万历二十五年春正月十一日，朝鲜使臣请求帮助。二月丙寅，再商议讨伐倭寇。丙子，前备倭都督同知麻贵担任总兵官，统一南北诸军。三月乙巳，山东右参政杨镐担任佥都御史，经略朝鲜军务。
自己不，兵部侍郎邢担任尚书，总督蓟、辽、保定军务，经略御倭。夏六月十九日，皇极、中极、建极三殿火灾。癸未，罢修国史。秋七月癸巳日，诫谕群臣。丁酉，下诏赦免天下。
这个月，杨应龙反叛，攻占合江、綦江。八月丁丑日，倭寇攻破朝鲜闲山，于是逼近南原，副总兵杨元弃城逃走，倭寇逼近王京。甲申，京师地震。九月二十四日，逮捕前兵部尚书石星入狱，论死刑。
冬十月十七日，安南黎只有潭篡位自立，敲门请求罪，下诏授为安南都统使。这一年，琉球入朝进贡。
万历二十六年春正月，官军攻击蔚山倭寇，没有成功，杨镐、麻贵逃奔王京。
三月癸卯，赐赵秉忠等进士及第、出身不等。壬子日，群臣到文华门奏请皇长子成年，不允许。夏季四月丁卯日，辽东总兵官李如松出塞，遇伏战死。壬申，京都洛阳发生旱灾，命令修身反省。
六月丁巳，杨镐被免职。戊午，中官李敬广东采集珠宝。丙寅，张位罢。丙子，巡抚天津佥都御史万世德经略朝鲜。秋七月丙戌，中官鲁保出卖两淮余盐。
八月丁丑日，京师地震。九月二十四日，免浙江遭灾地区的田租。冬季十月乙卯日，总兵官刘缝、麻贵分兵抗击倭寇，失败的。董一元攻击新寨倭寇，失败。
十一月十七日，蔚山倭寇放弃逃跑，官军分道进攻。十二月，总兵官陈瞒在乙山打败倭寇，朝鲜平。这一年，乌斯藏入朝进贡。
万历二十七年二月三日，分别派遣宦官兼任浙江、福建、广东市舶司。这个月，贵州巡抚江东之派兵讨伐杨应龙，失败了。
三月二十四日，前兵部侍郎李化龙总督四川、湖广、贵州军务，讨伐杨应龙。夏季四月甲戌，驾临午门，接受倭寇俘虏。这个月，临清百姓改变，焚烧税使马堂热，杀死他的随从三十四人。
闰正月丙戌日，因为倭寇平定，下诏天下，任东征加派田赋。己丑，长时间干旱，命令修身反省。丙申日，因为各位皇子结婚，下诏取太仓银二千四百万两。
户部匮乏，命令严格考核天下储蓄。六月己亥日，杨应龙攻陷綦江，参将房嘉宠、游击张良贤战死。秋八月十四日，陕西狄道县发生山崩。九月，土蛮进犯锦州。冬季十月壬午，贩济京城饥民。
丙戌，因播州用兵，对四川、湖广田赋。戊子，贵州宣慰使安疆臣犯罪，下诏讨贼赎罪。十一月十八日，免河南遭灾地区的田租。癸酉，赈济畿辅及凤阳等地发生。
十二月十六日，武昌、汉阳百姓改变，打伤税使陈奉。戊子，赈济京师流民。这一年，琉球入朝进贡。
万历二十八年春二月十八日，京师地震。丙戌，李化龙率师分八路进军讨伐播州。夏季，六月十六日，攻克海龙囤，杨应龙自编而死，播州平。秋季七月辛亥日，干旱，命令修身反省。
八月初四日，慈庆宫成。丙子，撤除朝鲜守兵。九月甲寅日，停刑。这是秋季，炒花进犯辽东，副总兵解生等人失败。冬十月辛没有，贵州皮林苗叛乱，总兵官陈瞒讨伐的。丙子，云南税监杨荣开采阿瓦、孟密宝井。
十二月乙末日，驾临午门，受播州俘虏。这一年，两畿各省灾伤，民饥盗起，内外群臣纷纷上奏章请求罢除矿税监，都不允许。大西洋人利玛窦进献方物。
万历二十九年春正月二十一日，因播州平，下诏天下，免除四川、贵州、湖广、云南加派的田租赋税，授官民牵连之罪。这个月，皮林苗贼平定。二月甲戌日，赈救大同、宣府饥荒。
三月乙卯日，赐封张以诚等人为进士及第、出身不等。这个月，武昌百姓改变，杀掉税监陈奉随从六人，焚毁巡抚公署。
夏四月乙酉，召回陈奉，以守备承天中官杜茂替代的。五月，苏州民变，杀掉织造中官孙隆随从数人。六月，北京自去年六月不降雨，到这个月乙亥开始下雨。山东、山西、河南都大旱。
丁亥，法官奏请热审，不报。这个夏天，赈济畿内饥荒。秋九月十一日，黄河在开封、归德。
丁未，赵志皋死去。癸丑，振兴贵州饥荒。戊午，前礼部尚书沈鲤、朱赓同时兼任东阁大学士，参与机要事务。冬十月十五日，立皇长子朱常洛为皇太子，封儿子福王朱常洵，瑞王朱常浩，惠王朱常润，桂王朱常瀛。
下诏赦免天下。壬辰，加上慈圣皇太后尊号。十二月辛未，下诏恢复朵颜马市。这一年，琉球入朝进贡。三十年春正月二十一日，因各地灾情命令修身反省。
二月己卯，不适，召见大学士沈一贯在启样宫，命罢矿税，停止织造，释放囚犯，恢复建言诸臣职务。第二天，病情好转，睡觉前诏。甲申，重建乾清、坤宁二宫。
