湘军水师在田家镇一举焚毁太平军多年掠夺的四千五百多艘战舰，太平军水上力量近乎被全歼。但即使获此大胜一向心思缜密的曾国藩在奏折这样写道：“长江之险，我已扼其上游，金陵贼巢所需米、石、油、煤等物，来路半已断绝，逆船有减无增，东南大局，似要转机。”但紧接着就说，由于日前秦日纲只顾着跑路，保密工作没做好，我军截获其坐船，知道很多“内幕消息”，其中发现太平军凶悍桀骜太平军首领伤亡很少，所以如果我水军不扫清江面，那么这些人容易成为割据势力。如果肃清江面这些人又会四散奔逃，贻害四方。
所以请皇帝下旨命诸路大臣及各省巡抚，择要路驻守预防流寇作乱，这样我军就可以没有后顾之忧的“肃清江面，直捣金陵。
曾国藩这是让其他人都配合湘军作战，当然接连的大胜让他拥有这样的本钱。
12月8日湘军水师沿江而下，前队彭玉麟抵达江西九江，他遥望九江见到这样的景象，两岸仍然如前几次一样修筑许多营垒炮台，唯一的变化就是防守江面的战船仅有九艘，他想看来这次是难以立功了，因为对面就这几艘战船不可能出战，太平军不出击他们又怎么立功那？
另外此次，太平军依托两岸构筑的炮台来封锁江面，横江铁索木簰等物这还没来的修建。
六日后李孟群等后队赶至九江，亲自靠近巡视他发现太平军经过多日准备，南岸九江城外修筑炮台三座，近城处有大船六只，以及中、小不一的杂船十艘；北岸小池口亦有炮台三座，江心沙洲密排跑位的营盘一座，洲尾漂浮这数十丈长的横排，拦截江面，排上建有双层木城，每层安装火炮，在其周围有大战船数艘，杂船百余艘护卫木城。
湘军水师李孟群勘察好地形后果断出击，先是沿着南岸边开炮边想沙洲靠近，太平军很紧张的各路开炮据敌，但即将进入沙洲的射程时太平军炮都点燃了，湘军又掉头从北岸折返。前进后退皆向岸边太平军将士聚集处放炮。
李孟群利用战船进可攻退可跑的优势，结结实实将太平军戏耍了一遍，但是太平军也没脾气，毕竟他的炮台能移动啊，仅有的几艘战舰也不敢出击，就只能眼看着湘军接近又退后。
此战湘军用火炮在船上将岸上的太平军轰毙数十人。
在勘察地形回来的第二天李孟群坐长龙船督都司萧捷三，守备秦国禄、营州同俞晟等准备拿九江城开刀，太平军顿时慌乱应对，按照他们原来的设想太平军应该去攻击江心洲不应该来攻击他们，但是湘军来都来了就打呗。
一时间李孟群等人，便与太平军城上火炮和护城的二艘护城大船和十艘杂船，湘军水师弹无虚发，完成了压制太平军火力并全部焚毁太平军十二艘护城舰队。南岸得手后，湘军将目光投向了北岸沙洲太平军营地，李孟群先是率领想军水师言南岸顺流之下七八里从下游向上兜剿。
这就让太平军傻了眼，因为太平军的炮口都是朝前的，湘军水师突然绕后这使得太平军很多炮位没发挥作用，湘军水师从下游冲击，先是焚毁太平军二十艘战舰，其中太平军有一条快蟹做了放火措施，湘军是屡烧不燃，无奈之下湘军水师开始纷纷跳上该船，太平军拼死抵抗，直到其中湘军中一位叫麦保的人击杀了太平军头目，太平军才可使退却。
但是太平军的木牌大船依旧稳固如山，湘军拼死攻击这座木城。李孟群亦来督战，恰在这时一枚炮弹打在李孟群的坐船上，直接将李孟群身边的亲兵击伤，穿透舱板，击中守备何越的右脚，李孟群立即下令各队后撤回营。
在湘军后退之时，太平军炮火不停，撤退的湘军损失不少。
此战大战四时之久，烧毁太平军战舰四十多艘，击杀五六百人，但由于强攻沙洲营盘，湘军亦数艘战舰被击沉，人数伤亡不少。这在之前是没有如此大的损失的，可见湘军野战能力强，但是攻坚能力并没有那么强，此前之所以屡获大胜皆是由于太平军主动出击与湘军打野战所致！
