这是一个人类与神奇宝贝一起生活的世界……
在远处的天边，发出一声巨响，一个神奇宝贝，从那片爆炸声中飞出，掉落在了，真新镇旁边的树林里，此时此刻，真新镇的大木博士，正带着新一代男孩们，正在树林里闯荡。
“是，神奇宝贝啊！”一个活动的男孩拨开一丛草丛，惊奇的叫道，“别跑啊！”看到人类的神奇宝贝当场就跑向树林深处了，小男孩没有考虑后果，直接离开队伍，也跟着神奇宝贝向着树林的深处跑去了。
“可恶，人类竟然能制造出伤害如此之大的，大范围武器，”这只神奇宝贝，就是刚刚从天上掉下来的，他曾经见识过人类可怕，将自己从远古的岁月里唤醒，并对自己进行改造，但唯一幸运的是，自己从那可怕的实验室里逃了出来。
之后，受伤的超梦被神奇宝贝们所救，然后一直在这个世界上帮助着神奇宝贝，他就是超梦，超梦受到中创的之后依靠在树林中的一课大树下，进行调整。
就在此时，在一旁的草丛中突然传出“沙沙……”的声音，一只神奇宝贝和一个小男孩突然从草丛里钻出，出现在他的眼前。
小男孩看到浑身是伤的超梦呆住了，在他旁边的神奇宝贝，却一下子害怕起来了，向着前面的草丛里冲去，小男孩一下子就冲了过去。
因为，在此之前，他就已经听大木博士说过，在树林的深处有一条悬崖，警告过我们，不要靠近，但现在，他已经知道在那一堆草丛的后面是什么了——悬崖！
小男孩想都没想就冲了过去，就在那只神奇宝贝快要掉下去的一瞬间里小男孩竟用身体将那只神奇宝贝护住了，紧抱在自己的胸前。
一只神奇宝贝，一个人，俩人竟同时从悬崖上掉了下去，刚刚发生的一幕都被超梦看在了眼里，超梦竟脱着受伤的身体，向着悬崖下飞去了，就在一瞬间，奇迹发生了，一道强光从悬崖下散发出来……
“铃铃铃……”一阵吵闹的闹钟声突然响起，打破了这一清早的宁静，天也只是微微露出的光亮，躺在床上的小男孩，哦，不应该已经算的上是少年了，这名少年叫作小智，也同样是来自于真新镇，没错就是刚刚那个小男孩，不过，他并不是我们所认识的小智，他将会在今天，得到属于自己的第一只神奇宝贝，踏上自己的旅行，开创属于他的精灵宝可梦大师之梦！
“今天起的挺早的，”小智坐在床上说道。
“我看你每天都是这么早，你已经决定好今天要选那只神奇宝贝了吗？”在小智的脑海中突然出现这样一句话，进入耳朵，那就是超梦。
小智本身并不知道自己当年发生了什么，他只知道是超梦救了他，他也因此迫不得已，待在了小智的身体里。
现在，他可以和超梦随便的沟通，以至于有时会被认为是在自言自语，因为别人听不见超梦说话，一开始小智能听到超梦说话，对此还是很害怕和惊吓的，随着时间的流失，他已经对此早以习惯以常。
