(1)时间、内容范围上的限定符:主要有“=”、“>=”、“<=”、“-”、“>”、“<”等。如“PY<=1999”表示检索1999年以前的文献。
(2)优先顺序的运算限定符:主要有“()”。“()”的使用(包括多层次的使用)可以改变运算符的优先顺序。在无括号的状态下,不同数据库中各种运算符表示的运算优先顺序不同。上述计算机运算符号在MEDLINE检索系统中进行检索时的优先顺序是:()>not>near>with>and>or。
1.3.2编制检索提问式的注意事项
正确编制检索提问式是非常重要的,但是用户在初次检索时,经常会因为不熟悉检索系统或提问式不恰当而难以找到合适的文献,这时一方面通过查看系统的帮助信息以了解该系统允许的检索提问式的构成规则,另一方面就需要修改自己的检索策略,重新确定新的检索式。编制检索提问式的注意事项有:
(1)正确分析课题,准确提炼代表所检课题内容的主题概念,优先使用词表中的规范词。
(2)不同的检索系统提供的检索途径是不一样的,允许使用的算符也会有所不同,而且会用不同的符号来表示,这一点在上机检索时应通过查看帮助功能事先了解。
(3)一般情况下,布尔逻辑算符的运算顺序为not、and、or。
(4)同时出现逻辑算符和位置算符时,优先执行位置算符。
1.3.3什么是查全率?如何提高查全率?
查全率指的是系统在进行某一检索时,检索出的相关文献与系统文献库中的相关文献总量之比率。
常用的提高查全率的方法有:
采用explode扩展主题词检索;
采用or连接可能的同义词、相关词、单复数、形容词等同一概念的不同表达方式,如用newborn or neonatal or neonate or neonatus等查全“新生儿”这一概念;
采用截词符检索具有不同后缀的同一概念;
采用替代一词中某一字母的变化形式。
1.3.4 什么是查准率?如何提高查准率?
查准率指的是系统在进行某一检索时,检索出的相关文献量与检索出的文献总量之比率。
常用的提高查准率的方法有:
采用主题词及主要主题词检索;
采用副主题词组配限制检索;
采用in把某个检索词限定在某个字段;
采用and,with,near,not缩小检索范围;
在已知着者、物质名、酶命名号、化学物质登记号、基因符号等情况下,可直接检索,其专指性强,查准率高。
1.3.5查全率和查准率如何协调?
在查全率和查准率之间存在着矛盾的互逆关系,在同一个检索系统中,查全率提高,查准率就会降低;而查准率提高,查全率必然降低。一般认为,漏检是影响检索质量的主要因素,误检是影响检索效果的主要因素。
因此,对开拓一个新的研究领域应避免漏检提高查全率,在已非常熟悉的领域为获得最新研究资料应避免误检提高查准率,以免浪费时间。
1.4常用医学文献数据库有哪些?
