左肝木主阳气升、阴气降，反映河洛模式正左方阳数3向7或9上升，阴数8向2或4下降，右肺金主阳气降、阴气升，反映河洛模式正右方阳数9或7向1下降，阴数4或2向6上升。从结构上看，左肝右肺、心上肾下的部位不是指五脏解剖的实际部位，而是指河洛八卦之部位，左肝之“左”为河洛八卦之“左”（东）、右肺之“右”为河洛八卦之“右”（西），心上（而非“肺上”）为河洛八卦之“上”（南），肾下为河洛八卦之“下”（北）。
关于脾居中央，《素问·太阴阳明论》：“脾者土也，治中央，常以四时长四藏，各十八日寄治，不得独立于时也。脾藏者常著胃土之精也，土者生万物而法于天地”。以脾居中土，亦本于河洛八卦模式。河图中央“五”是四方生效（一、二、三、四）变为四方成数（六、七、八、九）的中介，生效加“五”则成效。洛书配属八卦独中五无卦可配，即为“中五之极”。中五不占四方而统领四方，脾藏不独立于四时而统治于四时，与河洛“中五不占四方而统领四方”相符合。
可见《内经》所确立的中医五藏位置固然是从功能入手确立的，同时也可看出五藏位置即是八卦河洛中的位置。
4.脏腑象数
从《内经》开始，中医即用太极八卦象数原理来构建人体的生理、病理模型。
《灵枢·九宫八风篇》直将将洛书八卦与脏腑配合，以九宫八卦占盘作为观察天象、地象及人体、医学的工具，将八卦八方虚风与病变部位有机对应，以文王八卦作为代数符号，表示方位（空间），显示季节物候（时间）变化特征，创造天人相应、时空统一的世界模式。
《灵枢》脏腑与九宫八卦的配属关系为：
心配离卦，居九宫；肾配坎卦，居一宫：肝配震卦，居三宫；肺配兑卦，居七宫；脾配坤卦，居二宫；小肠配乾卦，居六宫；胃配巽卦，居四宫。
后世基本依准此配属。
元代王好古《此事难知》对此作了少许改动。心、肾、肝、肺的配属与《灵枢》相同。大肠配乾卦，小肠配艮卦，胆配巽卦，胃配坤卦。
明代傅仁宇《审视瑶函》则以卦象配属脏腑。离配心、小肠，坎配肾、膀胱，震配肝、胆，兑配肾、下焦，巽配肝、中焦，乾配肺、大肠，坤配脾、胃。
清代冯道立《周易三极图贯》以乾、坤分别配督脉、任脉。离配心、小肠，坎配肾、膀胱，震配肝、胆，兑配肺、大肠，巽配心包络、三焦。
清代何梦瑶在《医碥》中讨论了五脏与五行八卦的关系，他在《五脏配五行八卦》一节中将心火配属离卦，肾水配属坎卦，肝木配属震卦，巽卦，肺金配属兑卦、乾卦，脾土配属中卦、艮卦。
可见，历代各家配属虽有不同，但四正卦即坎、离、震、兑的配属则基本相同。
《黄帝内经》不仅将脏腑配属八卦，而且配属易数。如《素问·金匮真言论》将肝、心、脾、肺、肾五藏分别配以八、七、五、九、六五数，即采用河图成数。
《素问·五常政大论》除“五运平气之纪所应”之数为河图生成效外，还将五脏病变与洛书的九宫数相联系，如“委和之纪”，“邪伤于肝”，“眚于三”（震宫木数），“伏明之纪”，“邪伤心也”，“臂于九”（离宫火数），“卑监之纪”，“邪伤脾也”、“其眚四维”（中宫上通四方）；“从革之纪”，“邪伤肺也”，“眚于七”（兑宫金数），“涸流之纪”，“邪伤肾也”，“眚于一”（坎宫水效）。都是直接运用易学象数的例证。
5.脾胃太极说
受《周易》“是故易有太极，太极生两仪，两仪生四象，四象生八卦”的宇宙生成观影响，中医借此阐述脏腑生命的生成。
五脏之中脾为“：大极”。
东汉《周易参同契》以脾为祖，为太极；以肝、肺为父、母，为两仪；以心、肝、肺、肾为父、母、子、女，即四象。
清代邵同珍《医易一理》将五脏形体与先天八卦方位图相配，以脾为太极，太极脾土生出肺与肝两仪，然后生出肺、心、肾、肝四象，再生出肺、左手、心、左足、右手、肾、右足、肝八卦（见表7—2）。
