到了公元前4世纪，纳巴泰人利用它处于亚洲和阿拉伯去欧洲的交通要道附近，积极把它发展成很具规模的货物中转站，经波斯湾输入的印度香料、埃及的黄金以及中国的丝绸途经这里，运往大马士革、泰尔以及加沙等地的市场。商队经过这里都得交纳途经货物的税和过路费。当地人也有偿为旅客、商队及牲口做向导，提供食物和水，从中获利不少。
公元前3世纪，佩特拉成为了纳巴泰人的首都。而在岩石中开凿墓地成了一种风俗。考古学家认为，这可能是早期居住在那儿的部族的风俗，后来又由纳巴泰人继承了：纳巴泰人还有可能把已故的国王们视为神灵，把他们的陵墓视为神庙。纳巴泰人也建造其他“宇庙”，有的嵌凿在岩石中。不过其中最大的一座是建于公元前1世纪的独立式建筑，可能是用来供奉佩特拉主神都萨尔斯的，该神的象征是一块石头。
公元前2世纪，纳巴泰人到了全盛时期。版图最大时，王国由大马士革一直延伸到海地区。在纳巴泰文化的巨大冲击下，原来的阿拉伯文字也被纳巴泰人的文化所替代。公元前80年～前65年，国王阿尔塔斯二世统治时期，纳巴泰人铸造了自己的钱币，建造了希腊式的圆形剧场，佩特拉城蜚声于古代世界。
公元前1世纪开始。罗马人控制了佩特拉周围的地区。106年，罗马人夺取了佩特拉，城市及周边地带成了罗马帝国的一个省，称作阿拉伯人佩特拉区。但它是罗马帝国最繁荣的一个省。
在罗马人统治下，佩特拉曾一度繁荣昌盛，罗马工程师们铺筑商道，改进灌溉设施。但由于地中海岸亚历山大城的崛起，原经过佩特拉的货物大部分依靠海上运输佩特拉中转地位发生变化。后来罗马人又在佩特拉城的北部兴建了一条大路，连通叙利亚的大马士革与美索不达米亚（今天的伊拉克），掠走了更多的运输贸易。到了公元3世纪，佩特拉的经济实力和财富大大减弱。
公元4世纪，佩特沦为拜占庭（或称东罗马帝国）的一部分。在这期间，它成为一座基督教城市，是拜占庭（或称东正教）大主教的居住地。
沉寂的玫瑰红
由于佩特拉位于埃多姆（意为“红色”）的心脏地带，所以19世纪的一个英国诗人J·W·柏根在一首诗里中又称它是“一座玫瑰红的城市，其历史有人类历史的一半”。后来柏根曾亲临佩特拉才发现此城并非玫瑰红色，甚至不能称为一座城市，不禁哑然失笑。尽管如此，“玫瑰城”之名还是不径而走。
“玫瑰城”的沉寂从公元106年开始。
公元7世纪，伊斯兰教在阿拉伯地区东山再起。迅速波及西亚和北非地带。伊斯兰帝国日趋强大，最终控制了从西班牙到阿富汗的广大地区，阿拉伯人佩特拉区又成了伊斯兰帝国的一个小省。公元106年，佩特拉被罗马帝国国一图拉真占领。
图拉真生于西班牙的伊大利卡，随父在军中长大。公元89年成为军团指挥官。91年任执政官。97年任上日耳曼行省总督时被皇帝内尔瓦收为养子，成为帝位继承人。翌年即位后对内加强集权统治，对外奉行扩张政策。101～102年、105～106年两次发兵契亚，使沦为罗马一行省。106年占领纳巴泰王国，将它设为阿拉伯行省。后来图拉真于113年出征帕提亚（安息）。次年攻占亚美尼亚；后沿底格里斯河南下，吞并上美索不达米亚。116年图拉真攻陷帕提亚首都泰西封，直抵波斯湾。117年他在回师途中病死于小亚细亚的塞利努斯。
从公元前四世纪直至公元106年，到罗马帝国国王图拉真下令把它占领为止。此后300多年里，佩特拉的地位改变了，但它却继续存在下去，继续成长和发展。只是此时的佩特拉几乎处于被遗弃的地步。
几个世纪后，为了争夺近东控制权，伊斯兰势力与欧洲基督教各国间战争不断。佩特拉这座石城在十字军东征期间再次兴旺起来。欧洲十字军在该地建立起短命王国，把佩特拉作为他们的一个要塞，一直坚守到1189年。公元12世纪后，佩特拉再次被遗弃。
佩特拉为什么被遗弃一直是人们百思不得其解的问题。就算是它一度失去了对商道的控制权，但仍然可以幸存下来，那么为什么它又没有幸存下来呢？