1.4.1必查数据库
1.中国生物医学文献数据库
中国生物医学文献数据库(CBM)收录了1978年以来1600多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录与文摘(1989年以后的题录与维普全文数据库链接),年增长量40余万篇,数据总量达350余万篇。
学科范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、口腔医学、中医学及中药学等生物医学的各个领域,是目前查找中文生物医学文献的主要数据库。
该数据库目前有Windows版和Web版两种发行方式,Windows版与美国Silverplatter公司的WinSPIRS检索系统类似,Web版与PubMed数据库的检索系统类似,所以掌握CBM或MEDLINE两个数据库的任一种检索系统后,均能触类旁通、熟练使用另一种数据库。
CBMWeb版检索系统提供了基本检索、主题词检索、分类检索、期刊检索和第一作者检索等检索入口,用户可以根据自己掌握的资料特性选择不同的检索入口,从而实现作者检索、单位地址检索、刊名检索、参考文献引文检索、期刊投稿信息检索、主题词检索及综合检索(各途径结合的方法)。根据检得的检索结果中相应的信息单元,如作者、刊名、关键词、主题词等,点击后可获取相应的横向文献信息,进一步扩大检索结果。
2.MEDLINE
MEDLINE是美国国立医学图书馆建立的MEDLARS(医学文献分析与检索系统)中使用频率最高,也是最大的数据库,是当今世界最具权威的综合性生物医学数据库之一。收录内容包括基础医学、临床医学、护理学、牙科学、兽医学、药物学、营养卫生、卫生管理等,涉及生物学、人文科学、情报科学等领域。MEDLINE包括三种重要索引:Index Medicus(医学索引)、Indexto Dental Literature(牙科文献索引)和International Nursing Index(国际护理索引)。它收录了1966年以来世界上70多个国家和地区用40多种语言出版的4800多种生物医学期刊上的文献,其中我国有40多种。年报道量40多万条,75%为英文文献,自1975年以后开始收录文献摘要。
MEDLINE的网上代理检索系统有OVID、ISI、Sci Finder Scholar等,其中OVID检索系统的Map Term to Subject Heading选项,可将检索词限定在主题词字段,同时可以进行主题词扩展(explode)和副主题词限定检索。
3.PuBMed
PubMed是由美国国立医学图书馆国家生物技术信息中心开发研制的基于Web的网上医学文献检索系统。该系统具有强大的检索和链接功能,是目前世界上查找医学文献利用率最高的网上免费数据库。PubMed收录了世界上70多个国家和地区的4600多种重要生物医学期刊的摘要和部分全文,其中80%以上的文献有英文文摘或全文链接,5%左右可以免费查看全文。数据库每日更新。
PubMed数据库检索界面提供基本检索和辅助检索两种检索入口,可通过两者的有机结合达到最佳检索效果。基本检索状态下可直接输入检索词,词与词之间可使用逻辑组配符号(and、or、not),词尾可使用截词符,也可用双引号要求实现精确检索;辅助检索功能有Limits(限定)、Preview/Index(预览/索引)、History(历史)、Clipboard(剪贴版)和Details(检索策略检查和修改)。
PubMed检索系统的特色是具有检索词自动转换功能及主题词自动扩展功能,在词尾使用截词符或双引号时该功能关闭。不需要用户对数据库的检索系统和主题词有很深入的了解,系统能够通过将用户输入的检索词自动与MeSH词转换表、刊名转换表、短语表和作者索引等四个词表进行比对,并转换成合适的检索词并返回检索结果,用户可通过Details按钮了解系统根据你输入词采用的检索策略,同时还可以对系统执行的检索策略进行修改,要求其重新检索。
1.4.2 辅助数据库
通过检索必查数据库之后,还应对一些专业的文摘数据库和全文数据库进行辅助性检索,起到补充相关文献的目的。
1.5常用定题文献跟踪手段有哪些?
1.5.1RSS订阅与输出
1.什么是RSS?
RSS(Really Simple Syndication)是一种用于共享网页(Web)内容的数据交换格式,由网站直接把信息送到用户桌面,用户可以通过RSS阅读器订阅自己感兴趣的内容,当网站内容更新时,用户会看到新信息的标题和摘要,并可以阅读全文。RSS允许用户同时订阅多处来源信息,并自动将信息组合到一个列表中。用户可以快速浏览列表,而不用访问每个网站,就可以搜索感兴趣的最新信息。每天一打开RSS阅读器,用户就能在第一时间得到最新信息,可以大大节省查询时间、提高工作效率。
2.如何使用RSS?