芬余氏《医源》也以脾为太极。他在，《人身一太极说》一节中说：“以五行言心肝为木火之一源，肺肾为金水之同宫，中宫脾土为之维持调护。”认为中宫脾太极生出心肝一源与肺肾一源，即为两仪；再分之心、肝、肺、肾，即为四象。在《脾阳台中五说》：太极脾土为“后天之根本，而金木水火之枢机也。洛书一图，中五称为皇极焉。盖天地太和之气，而万物之所以生长收藏者也。在人身则为脾，内而脏腑，外而肢体百骸之所资养，而气血之所从生也。”阐述了脾为太极的作用。
脾脏为太极，与此相配应的胃腑亦为太极。《素问·平人气象论》说：“胃气力本”。《素问·玉机真薄论》说；“五脏者，皆禀于胃气。胃者，五脏之本也。”
《内经》多次谈到胃气的重要性，认为胃气主宰人体所需要的营养物质，可以滋养人体五脏六腑、四肢百骸，胃气充周于一身，为生命之源。
清代著名医家黄元御指出胃气为中气，是人体的太极之气。他说：“祖气者，人身之太极也。祖气之内，含抱阴阳。阴阳之间，是谓中气。中者土也，土分戊己，中气左旋，则为己土，中气右转，则为戊土，戊土为胃，己土为脾。”（《天人解》）
脾土胃气为太极，不仅是生命的根源，能生成其他脏腑，而且还是阳升阴降的枢纽。
金代医学家李东垣以《周易》阳升阴降原理说明脾升胃降，他在《脾胃论·阴阳升降论》中说：“《易》曰；两仪生四象，乃天地气交，八卦是也，在人则清浊之气皆从脾胃出。营气营养周身，乃水谷之气味化之也。清阳为天，清中清者，清肺以助天真，清阳出上窍，浊中浊者，荣华腠理，清阳发腠理，清阳实四肢。浊阴为地，浊中清者，营养于神，浊阴出下窍，浊中浊者，坚强骨髓，浊阴走五脏，浊阴归六腑。”说明营分为清中清、清中浊、浊中清、浊中浊四象，并以脾胃为枢纽，脾胃能够升清降浊、升阳降阴，使营养升降运行于全身，起到营养作用。
受宋代邵雍先天易学的影响，李东垣还提出了肾为先天之本、脾为后天之本的观点。“后天”代表人降生后的生理规律，在实际运用中有重要意义，自古医家多从脾胃入手治疗疾病，实际上是对脾为后天之本原理自觉或不自觉的运用。
6.命门太极说
“命门”一词，首见于《灵枢·根结篇》。对命门的具体所指，自古而今，分歧很大。
（1）目为命门与脑为命门
《灵枢》的命题是：“命门者，目也。”后人以此认为命门为睛明穴，是太阳经气聚结之处。
今有人认为：目为命门者，实指脑髓为命门。命根在脑，而显象于目。脑髓为体，目为之用。（田合禄《生命与八卦》）
虽然目为命门与脑为命门的体用关系尚难以令人信服，但以脑为命门的观点还是应当引起重视的。
道教一些典籍中对此已作了阐述。《黄庭内景经》第一章有“幽室内明照阳门”句，以“幽室”指脑，“阳门”指阳宫命门。意为：脑为命门，是人身的命根。第七章有“泥丸百节皆有神”、“一部之神宗泥丸，泥丸九真皆有房”等句，泥丸指脑神精根，为诸神之宗，能主宰面部五官之神，又是百神总会，能主宰上中下、首面、脏腑、百骸诸神。即为命门之神。
近年有报道，对气功及特异功能者进行观测，发现一些气功师在气功态下发现大脑太极图，其S波的振荡率明显比一般人高，阴阳鱼的颜色分别呈紫红（或红）色和红（或粉红）色。并呈现清晰的动态图示。
（2）右肾为命门与两肾为命门
右肾为命门是《难经》的观点。《难经·三十六难》认为：“左者为肾，右者为命门。命门者，诸神精之所舍，原气之所系”。
命门具有生命之门、生命的关键等含义。《难经》认为肾与命门虽在部位上有左右之分，但在功能上两者基本相同。在八卦方位（后天）模式中，乾居西北，坎居正北。肾有两，配左右。肾配坎，命门配乾，乾在坎的右边，命门则为右肾。《入药镜》引《云房丹诀》说：“铅铅水乡灵源，庚辛室位属乾，尝居坎户，隐在兑边，生天生地，生人生万物，皆不外此先天之铅。”说明命门离不开乾阳之象，乾阳藏于肾精之中，乾阳（命门）使本无活力的坎水（贤）有了生命力。
