定下了方舟计划之后，医院骑士团在南美洲的领地的开发与扩张便成为了重点工作。
考虑到骑士团已经在哥伦比亚海岸站稳脚跟，而居住在安第斯高山与谷地之间的穆伊斯卡人甚至坐拥丰富的宝藏而不自知，那么应当扩张的方向显而易见了。
在那之前，大团长马库斯事先规划了多项举措：罗德岛的居民主动跟随移民南美洲的，将奖励一片土地与金银珠宝！
罗德岛的海盗船再次出发之后，除了抢钱，他们这一次还有了新的任务：帮助不愿受土耳其人统治的希腊人偷渡离开，坐上医院骑士团的船只，迁徙去往广阔的新大陆！
就这样，迦太基城在数年之间变得无尽繁华，数不尽的人口从希腊地区飘洋而来，为了新的生活，每个人都勤劳开拓，繁华的商港与千亩良田都将不再是设想，而是渐渐成为了现实。
“我想……我们在南美洲的领地应该有个新名字了。”骑士团核心会议上，已经老迈的马库斯说道。
很快许多的方案被呈了上来，老团长看着名单，缓缓点头。
一个简单、直白而又具备充分情怀的完美名字被马库斯选中：新耶路撒冷。
圣地耶路撒冷，那是代表着骑士团历史的地方，那是基督徒们所向往的朝圣地，如今我们虽不能收复圣地重建耶路撒冷王国，但我们有了新的应许之地！
这个时候，有骑士向马库斯提议，如今时代变化，既然要建立“新耶路撒冷王国”，那么是否应当改建封建王国，由马库斯的家族世袭王位？
马库斯听罢，眉头紧锁，将那人怒斥一番。
“骑士团可是罗德岛与新耶路撒冷人民的先锋队，是真正无愧于统治者角色的精英团队，骑士们，包括大团长，都是来自于人民又服务于人民的角色，岂是那些王侯将相所能比的？！”
说罢，马库斯还立下规矩：罗德岛与新耶路撒冷将永远坚持骑士团的领导，没有任何家族能够篡夺统治者的位置！
听了马库斯激昂的话语，骑士们纷纷心悦诚服地跪拜下来，表示一定会坚持大团长定下的铁律。
完成所有这些工作之后，马库斯这才安心地见上帝去了。
按照马库斯的遗愿，骑士团正式迁都新耶路撒冷的迦太基，罗德岛故地反而成为了遥远的飞地。为了缓解当地罗德岛移民的思乡之情，骑士团将新殖民的牙买加岛起名为“新罗德岛”，也因此吸引了大批希腊百姓迁居该地。
接下来的数任团长，都继续大力推进方舟计划，新耶路撒冷不断地扩张着，当地的人们已经开始浮躁起来，叫嚣着要将那“黄金国”征讨下来！
1575年，医院骑士团正式向穆伊斯卡人宣战，那美洲原住民哪里是欧洲人的对手，仅一年时间，穆伊斯卡人便不得不向医院骑士团割走以通哈（Tunja）为核心的北半边的领土，领导着北方穆伊斯卡人的酋长率众表示臣服。
然而，在美洲积极开拓的时候，罗京却遭遇到了信仰相同教派的欧洲同胞的背刺！
由于医院骑士团在亚马逊河河口建立了贝伦城，拥有整个巴西宣称的葡萄牙人突然向医院骑士团宣战，骑士团不得不派出舰队载着陆军远赴贝伦，成功地击退了葡萄牙人的入侵，甚至迫使葡萄牙人将另一个亚马逊河的河口城镇波特尔（Portel）割让予医院骑士团。
虽然赢得了战争，但迦太基城中骑士团都只是哀叹道，同样信仰天主教的兄弟，原来与那奥斯曼土耳其一样可恨。
没曾想骑士们一语成谶，奥斯曼帝国在停战协议到期之后，1580年，再一次入侵罗德岛。如今的奥斯曼帝国已经建立了庞大的桨帆舰队，在地中海上可谓是横行霸道，在大团长的授意下，罗德岛没有抵抗，经过协商之后，正式向奥斯曼帝国投降，沦为奥斯曼帝国的土地。
落泪值+20
“幸好我们还有一片新的家园，这是土耳其人想象不到的乐园，也是他们永远入侵不了的土地。”骑士团的神父们如此向新耶路撒冷的百姓安慰道。
失去罗德岛后不久，罗京又再一次品尝到殖民竞争的残酷。
在加勒比海岛上亦有殖民的医院骑士团遭受到大不列颠王国的胁迫，不得不将背风群岛中的几座小岛割让出去；而那葡萄牙人为了夺回波特尔，竟再一次向医院骑士团宣战！
由于新耶路撒冷绝大多数人口都在哥伦比亚，贝伦没有专门的驻军，医院骑士团只好再一次组织远征军赶赴巴西去与葡萄牙人交手。
这一年，却有一个意外发生了：哥伦比亚的上空，一颗扫把星扫过天际，人们都说那彗星是恶魔的亲朋好友。
稳定度-1
一时间新耶路撒冷竟人心惶惶，前线作战的部队也抵挡不住无比富裕的葡萄牙人的军队，居民均为葡萄牙人的波特尔城罗京本就不太在乎，便大大方方地还给了葡萄牙。
罗京看着这接连到来的霉运，拍了拍额头，“我希望生活在更开明的时代。”
（欧陆风云中，出现“彗星”事件时玩家有很多选项可以选，但结果全部都是“稳定度-1”，其中一个选项写的便是“我希望生活在更开明的时代”；有趣的是，在维多利亚也同样有彗星事件，却没有负面效果，选项中写的是“幸运的是我们生活在开明的时代”）
巴西的战事与哥伦比亚的乱状使得“林登万”（叛军）也登上了医院骑士团的历史舞台，一支篡权叛军声称是当今的大团长安东尼二世（三围2-3-2）太过无能才导致新耶路撒冷江河日下！
唯有一位名叫克蒙·弘察的人掌握权柄，才能拯救世人！
通常来说，罗京看到出现叛军的第一反应是率军平叛，然而罗京在面板里一看，这位弘察先生的君主属性竟有5-5-6之高！
“神君啊……诸位，为王师让道！”
就这样，前线部队逗留在亚马逊河口的贝伦城的时候，一支叛军可谓是从天而降，从高耸入云的安第斯山脉上的通哈城，一路杀进了迦太基城，竟没多少抵抗。
数月之后，骑士团正式承认了弘察先生的统治，骑士团进入了新的时代。
然而罗京看着面板上克蒙·宏察的背景信息哭笑不得：宏察（Hunza）是穆伊斯卡人著名的酋长家族，因而新任大团长克蒙原来是一名信仰太阳神的土著！？