一般需要下载和安装一个RSS阅读器,然后从网站提供的聚合目录列表中订阅您感兴趣的栏目的内容。常用的RSS阅读器有博阅、新浪点点通、百目等。订阅RSS的步骤如下:
步骤1点击RSS或XML标记。
步骤2直接复制点击标记后生成的地址。
步骤3运行RSS阅读器,从菜单选取新建或添加一个频道(Channel),粘贴刚复制的XML地址。
订阅后,用户将会及时获得所订阅频道的最新内容。
1.5.2各数据库的个性化服务
许多人在检索过程中曾遇到过如检索还没完成突然有其他事情要处理,只好改天重新检索;或者是花了不少功夫检索到一些相关文献,但因为看全文花费时间较长,突然被系统自动退出导致所有的功夫都白费;或者有时还没来得及把所有需要的全文下载便因故不得不退出,改天还得根据已下载的检索结果把全文一篇篇找出并下载;也有人因为科研需要对同一课题定期到图书馆检索以跟踪最新的文献等。诸如此类的问题,大部分数据库都有各自的个性化服务栏目能够帮助大家保存检索策略,以便下次访问重新检索或者是更新检索。许多在线数据库甚至能够根据用户的需要定期往用户设定的Email账户发送最新文献,当然这种功能更适合于在更新频率较快的外文数据库中使用。这些个性化服务都需要用户注册建立个人账号和密码,这样每个读者必须通过自己的账号和密码才能访问,不用担心自己的检索结果被别人使用或随意修改,充分保护自己的隐私和知识产权。
1.中国生物医学文献数据库网络版检索系统(CBM)的定题服务
通过CBM检索某一课题得到满意的结果之后,为了今后一段时间内对该课题的进展情况进行跟踪检索,从而指导课题进行过程中调整研究方向,课题结束后评估自己的课题在国内同类研究中的水平等,可以利用CBM的定题服务功能来保存本次检索的检索策略,然后定期访问CBM定题服务栏保存的检索策略,执行“最新文献检索”对上次检索后至今数据库中新添加文献进行检索。
2.中文科技期刊数据库的“我的数据库”
在中文科技期刊数据库的非本地镜像版中,“我的数据库”栏目的“我的检索历史”可以帮助用户保存检索策略,以便下次访问时重新检索;用户在“定题推送服务”中制定检索策略,并设置Email推送检索结果,更新频率分别为7天、15天和30天,并可修改和删除检索策略。
3.PubMed的MyNCBI
PubMed的MyNCBI可以为用户保存检索策略,并可通过点击“Details”键设定为通过Email自动寄送最新检索结果,更新频率有日更新、周更新、月更新等。未设定自动更新的检索策略,用户可以登录后进行手动更新检索。用户不能直接对已经保存的检索策略进行修改,要更改检索策略须重新到PubMed检索页进行检索产生新的检索策略并保存(Save Searches)。MYNCBI还提供外部链接(Link Out)设定、特定类型文献筛选(Filters)等个性化设置功能,为定题服务提供了更多便利。
4.ISI检索平台的SAVEHISTORY
用户可以通过Search History页面或者Advanced Search页面保存检索策略,保存地址可以是本地计算机或ISI服务器。保存在本地的检索策略可以再次打开并运行,保存在服务器上则允许创建定题跟踪服务,定题服务的更新频率有周更新和月更新两种。该定题跟踪服务的有效期为24周,收到ISI发送的过期通知邮件后访问ISI检索平台的Open/Manage Saved Searches页面,点击Renew按钮即可延期。
5.OVID检索平台的Saved Searches/Alerts
用户可以通过点击Save Search/Alert将检索策略保存下来,保存方式有暂时(Temporary,24小时)、永久(Permanent)和自动更新邮寄(Auto Alert)三种。用户可以对已保存的检索策略进行编辑以提高检索准确度或改变检索方向。
1.6 中文医学数据库定题检索实践
1.6.1 中国生物医学文献数据库
检索示例1:有关肿瘤的microRNA研究方面的相关中文文献
(1)课题分析
micro RNA(miRNA)是一类含量丰富的非蛋白编码小RNA,可作为负性调节因子,能调节多种生物进程。生物信息数据显示,每个miRNA能控制数百种靶基因,miRNA可能对每一条遗传通路都有影响。miRNA突变或异常表达与多种人体癌症有关,同时也表明miRNA可以作为肿瘤抑制基因和致癌基因。已证明miRNA能抑制重要癌症相关基因的表达,miRNA研究可能有助于癌症的诊断和治疗。