元代滑寿《难经本义》说；“言左为肾，右为命门，而又云其气与肾通，是肾之两者，其则一尔。”明代虞抟进一步提出“两肾总号命门”。认为命门是“真元之根本，性命之所夫”，突出乾的卦位和功能，两肾为命门，为太极。
（3）肾间命门与动气命门
明代赵献可首创“肾间命门”说，其理论基础是“造化之枢纽，品几之根柢”的太极学兑，认为：“人身太极之妙，显然可见”。“命门在人身之中，对脐附脊骨，自上数下，则为十四椎，自下数上，则为七椎。”“此处两肾所寄，左边一肾，属阴水，右边一肾，属阳水，各开一寸五分，中间是命门所居之宫，即太板图中之白圈也。其右旁一小白窍，即相火也。其左边之小黑窍，即天一之真水也。”
认为命门居于左肾阴水真水穴与右肾阳水相火穴之间，此为人身之太极图。
清代喻嘉言以洛书立论，他在《寓意草》中说；“所谓两肾中间一点明，正北方水中之真火，而为藏精宅神之本。其体虽分左右，而用实在中，故心肾交媾之所，各该三寸六分，设从两肾行而上，其去中黄，不太远乎！”“两肾之用在中，此不过其空位矣。”强调两肾在左右，命门位中间。肾在正北九宫，而分隶东北、西北，虚其中位——命门，以此为用。进一步阐发了肾间命门学说。
明代孙一奎则提出肾间动气说，他在《医旨绪余·命门图说》中说：“命门乃两肾中间之动气，非水非火，乃造化之枢纽，阴阳之根蒂，即先天之太极，五行由此而生，脏腑以继而成。”以太极之体用论述命门，具有太极作用。不以乾卦为象，而以坎卦立论。在该书《右肾水火辩》中说；“坎中之阳，即两肾中间动气，五脏六腑之本，十二经脉之根，谓之阳则可，谓之火则不可，故谓坎中之阳，亦非火也。”坎为乾坤交合而成，坎为命门，坎为两肾中间动气，即坎中之阳。
（4）包络命门
金元四大家之一的李东垣在《兰室秘藏》中提出了心包络为命门的观点：“夫胞者，一名赤宫，一名丹田，一名命门。”“心系者，包络命门之脉也。”认为心包络命门与少阳三焦相表里，皆主相火，可代心君行事，虽位置不在肾或肾间，但功用与此相同，心包络“非水亦非火，此天地之异名也。”包含天地阴阳两仪在内，含为太极。太极为生化之本源，能生化繁育。
李氏的心包相火命门说对孙一奎、张介宾、赵献可等影响很大。
三、经络学说
经络是中国古代第五大发明，其意义和影响比其他四大发明更重大、更深远。
我国古代医学家在长期实践中发现经络现象。经络的确定是一个漫长的、反复的过程。据1973年出土的马王堆汉墓帛书《阴阳十一脉灸经》甲本记载，当时还只发现十一脉，十一脉的名称也与《内经》有所不同，其名称为：
（足）钜阳脉，（足）少阳脉、（足）阳明脉。肩脉、耳脉、齿脉、（足）太阴脉、（足）厥阴脉、（足）少阴脉（乙本是少阴脉在前，厥阴脉在后）（手）钜阴脉、（手）少阴脉。
十一脉与其后的十二脉相比，少一条手厥阴脉，在名称上没有冠以“手”、“足”；肩脉、耳脉、齿脉没有相应地称为手太阳、手少阳，手阳明。
由十一脉发展为十二脉，由不完全的阳明命名到三阴三阳对称名称的形式，《周易》六爻模型起到了一定作用。
《内经》十二经络的构建明显受到易学象数思维的影响。
易以取象比类法则的运用——《灵枢》以天象十二月，以地象河流、以水流与日月运行来推论十二经脉：
经脉十二者，以应十二月；十二月者，分为四时：四时者，春夏秋冬，其气各异……（《灵枢·五乱》）
地有十二经水，人有十二经脉。（《灵枢·邪客》）
气之不得无行也，如水之流，如日月之行不休。故阴脉营其脏、阳脉营其府，如环之无端，莫知其纪，终而复始。（《灵枢·脉度》）
《周易》六爻模式的应用——从（《阴阳十一脉灸经》的十一脉到《灵枢·经脉》的十二脉，从不完全的手足阴阳命名到完全对称的手足阴阳命名，是借助了乾坤两卦六爻模式。
