故事得从唐晓磊的爷爷说起，关于晓磊的爷爷——他可是一个了不起的人，爷爷生前留下了一本又旧又厚的科研笔记，记录了自己一生的密码。直到某一天它落到了唐晓磊手中，这本笔记便似乎找到了自己新的主人，晓磊开始对它爱不释手，在他看来那是他爷爷流传下来的一笔宝贵的财富。爷爷生前曾是国内著名的自然科学家兼探险家，虽然他生平穷困潦倒，但却乐观开朗，总是对生活充满了无比的热情。
爷爷时常喜欢独自一人待在一间静谧的休息室里，他在里头做些什么呢——思考各种谜题、研究各种知识、描摹各种逻辑草图……这些都是他喜欢干的事情。
后来不知怎么的，爷爷在一夜之间宣告他要在科研界金盆洗手。他离开科研界之后，开始周游全国，到处去探幽寻秘，他所到之处，必定要记录他观察到的各种神奇的现象。可不幸的是，在最后一次旅行途中，他途经恶龙湖时，突然肺癌病发，逝世在当地一位渔民的家里。
而事实上，在这本破旧的笔记里，爷爷开头就介绍了自己金盆洗手的原委。原来当初爷爷之所以退出科研界，是因为他罹患肺癌，而当时检查出来时，已经是癌症晚期了。当他得知这个消息时，颇为震惊，事后他也并未告诉任何人，为了在生命的最后章节里谱写出一段华丽的乐章，爷爷决定去周游全国各地，像明朝的地理学家徐霞客一样，四处探幽寻秘。
爷爷在去世时，只留下了他生前用过的一台电子显微镜、一副放大镜和一把小提琴。而爷爷后期的奔波劳碌，也是延续了他科学家的风尚，为了破解人世间那些神秘的疑题，还原那些让人匪夷所思的真相。
所以每探寻到一个秘密之后，爷爷便喜欢详细地将整个探秘的进程记录下来，他将自己历经过的事件一五一十地记录在这本厚厚笔记本里。比如里面就记录了恶龙湖里面的水怪、西方神话传说中的吸血蝙蝠……一系列看似神秘而又不可思议的未解之谜，然而当他揭开那些神秘面纱之后，真相往往又在人的想象之中，是那么的合乎常理。
晓磊的爸爸妈妈丝毫不喜欢爷爷流传下来的这所谓的“精神财富”，他们对这些怪异之事并不敏感。妈妈是家庭主妇，加上又是一名周末电台主持人，所以平日里大部分时间都在絮絮叨叨，根本不会去阅读什么书籍，更别说去看那本快老得掉皮的笔记了。而爸爸唐宇桦先生是生意场上的大商人，他更多的是在乎那生意场上的聚宝盆，那本残破的笔记对于他来说，连垃圾都算不上。
在爷爷去世之后，都没经过商量，他们便纷纷决定将其扔弃。不过后来他们念在这毕竟是老人家流传下来的东西，便放在橱柜里珍藏了起来，作为纪念品。但与其说是“珍藏”，倒不如说是“禁闭”，因为根本没人会去橱柜里翻出那东西来看。
直到某一天，一次偶然的机遇，唐晓磊正在橱柜偷藏私房糖果，这本笔记竟阴差阳错地被他给发现了。当他翻开来看时，瞬间被里面记载的东西所吸引住了，这是一本带有插画的笔记，他对爷爷曾经记录的那一系列事件起了莫大的兴趣，内心的冒险欲望立即腾起来，在他的潜意识里，他能感觉到爷爷是在向他倾诉，或者说是陈述，那是昔日的事实，那是沉睡的智慧。
而笔记里记载的可不是什么故事呀，那的确是一件件真实却神奇的事情，每当晓磊翻开它时，就仿佛走进了爷爷去过的秘境，沉睡的蛟龙、复活的蜡像、嗜血的巨虫、野蛮的土著、吃人的怪树……这一切都是爷爷曾经在探秘过程中发现的线索。
在这本神奇的笔记里，晓磊仿佛目睹到了爷爷那双深邃而自信的眼睛，他每每凝神呼吸一口气，思维便开始迈向一层新的台阶，那或许是爷爷的灵感，亦或许是他与生俱来的天赋。透过这本笔记，晓磊在最后一页终于发现了一个惊人的秘密，笔记的最后一页除了记录一些爷爷平时常用的科学探秘技巧之外，还阐明了他自身超常洞悉能力的由来，他拥有着敏锐的感官，而原来这些都归功于他身上基因突变。
爷爷超出常人的洞悉能力竟出自于他自身的变异！笔记里详细地记载着，早在许多年前，斯维尔大学的哈米博士是他的挚友，他是生南美洲赫赫有名的科学家，当初他在研究生物基因特性时，萃取到了多种动物的混合DNA生化血浆，而恰恰被当初匆匆赶来拜访的爷爷误当解渴水一口吞下去了，之后效果便不言而喻了，庆幸身体发肤毫无损害，而真正发生改变的是他身上的基因，它们彻底发生了变异，而当初他自己压根还没注意到，直到后来他才发现，是哈米博士的那杯混合DNA生化血浆赐予了他超凡的洞悉力，他身上的基因足矣让他后来成为科学界的佼佼者。
照理说，唐晓磊的父亲在商场上拥有如此敏锐的嗅觉也似乎与他爷爷基因的遗传脱不了干系，那么晓磊自己呢？像他这种酷爱冒险、古灵精怪，成绩又能名列前茅的孩子并不常见。这个就读于梓光小学四年级的小学生，他也怀疑过自己身上的基因，他使劲地思忖着，他感觉自己的智商也似乎超出了同龄人的水平，记忆力超强的他能过目不忘，小小年纪就已经涉猎多门学科的知识，所以每年期中期末考试都能拿到年级第一的好名次，他憧憬着自己或许会跟爷爷一样，将来也会成为一名著名的探险家。