闰月丙申，恢复河套诸部进贡交易。戊午，河州黄河枯竭。三月五日，腾越民变，杀死税监委官。夏四月十六日，赈济顺天、永平饥荒。五月乙亥，法官奏请热审，不报。秋季七月辛巳日，边防军饷缺，命令严厉催促拖欠。
这个月，缅军攻陷蛮莫宣抚司，宣抚思正跑回腾越，敌人追赶到，有司把正以感谢敌人，开始解。冬十月二十日，赈济江北灾害。丙辰，停刑。这一年，琉球、哈密入朝进贡。
万历三十一年春三月戊午，吏部上奏天下郡守网员，不报。这个月，播州余贼吴洪等人叛乱，有司讨伐平定了他。夏四月丁亥初一，天上日食忽氟。五月丙辰，内阁大臣奏请热审，不报之。
戊寅，京师地震。凤阳降大雨冰雹，诋毁皇帝陵殿脊。这个夏天，黄河在苏家庄，北逐渐丰、沛、鱼台、单县。秋九月十一日，江北盗贼兴起。
冬季，十月十六日，停刑。丙申日，睢州贼杨思敬作乱，有司讨伐并擒获了。十一月甲子日，获得妖书，宣帝想换太子，诏令五大搜索。十二月丙戌日，召见皇太子在启样宫，赐敕令安慰。
万历三十二年春二月二十一日，内阁大臣请求补任司道郡守和派遣巡按御史，不报。三月甲子日，乾清宫建成。乙丑，赐封杨守勤等人为进士及第、出身不等。夏四月辛巳初一，天上日食忽氟。
这个月，疏通洳河工程竣工。五月二十日，雷火焚毁长陵明楼。六月丙戌日，以陵灾害，命补网官恤刑狱。丁酉，昌平大水，坏长、泰、康、昭四陵石梁。
秋季七月庚戌，京城大降，毁坏城垣。辛酉日，救济遭受水灾居民。八月辛丑，群臣伏在文华门，上疏奏请修举实政，降旨督促。丙午，完成黄河分水工程。
九月戊申，赈济畿南六府饥荒。闰月辛丑，武昌宗人蕴较等人叛乱，杀巡抚都御史赵可怀。冬季十月甲寅，开始叙述平定播州之功。这一年，琉球、乌斯藏入朝进贡。
万历三十三年春正月，重新修复京师外城。庚辰，银定、歹成侵犯镇番，总兵官达云将失败的。夏四月十八日，蕴较等人被杀。五月丙申，凤阳大风雨，毁坏陵殿神座。庚子，雷击圜丘望灯高杆。
六月乙巳，因雷击，命令修身反省。秋八月二十八日，停刑。（僖公三十年）九月十日，昭和殿发生火灾。丙申日，京城地震。冬十一月十一日，免除淮阳遭灾地区的田租。
十二月壬寅，下诏罢除天下开矿。以税务归有关部门，每年交纳所进入的一半于内府，半户、工二部。丙午，免河南遭灾地区的田租。
乙卯日，以皇长孙出生，下诏赦免天下。开宗室科举入仕制度。停止开采广东珠池、云南宝井。
万历三十四年春二月十一日，加上了皇太后的徽号。
辛亥，大学士沈鲤、朱赓奏请补充六部主要官员，不报。三月二十四日，云南人杀掉税监杨荣，焚烧他的尸体。丁酉，真定、顺德、广平、大名灾害，赈济不等。夏四月癸亥，完成朱旺口黄河疏通工程。五月二十日，河套部进犯延绥，官军打退了。
六月癸卯日，缅甸攻陷木邦。这个月，畿内蝗灾大起。秋七月二十日，沈一贯、沈鲤辞官。（僖公三十年）九月十日，下诏陕西严厉敕令边防。冬季，十月十六日，停刑。十一月己巳，朵颜来犯，总兵官姜显漠领兵击退了。
十二月壬子，南京妖贼刘天绪谋反，事情败露被处死。这一年，安南、琉球入朝进贡。蒙古喀尔喀各部归附到了满清那里了。
万历三十五年正月辛末日，给事中翁宪样说，巡抚、按察使官解职应该等候命令，不应该让他自己去，不报。二月戊戌日，安南贼人武德成进犯云南，总兵官沐睿击退了。
三月十四日，赐封黄士俊等进士及第、出身不等。夏四月戊戌，银定、歹成侵犯凉州，副总兵柴国柱将走的。壬子日，顺义王撦力克死。五月二十日，前礼部尚书于慎行及礼部侍郎李廷机、南京吏部侍郎叶向高一同担任礼部尚书兼东阁大学士，参与机要事务。
六月，湖广以及徽、宁、太平、严州水灾。闰月辛巳，恢复河套诸部进贡交易。秋七月二十七日，京城久雨。刑部请求发热审疏，不报。八月丙寅日，赈济畿内饥荒。九月甲午，停刑。
冬十月癸酉日，山东大旱饥荒，赈济不等。十一月壬子日，于慎行死去。十二月，金沙江蛮阿克叛乱，攻陷武定，围攻云南，别陷入嵩明、禄丰。安南贼兵进犯钦州。这一年，琉球入朝进贡。
万历三十六年春正月，河南、江北饥荒。二月戊辰日，京师地震。六月十五日，南畿水灾。秋七月丁酉，京师地震。
郴州矿贼大起。八月癸亥日，研究云南失事有罪之臣，巡抚都御史陈用宾、总兵官淞监狱，论死刑。庚辰，赈济南畿及嘉兴、湖州饥荒。（僖公三十年）九月十日，四川巡抚都御史乔宝星奏在东川擒获阿克，贼寇平定。
十一月二十七日，朱赓死去。十二月戊午，再次赈济南畿，免除税粮。这一年，琉球入朝进贡。