六十四卦以六为节，每卦六爻。其中乾卦为六阳爻瘙棤，坤卦为六阴爻瘙棥。六爻自下而上代表由低至高、由下至上、阴阳迭用的逐级递进过程，上位为过程的终点，当运动至此则折返向下，再从初位开始一个新的演变过程。如此循环往复，以至无穷。除乾、坤卦外，其余六二卦阴、阳爻或相重、或相错，表示宇宙间万事万物的变易、复杂关系。
十二经脉分阴阳两类，阴经、阳经各分为三。从形式上看，六经与六爻不仅数量相合，而且结构相似。阴阳六经各分为三与六爻分三阴位、三阳位，六经三阴阳排列次序及由表及里，由浅入深的层次意义与六爻三阴位、三阳位的次序及由低到高、由弱至强的演进意义，有着相当的相似性。六经流注与六爻的排列均表现为由外及里、由少到多的规律，呈现循环往复的周期性。六经很可能受到六爻的启发。
再看一下《内经》中增加的手厥阴心包经。当时人们从形态学上实际只辩认出心、肝、脾、肺、肾和小肠、胆、胃、大肠、膀胱五脏五腑。《医易会通精义》认为：
三焦的提出，大约主要以综合机体功能联系为依据，心包络则很可能是为满足“六”的需要而得来。因为，事实上，心包络概念对于解释生理病理，对于临床诊治，都没有显示特殊意义。所谓心包受邪而导致的病症与心无何不同，故无独立价值。它与心实为一而二、二而一的关系，只起填充理论框架的空缺的作用。
这个观点是正确的。《内经》虽只加了一条经脉，实际上反映了《内经》在《周易》影响下，表现出的阴阳平衡——对立统一的整体动态思想。
《内经》十二经络的命名同样也表现出《周易》阴阳平衡思想。
《黄帝内经》还将十二经络与地支、月时相配合。《灵枢·阴阳系日月》认为：“寅者正月，生阳也，主左足之少阳；未者六月，主右足之少阳；卯者二月，主左足之太阳；午者五月，主右足之太阳；辰者三月，主左足之阳明；巳者四月，主右足之阳明。甲者七月，生阴也，主右足之少阴；丑者十二月，主左足之少阴；酉者八月，主右足之太阴；子者十一月，主左足之太阴；戊者九月，主右足之厥阴；亥者十月。主左足之厥阴。”《素问·阴阳别论》：“人有四经十二顺从，四经应四时，十二顺从应十二月，十二月应十二月脉”。
后世医家对此作了发展。并与十二爻相配。
杨上善解释《素问·阴阳别论》说：“四经，谓四时经脉也。十二顺相谓六阴爻、六阳爻，相顺者也。肝、心、肺、肾四脉应四时之气，十二爻应卜二月”。（《黄帝内经太素·阴阳杂》将十二经脉与“爻辰”说相对应。东汉郑玄爻辰说将十二爻与十二月相配合，乾卦初九十一月，九二寅二月，九三辰三月，九四午五月，九五申七月，上九戌九月：坤卦初六未月，六二酉八月，六三亥十月，六四丑十二月，六五卯二月，上六巳四月。据杨氏之说，则少阳寅正月配乾九二，左太阳卯二月配坤六五，余类推。
从杨上善将爻辰与十二经脉相对应上可看出《内经》命名的依据和线索。近还有人指出《素问·阳离合论》有关三阴三阳方位的论述与河洛生数变化生三阴三阳的方位契合。虽然其推算还值得榷，但关于六经受河洛模式启迪的基本观点还是取的。从《阴阳十一脉灸经》中可以看出，原始三阴三阳是足六经，以阴阳命名的还有（手）钜、（手）少阴二脉，这恐怕与洛书八卦有关，六脉八方。缺正南和正西，正南为离心，正西为兑肺，补上手少阴心脉与手太阳肺脉。《内经》十二经脉与河洛八卦四方之数（河图四生数）两相交会的六中组合情况有关，尤其与乾坤六爻模式有关。
四、气血津液学说
中医认为：气、血、津液，是构成人体的基本物质，是脏腑、经络等组织器官进行生理活动的物质基础。
《周易》气一元论的宇宙观（含人体观）是中医气血津液学说的哲学基础。
《周易》气一元论思想体现在“阴阳”、“太极”、“三才”等论述中。将天、地、人综合起来说明世界本源的统一性。
