原来，逃回舰上的水兵并没有安生，他们再次纠结同伴前往警署继续闹事。路上，有士兵顺便买了一把日本刀。水兵们到了警署自然又是一番争执，这时候，那名买了刀的水兵顺手一刀，将一名日本警察刺成重伤。
日本警察见中国水兵竟敢行凶，登时一拥而上，寡不敌众的肇事水兵在搏斗中受了轻伤并被逮捕，其他水兵再次逃回军舰。
军舰上，丁汝昌正在发飙：“一群混蛋，搞出这样的事情，让本官回去怎么交代！若是酿成两国争端，本官看了你们的脑袋！”
有手下献策：“大人，为今之计，一是将此事通报领事馆，请他们协助调停，另外，最好还是发一封电报回去，看看中堂大人的意见。”
“也只能如此了，你立即去发电报。”
军舰上正在焦急的等待国内的回电，长崎城内却暗流涌动。日本人在自己的国土上吃了亏，断然不会轻易咽下这口气。在丁汝昌等待回电的时候，长崎的日本浪人、警察已经开始秘密串联，寻机报复中国人。
14日，严格约束水兵不许上岸的丁汝昌终于接到了来自国内的电报，电报是李鸿章发的，然而内容却是丁汝昌万万没想到的。
刘步婵奇怪道：“中堂大人为什么会让咱们不要约束士兵，继续给他们放假？”
丁汝昌没好气的道：“你问我，我怎么知道！中堂大人一贯谨慎，这次却一反常态，难道就不怕酿成事端么？”
“正是如此，此事才蹊跷啊。大人请想，中堂大人一贯谨慎，为何偏偏这次一反常态，莫不是……？”
丁汝昌一愣，顿时思索了起来。“你的意思是，中堂大人是有意挑起事端？”
“不敢，下官只是猜测而已。但不管怎么说，咱们执行命令，总是没错的。”
丁汝昌敲着扶手，沉默片刻，这才道：“好，传令，明日继续放假，士兵们可以随意离舰，但每条舰上必须留下充足的人手以应不测，同时，离舰的水兵必须集体活动，不得单独行动。”
“喳！”
15日，北洋舰队再次放假，这一次，水兵们有组织的上岸，一共出去了四百多人。傍晚时分，早有预谋的上千名日本警察、浪人手持武器，将各华人街的街道两头堵住，突然持刀追杀那些在街上游逛的北洋水兵。混乱当中，一些当地的日本人也从楼上浇沸水、掷石块，有的甚至也拿着刀棍参与混战。
由于猝不及防，加上没有携带武器，北洋水兵们这次吃了大亏。事后统计，在这次冲突中，北洋水兵当场死亡5名（事后因重伤又死亡两名），40多人受伤；日本警察也被打死1名，受伤者30名，另外当地日本人也有多名负伤。事后根据日方制作的《长崎港清舰水兵喧斗事件》的验伤报告，北洋水兵受刀伤的37人，日方为14名，而双方撞伤与打伤的数字基本接近，前者分别为6人，后者北洋水兵7名，日方9民。北洋水兵的刀伤，大多集中在背后，可见当日被追杀的情形。
被追杀的士兵们狼狈的逃回了军舰，得知消息的丁汝昌立即召集各舰将领开会。
“大人，现在事情闹大了，若是咱们不管，恐怕军心士气有影响啊。”
“是啊大人，士兵们吃了亏，现在士兵们都叫嚣要报复，有士兵将炮衣都退了，您看这……”
琅威理、刘步婵认为，应该顺应军心，报复日本人。琅威理甚至道：“这是最好的借口，我们应该立即对日本开战，争取赔偿！”
但是丁汝昌还是有些犹豫，这毕竟是国家大事，如果真的战端一起，会死人的啊。
这时林泰曾道：“大人，之前中堂大人的电报上不是说‘不要约束士兵’么，不如让士兵们打上两炮出出气，一方面平定了军心，同时也可以看看日本人的态度。”
丁汝昌想了想，终于下定决心：“好，凯仕，这件事就交给你，记住，就是尝试一下，千万不要让士兵有着性子来，只准打两炮！”
“是，大人。”林泰曾领命而去，随即，定远舰将褪去炮衣的12寸巨炮调转炮口，对准了长崎市区。
‘轰~’‘轰~’！
连续两发炮弹，落在了长崎市区。海军的十二寸舰炮可不是陆军的那些小玩具，一枚炮弹的重量就几乎相当于一门57毫米行营炮了，这两炮下去，整个长崎市都能感觉到爆炸所带来的震动，至于炮弹落点附近，更是成为一片废墟，鸡犬不留。
看到大清国竟然真的敢开炮，这下日本可没脾气了。面对坚船利炮，只能乖乖的放人，还要道歉赔偿。《长崎快报》对此作了报道，英国驻长崎领事也将事件写进报告。
原本日本人以为将人放了，按照满清的官场，这件事儿就能大事化小小事化了。没想到清政府这一次却不依不饶，在天津的李鸿章16日立即召见了日本驻天津领事波多野，直接威胁道：“如今开启战端，并非难事。我兵船泊于贵国，舰体、枪炮坚不可摧，随时可以投入战斗”。
在收到李鸿章的威胁后，波多野立刻将此信息发往东京，日方随即对冲绳和对马的战备情况进行调查。十七日，李鸿章秉承光绪的意思，向长崎地方领事馆发报，命令丁汝昌随时准备南下琉球。日本政府立即知晓了这一电报内容，马上命令冲绳县知事立刻带领几十名警察踏上归途。