史学家分析认为，导致佩特拉城衰亡的可能是天灾。公元363年，一场地震重击了佩特拉城。震后，许多建筑沦为废墟，房屋的主人们无能力或者无心思将它们修复，参加过发掘拜占庭教堂的ACOR组织成员日比纽·菲玛说：“沿着柱廊街道看看那些商店你就明白了。店主们嫌麻烦，不愿打扫清理碎石，宁愿在震倒的建筑前重建房屋……这是城市财富与秩序开始衰退的迹象。”公元551年，佩特拉城再次遭受严重地震，也许那次地震震塌了拜占庭教堂：随后教堂又受到震后蔓延全城的大火袭击，羊皮纸卷也就在火灾中被毁坏了。
佩特拉地震之说在历史中可以找到线索，然而令人不解的是，为什么许多城市都能在地震和火灾之后重建，而佩特拉却不能呢？
上世纪90年代初几位亚利桑那的科学家们认真研究过佩特拉的那些鼠、兔和啮齿类动物的贝冢。这一类动物都惯于收集棍子、植物、骨头以及粪便一类的东西。巢穴被它们的尿水浸透，尿中的化学物质硬化，便可形成一种胶状物质，防止穴中的东西腐烂。据发现，有的贝冢已有4万年之久，盛满了贝冢形成年代的植物和花粉的标本。他们发现在早期的纳巴泰人时代，橡树林和阿月浑子林遍布佩特拉四周的山地；然而到了罗马时代，大量的森林消失了。人们为了建房和获取燃料砍伐了大量的木材，致使林区衰变成为灌木林草坡带；到了公元900年，这种衰退进一步恶化，过分地放牧羊群使灌木林和草地也消失了，这个地区逐渐沦为沙漠。周围的环境再也无法为庞大的人口提供足够的食物和燃料时，城市就彻底消亡了。因此科学家们认定环境恶化是导致佩特拉衰亡的因素之一。
关于佩特拉的消失之说到目前还没有一个定论，但无论如何，有关佩特拉从史荫到伊斯兰时代的历史依然吸引着对历史深怀敬窟的人。正如英国诗人威廉贝根在《致佩特拉》中说：令我震惊的惟有东方大地，玫瑰红墙见证了整个历史。
1873年，亨利·谢里曼发现特洛伊和迈锡尼遗址后，把视线转向克里特岛。这座位于地中海东部的狭长岛屿在古希腊的文明演绎中发挥了举足轻重的作用，是另一个充满神话色彩的神秘之地。谢里曼根据《伊里亚特》史诗的线索找到了失落的特洛伊古城：他似乎也想通过神奇的传说找到克里特文明的异样的故事。他记得荷马在《奥德赛》中有这样一段对克里特岛的描写：
“在远处暗蓝色的大海上，浮现着一个岛屿，那就是克里特。可爱而富饶的土地的四周，拍打着一阵阵巨浪。岛上有90个人口稠密的城市……其中之一就是克诺塞斯……米诺斯王掌管大权，他与万能的宙斯神十分友好。”
神话中的米诺斯王是宙斯与他的情人欧罗巴所生，后来成为一位位尊四方的君主。他以强大的海军称霸爱琴海，并建立起规模宏伟的宫殿——克诺塞斯宫，从而揭开了灿烂辉煌的克里特文明的序幕。
相关的人物故事在希腊神话中有着详细的记载——欧罗马是脖尼基王国国王阿革诺耳的女儿，在王宫里深居简出。有一天半夜她做了一个奇怪的梦。她梦见世界的两大部分亚细亚和对面的大陆变成两个女人的模样，在激烈地争斗，想要占有她，其中一位妇女非常陌生，而另一位她就是亚细亚，长得完全跟当地人一样。亚细亚十分激动，她温柔而又热情地要求得到她，说自己是把她从小喂养大的母亲；而陌生的女人却像抢劫一样强行抓住她的胳膊，要带她去见宙斯。
欧罗巴醒来，心里极为慌乱，她想知道是哪一位神给了她这样一个温柔而神奇的梦，而梦中的那个陌生女人又是谁呢？第二天清晨，她和姑娘们一起到花园里嬉玩。她穿着一件十分漂亮的长襟裙衣，那是火神赫淮斯托斯为她特意制作的。欧罗巴穿上漂亮的衣服楚楚动人。她跑在同伴的前头，奔到海边的草地上。草地上鲜花怒放，格外芬香。姑娘们欢笑着散了开来，采摘自己喜欢花朵，有的摘水仙，有的摘风信子，有的寻紫罗兰，有的找百里香，还有的喜欢黄颜色60藏红花。欧罗巴也很快发现了她要找的花，她站在几位姑娘中间，双手高高地举着一束火焰般的红玫瑰，看上去真像一尊爱情女神。
