林木星周身的魔气越汇越多，林木星的气息也越来越微弱。终于在叶修罗的带领下，林木星来到了玄灵宝树身边，玄灵宝树是末日森林的中心，林氏一族世世代代守护着玄灵宝树。林氏一族的命运几乎相似，为防止魔气泄露他们家族的每一代都以生命献祭了玄灵宝树，林木星的爷爷是这样，他的爸爸妈妈也是这样。如今到了林木星这一代，命运依旧如此。
说起玄灵宝树，不得不提及上古一位大神，幕栖阁阁主化叶真人叶九淮。此神相传是由天地所生，能用双手化叶，天下数一数二的战神，可是他为人却是不喜争强好斗的那种，他一直守护在自己的灵域修炼。终于他顿悟了，手拈一叶，化叶为书，名曰玄叶宝。此书内含天机，可称为世间灵物。又过了数百年，天地生一灵树，却不料被天上众神所知，为满足自己贪念，他们欲图将此树占位己有。此树有灵，已经成为人形，却被众神强行施压，抽取真灵。叶九淮看见后化叶为器，将众神击退，可是此树已经危在旦夕。叶九淮良善，有悲天悯人之大义，他和此树一样为天地所生之灵物，他能深刻感受到这种被人围杀的苦痛，因为他从小就是这样度过的。成为神之后，天下人才不敢伤害他。
神树告诉叶九淮，他名叫玄灵，是九霄玄灵娘娘从女娲宫求来的树籽，种于此地，集天地之灵气，日月之精华终成人形。可是他却要再度变成原来的样子，甚至枯死。
叶九淮想都没想，将他带进了末日森林的中央，用阵法引导万物将灵气汇聚于此维持玄灵宝树的生命。但是灵魂被撕碎的玄灵宝树已经无力再生了，只是气息奄奄的在那里枯萎着。
突然叶九淮第一次有了人类的感情，眼泪滴落了下来，落在了玄灵宝树上，同样身为天地所生之物，第一次流泪自然蕴含强大的法力，叶九淮同样以血为引注入玄灵宝树当中。
玄灵宝树活了下来，只是他失去了幻化成人形的能力，他只能深根于地下，以大地的能量来维持自己的生命。尽管失去修炼成人形的能力，但玄灵宝树身为天地所生之物，其仙灵却是不可比拟的。所以玄灵宝树在扎根末日森林后很快就成为了一方之宝。
叶九淮每天在玄灵宝树下修炼，玄灵宝树也每天都在生长、修炼，很快他们便成为天下威震一方的大神。玄灵宝树虽然不能够如同人一般行走，但是天下所有的植物，动物都可以当做他的眼睛为他服务，只要他法力不受限，天下之事他可一一晓得。而叶九淮虽然有了人的感情，但是他却生性凉薄，不好与人接触，所以说百年来一直和玄灵宝树呆在末日森林。他们如同兄弟一般，相互修炼，共同生死。直到有一天，叶九淮想离开森林去看看外面的世界。从此，叶九淮的生命才发生了改变。而玄灵宝树才会变得魔气冲天。