为防止事件升级，日本外务省在22日成立了新闻检查科，命令长崎、大阪、兵库和其他府县的各家报刊在报道长崎事件时，必须事先交新闻检查科审稿，以禁止刊登辱骂中国的言辞与涉及机密的报道。
现在最兴奋的就是载湉了，正向琅威理说的，这是最好的借口，小皇帝片刻不敢耽搁，立即召集军机大臣、总理衙门大臣和诸王商议对日宣战。
然而，让小皇帝所料未及的是，竟然没有一个大臣支持对日宣战，相反，连中立的都没有，一致反对。
“皇上请三思，中法战争刚结束还不到一年，国家又在建设海军，黄河决口，大量流民需要安置，东北开垦也需要投入，现在国家财政困难，一下也拿不出那么多钱来动员军队。而且如果因为“长崎事件”而向日本宣战，势必引发更大的国际冲突。北面俄罗斯人正在盯着朝鲜，南面英国人刚刚占了缅甸，中日两国毕竟一衣带水，一旦开战，于人于己都未必是一件好事。”
奕?的话并非没有道理，国内的先不说，英国人暂时也被缅北的‘游击队’绊住了脚，但是俄国人载湉却不能无视。
因为就在两天前，朝鲜刚刚传回消息，朝鲜内务总理大臣沈舜泽可能已经和俄国俄国驻朝公使韦贝达成了秘密协定，朝鲜要求俄国出兵保护，而韦贝则一口答应。即‘第二次俄韩密约事件’。
消息是袁世凯送回来的，经由李鸿章转交总理衙门。提供消息给袁世凯的朝鲜右营使闵永翎当时言之凿凿，甚至出具了沈舜泽给俄国公使的密函的抄件。对于这样的大事，李鸿章在致电奕?的同时，也迫不及待的提出了自己的意见，那就是当下应该以整军备俄为主，立即调遣兵舰返回朝鲜沿海巡逻，以防万一。而李鸿章的意见无疑得到了绝大多数朝廷重臣的认可。
“日本人还占着我们的琉球未还，难道你们就不想收回么！”载湉仍想争取一下，毕竟，现在这个契机太好了。而且俄韩密约一事并未得到证实，甚至载湉怀疑这会不会是日本人搞出来的缓兵之计。
“回皇上，琉球的归属，可以通过和谈来向日方索回，现在我朝海军远较日本强大，前日李大人向北洋水师发报，命其准备南下琉球，据悉，日人立即从琉球撤离，这说明日人已经屈服，只要我们略加威逼，则合约可定，不需大开战衅。”
奕訢分析的头头是道，众臣一起道：“请皇上三思。”甚至就连自己的亲老子奕譞也不支持光绪全面宣战的决定。
现在的朝廷上下，包括民间，还没有对日本充满仇恨。相反，几乎所有人都认为中日这两个亚洲国家应该携起手来，一致对抗欧洲列强，现在想让这些大臣接受自己的观点，真的是很难。
教训教训可以，真要开战，皇上，您老人家还是省省吧。
载湉虽然是皇上，但也不能真正的冒天下之大不韪，一意孤行，只得道：“朕反复的跟你们说过，日本狼子野心，必欲除我而后快，中日之间必有一战。你们不趁着现在我强彼弱，一战而胜，非要等他们强大了之后来打我们的时候，才能醒悟。朕现在拗不过你们，但总有一天，你们会看到结果！”
说完，一甩袖子，扭头走了。
皇上使了性子，剩下诸位大臣你看我我看你，全都对着奕訢道：“王爷，接下来该怎么办？”
奕訢道：“皇上的话，咱们记在心里就是，当前的事情，一方面请醇亲王电告李中堂约束士兵，不要进一步扩大世态，另一方面，也要通过外交施加压力，争取一个有利的赔偿，不过的确可以借此机会确定琉球的事，也算是对皇上有个交代。”
众人道：“那就仰仗王爷了。”
清廷这边争论有了结果，日本那边却更加热闹。
定远舰开了炮，虽然只有两发，但长崎是海滨重镇，人口繁多，这两炮下去，再加上爆炸引发的火灾，十几条人命就进去了。再加上大清在琉球问题上的明确军事压力，让日本军队立刻起了反应。中下层官兵要求请战报复，甚至有浪人串联，要夺取港口的炮台，和清军开战。
然而日本的高层现在却很清醒，日本虽说已经开始变法维新，但一个国家不可能在十来年间便完全改变，何况日本还是一个资源贫乏的国家。尽管日本人对“顽固保守”的中国报以蔑视，但中国毕竟是一个古老而庞大的帝国，这种历史的阴影并不是那么容易抹去的。更重要的是，当时中国的国力及军力都是日本难以企及的，仅就海军而言，日本只有3艘3000吨级的铁甲舰，而北洋舰队光7000吨级的铁甲舰就有两艘，其他巡洋舰、炮舰、运输舰等，其数量和质量也远在日本之上。现在开战，这不是拿鸡蛋碰石头么？所以，日本高层强力压制，决不允许将事态扩大化。
二十二日，日本天皇召开御前会议，讨论暂时退出琉球的议案。随后日本人惊讶的发现，原本前往琉球的大清舰队掉头走了，回到了朝鲜近海。
