝，莫甘娜和卡尔的阴谋能否成功也是个未知数。弗雷著星系那里，从天使彦的话里我们得知葛小伦他们已经和剑魔阿托交过手。阿托带着莫甘娜的号令之剑组建他的恶魔大军。天使彦向葛小伦介绍了天使下凡隐匿翅膀便又是埋下伏笔。而在节目的结尾也是添加了精彩剧组漫画短片。
弗雷卓星系彦和葛小伦第二次听到艾妮的祈祷，并在祈祷中得知新角色暴风战士，而彦说1000年后葛小伦是她的，凯莎那边聊天说炙心和赵信很配，接着莫甘娜来天使之城宣战凯莎，然而她并不是凯莎的对手，她只是在配合死神卡尔完成弑神，天使战斗的时候有提起冷左翼(新角色)，正在两神激烈交战的时候卡尔召唤了大虫洞将凯莎送至翡翠星，接着引爆了翡翠星，所有天使在爆炸时与凯莎断线从天上掉下，炙心和彦也不例外，而正在这时也就是彦最虚弱的时候剑魔来宣战葛小伦他们。地球，野狼特战队成功营救琪琳，片尾介绍了彦的手办，虽然还没有完成上色但是也快了，一起期待吧！
?在琪琳的掩护下，野狼特战队救出了大D等人。莫甘娜决心干掉彦，大战即将展开......
彦与阿托在天上开战，地面上的葛小伦却帮不了忙，阿托先是干掉了葛小伦并抢到破解了他的剑，接着彦被葛小伦的武器打败，在临走前彦与刚逃走的炙心通话说让她守护自己的男神赵信，接着一股力量从彦的身体飘出使倒下的葛小伦长出翅膀飞到一片荒野，阿托跟着来了正要将葛小伦大卸八块的时候蕾娜出现吓跑了阿托，并对着昏迷的葛小伦说他回不去了。
沉睡了很久，巨峡战役爆发了，地球全面战争爆发了。直到苏醒，大地已经不再是原来的样子。但华夏的战士们仍然艰苦作战，令小伦感到愧疚。直到他们遭遇了恶魔的袭击。地球已经是一个恶魔的衍生之地。各地战事风起云涌。雄兵连的超级战士们开始组织各地战役。
赵信被转送到了不知名的地方，在河边洗了把脸回到树林，天上掉下个受伤的天使问他“你是赵信么”“我是坑比”赵信惊呀后自责记得的失误。交谈得知天使名为炙心，是要来和他合体，增强他的基因。但赵信不信，后遇到普通战士和恶魔的战斗，战而胜之，战斗结束纷纷自责自己的过失。最后决定前往首都北之星赎罪。
赵信炙心一伙人去北之星的路上到了通湖镇，遇到了卡尔的虚空战士，赵信不敌，炙心使用虚空战士能力（炙心本身也是虚空战士）增强了赵信的基因，毁灭了虚空战士，后相遇小伦，炙心告诉小伦，有一个天使在未来等他。
