“那黄飞虎造反，你们居然一点儿都不知道！？都是聋子瞎子啊？”魔军大营中，撒旦气急败坏地说。
此役，魔军后撤100里，才收住阵脚。部队被义军的骑兵和战车斩杀无数，可谓损失惨重。大家都沉默不语，席琳献策说：“赵公明虽然阵亡，可其余七部鬼帅尚在，他们各领鬼兵亿万，可以布下瘟疫和疾病。撒旦一听，这才高兴了：“我要让伊甸城变成人间地狱！”他哈哈大笑，那声音疯狂恐怖，令人毛骨悚然。可这是魔兵们的最爱，他们一齐振臂高呼：“撒旦！撒旦！”
撒旦开始发布命令：“刘元达、张伯元、钟子季、史文业、范巨卿、姚公和李公仲七部鬼帅听令！我命你们即刻出发，到伊甸城和敌军大营布下灾祸，让他们尝尝我们的厉害！”众魔头及魔兵又高呼：“撒旦！撒旦！”
这七部鬼帅点齐鬼兵，向伊甸城蜂拥而去。刘元达领鬼兵施杂病，张伯元领鬼行瘟疫，钟子季施人间以疮肿，史文业行寒疾，范巨卿行酸瘠，姚公行五毒，李公仲行狂魅赤眼，降下了众多灾祸疾病。而这一切，都是在夜深人静时，悄然地进行。伊甸城的军民，都一无所知，被统统蒙在了鼓里。
直到瘴烟四起、浓雾弥漫，伏羲才渐渐感觉到情况不妙。义军中开始出现各种各样古怪的病，并流传开来。军医们绞尽脑汁，穷尽一切办法，也无法治愈他们。伏羲连忙到伊甸城中巡视，发现事情没那么简单，已经到了无法控制的局面。
街头巷尾空无一人，到处都是老鼠和蟑螂，空气中充满了难闻的气味，地上污水横流、浑浊不堪。
伏羲喊来值守官员问道：“伊甸城怎么变成了这样？为何不派人打扫街道，清除垃圾？”值守官员似乎也患上了重病，他咳嗽着说：“昊王，城中军民差不多都患上了严重疾病，这个城市已经无法正常运转了！”
伏羲与盘古通神，盘古说：“病是撒旦使的坏，他指使七部鬼王降下灾病，罪魁祸首还是他！”“大哥，那现在我该怎么办呢？”“治病容易，你去神农那里要个方子，让嫦娥取药捣碎，制成药水分与军民，就可以了。可是鬼王不除，病就不可能根治。”“那谁能降伏鬼王呢？”“当然是你的兄弟轩辕！”
伏羲一听，终于明白了。他驾起神鹰，先去找神农，这神农是一位神奇人物，他母亲在梦中感受到龙气，怀孕后生下了他。据说他长着人的身躯，却有牛的脑袋，出生后3天就会说话，5天就会走路，7天就长出了牙齿，长大后，他身材高大，将近3米。后来他向宇神请教医术，得到一本书。读了这本书，他就理解了人的病因。于是，他派人到各地去采集药材，然后亲自品尝是否有毒，用自己的身体做实验。就这样，他尝遍了百草，获得了神通，得以长生不老，能包治百病。他还发明了蜡烛，后来被尊为照明之神。他是用药治病的鼻祖；伏羲还教他发明刀耕火种，创造了两种翻土农具，教人民垦荒，种植粮食作物；他还领导部落人民制造出了饮食用的陶器和炊具。
最后，伏羲与他和轩辕结拜，成为异姓兄弟，被尊为三皇。轩辕也是天地灵气的产物，他一生下来，就显得异常神灵。生下没多久，便能说话；到了15岁，已经无所不通。
伏羲作为老大，既是哥哥，又是老师，还帮他们打赢了战争。从前，蚩尤族联合巨人夸父和三苗一部，击败了神农，占据九州。为了维持生存，神农向哥哥伏羲和兄弟轩辕求援。轩辕正想把势力向九州扩展，欣然答应。伏羲那时正在楼兰，远水解不了近渴。这样，轩辕便同蚩尤在涿鹿遭遇了。
这蚩尤可不是一般人，他有八只脚，三头六臂，铜头铁额，刀枪不入。他与神农长得颇像，面如牛首，背生双翅，善使刀、斧、戈作战，不死不休，勇猛无比，被誉为东方战神。
轩辕一看打不过他，请伏羲助其破之。伏羲设下八卦阵，并与神鹰合体，啄断了蚩尤的翅膀，使他不能飞行。这一仗直杀得天昏地暗，血流成河。蚩尤有兄弟81人，号称是提坦巨人的后裔。这81人全都是兽身人面，铜头铁额，不含五谷，只吃河石。他们不服从法令，残害黎庶，诛杀无辜。又制造兵杖刀载大弩，与轩辕为敌。轩辕曾征召各路诸侯讨伐蚩尤。历时十五载，也未能打败蚩尤，只好退兵。
此战，他请伏羲辅佐他，以灭蚩尤。有一天晚上，他梦见大风吹走了天下的尘埃。接着又梦见一个人手执千钧之弩驱羊数万群。醒来后，心觉奇怪。暗想，风，号令而为主；垢，是土解化清，天下难道有姓风名后的人吗？千钧之弩，是希望为能致远，驱羊数万群，是牧人为善，难道有姓力名牧的人不成？于是便派部下到处访寻这两人。结果在海隅找到了风神波塞冬他，在东方的名字就叫风后，在泽边找到了后羿，后羿在东方的名字就是力牧。
于是，轩辕以伏羲和神农为军师，以波塞冬和后羿为将，开始大举进攻蚩尤。在涿鹿郊野，两军摆开阵势，大战一触即发。蚩尤布下百里大雾，三日三夜不散，至使兵士辨不清方向。轩辕便请风神波塞冬驾驶战车在前方吹开迷雾引路。与此同时，宙神也派九天玄女和嫦娥前来助战。后羿一见嫦娥，战力迅速增加一倍。
如此，在冀州又重新开战。蚩尤也很神通，他请席琳召唤雷神，请孟姜召唤雨神，请共工蓄水以攻。伏羲升起八卦挡住雷电和天雨，又与共工通神，共工一看是二哥的把兄弟，立刻撤回了洪水。最后，轩辕杀死了蚩尤，但蚩尤有不死之身，所以分尸葬于四处，三头、六臂、八脚、身体各埋一处，使之不得完尸。
后来，神农与轩辕称霸于九州。他们用周鸟鹗、鹰颤为旗帜，以熊黑虎豹为前驱，打败了所有对手。又派兵征伐各方不肯巨服的诸侯。历经52战，得以称霸九州一方。