姑娘们采集了各种鲜花，然后围在一起，坐在草地上，大家动孟编织花环。为了感谢草地仙子，她们把花环挂在翠绿的树枝上献给她。
宙斯为年轻的欧罗巴的美貌深深地打动了。可是，他害怕嫉妒成性的妻子赫拉发怒，同时又怕以自己的形象出现难以诱惑这纯洁的姑娘，于是他想出了一个诡计，变成了一头膘肥体壮、高贵而华丽的公牛。宙斯在变形前把儿子赫耳墨斯叫到跟前，吩咐他快把在山坡上吃草的国王的牲口统统赶到海边的草地去。赫耳墨斯立即飞到西顿的牧场，把国王的牲口从山上一直赶到草地，那正是欧罗巴和靖娘们快乐玩耍的地方。这样变成公牛的宙斯就混在国王的牛群中。
牛群在草地上慢慢散开，只有神化身的大公牛渐渐向欧罗巴靠近，这头与众不同的公牛不但漂亮健美而丑温顺可爱。欧罗巴和姑娘们被公牛的姿态所吸引，纷纷夸赞它的娴静和高贵，还用手温柔地抚摸它油光闪闪的牛背。公牛拟乎很通人性，它越来越靠近姑娘，最后，它依偎在欧罗巴的身旁。欧罗巴先是吓了一跳，但看到公牛驯服的样子又大胆地把手里的花束送到公牛的嘴边。公牛撒娇地舐着鲜花和姑娘的手。
姑娘用手拭去公牛嘴上的白沫，温柔地抚摸着牛身。欧罗巴越来越喜欢这头漂亮的公牛，最后壮着胆子在牛的前额上轻轻地吻了一下。公牛发出一声欢叫，随后温顺地躺倒在欧罗巴的脚旁，用温情的目光打量着她，并示意她爬上自己宽阔的牛背。
欧罗巴心里很激动，便壮着胆子骑上牛背，还把姑娘们编织的花环挂在牛角上。这时公牛从地上跃起，轻松缓慢地走着，把姑娘们甩出很远。当走出草地，公牛像奔马一样前进。欧罗巴还没有来得及知道发生了什么事，公牛已经纵身跳进了大海。
欧罗巴用右手紧紧地抓着牛角，左手抱着牛背。她非常害怕。回过头弦望着在远力的故乡，大声呼喊女伴们，可是风又把她的声音送了回来，海水在公牛身旁缓缓地流过，姑娘生怕弄湿衣衫，竭力提起双脚。公牛却像一艘海船一样，平稳地向大海的远处游去。
公牛驮着姑娘在水中游了整整一天。周围永远是无边无际的海水，可是公牛却十分灵巧地分开波浪，竟没有一点水珠沾在他那可爱的猎物身上。傍晚时分，它们终于来到克里特岛。公牛爬上岸后突然消失了。惊诧中的欧罗巴看到面前站着一个俊逸如天神的男子。男子告诉她自己是克里特岛的主人宙斯，欧罗巴了解到那头公牛的身份后恳求原谅。宙斯立刻向欧罗巴倾诉他的爱意，并称如果姑娘愿意嫁给他，他可以保护姑娘。欧罗巴答应了他的要求。宙斯邀请了四季之神为欧罗巴打扮，举行了盛大的婚礼。后来宙斯把欧罗巴最初到达的地方称作欧罗巴洲（欧洲）。
欧罗巴跟宙斯生了三个强大而睿智的儿子，他们是米诺斯、拉达曼提斯和萨耳珀冬·米诺斯和拉达曼提斯后来成为冥界判官。萨耳珀冬是一位大英雄，当了小亚细亚吕喀亚王国的国王。
为了躲避天后赫拉的加害，宙斯曾将欧罗巴变为牝牛，因此，他们的儿子米诺斯从不使用牝牛向神祭祀，此举触怒了神。神让米诺斯的王后与牡牛相爱，生下了牛首人身的怪物米诺陶（俗称米诺牛）。从此吃人怪兽米诺陶使克里特人陷于恐怖的漩涡。米诺斯决定请当时希腊杰出的建筑师代达罗斯在克诺塞斯宫内修造了一座迷宫，用来隐藏米诺陶。
当时雅典是克里特的附属国，米诺斯命令雅典王每年送7对童男童女到克里特岛，放入迷宫中喂养米诺牛。
这一年，又是供奉童男童女的年头了。有童男童女的家长们都惶恐不安。雅典国王爱琴的儿子忒修斯看到人们遭受这样的不幸而深感不安。他决心和童男童女们一起出发，并发誓要杀死米诺牛。
雅典民众在一片哭泣的悲哀声中，送别忒修斯在内的七对童男童女。忒修斯和父亲约定，如果杀死米诺牛，他在返航时就把船上的暴帆变成白帆。只要船上的黑帆变成白的，就证明爱琴国王能再见到自己的儿子忒修斯了。忒修斯领着童男童女在克里特上岸了。他的英俊潇洒引起米诺斯国王的女儿美丽聪明的阿里阿德涅公主的注意。公主向忒修斯表示了自己的爱慕之情，并偷偷和他相会。当她知道忒修斯的使命后，她送给他一把魔剑和一个线球，以免忒修斯受到米诺牛的伤害。
