清初的三大疑案中，有一个是关于顺治皇帝出家为僧的，传说他遁入五台山数十年，康熙皇帝前去看望，他却不愿相认，更不愿还俗。但根据现有的史料，顺治并没有出家，他24岁那年因患天花而去世。
我本西方一袈裟，为何生于帝王家？
天下万事纷纷扰，不如空门补破衲。
相传这是顺治皇帝因其爱妃董鄂妃去世，悲痛欲绝，看破红尘，遁入五台山落发为僧前写下的诗。董鄂妃生前极受顺治的宠爱，她为顺治生下了皇四子，顺治将其立为皇太子。然而，董鄂妃却因顺治的过分宠爱而遭到皇太后和皇后的敌视。谁料太子出生仅三个月便夭折，董鄂妃精神遭受极大创伤，心情抑郁，加上皇后等人妒害，不出三年，她撒手人寰。悲痛的顺治下了一道圣旨，令全国为其服丧，并追封董鄂妃为“孝献皇后”。又过了百日，顺治也因接二连三的打击，忧伤过度，身体极度虚弱而染上天花，终因医治无效，于顺治十八年（1661）元月七日崩于养心殿，年仅24岁。
然而民间却一直传说顺治并没有死，而是失去了人生的全部希望，看破红尘，出家当和尚去了。民间盛传，顺治24岁那年，脱去龙袍换上袈裟，往五台山修身向佛，一直活到康熙五十年（1711）左右才圆寂。这期间，康熙皇帝曾经数次前往五台山觐见父亲，但顺治都不肯相认。清人吴梅村在其赞佛诗中也写道：“名山初望幸，衔命释道安……寄语汉皇帝，何苦留人间。烟岚倏灭没，流水空潺渊。回首长安城，缁素惨不欢。房星竟未动，天降白玉棺。惜哉散财洞，未得夸迎銮。”即是说顺治皇帝出家为僧，而朝廷只得假称皇帝驾崩，所谓“房星竟未动”，是指皇帝实际上没死。加上顺治帝的陵寝——清东陵孝陵内，埋葬的不是顺治的棺木，而是一个骨灰罐，也让人生疑。是不是因为顺治帝真的出家了，所以他的陵墓才不同于其他帝王的陵墓呢？这便是清初三大疑案之一的“世祖出家”。
顺治皇帝到底有没有出家？从现有的史料看，顺治没有出家，他的确24岁时死了，这不仅有官方的记载，还有当时在场者的直接证言。《清世祖实录》是这样记载的：顺治十八年正月初一，顺治帝免去群臣的朝贺礼仪，而且当日应该举行的春季第一月祭祀太庙的礼仪，也委派官员代之前往；初二日，顺治帝身体不适；初六日，顺治帝传谕，应该由自己参加的大享殿礼仪，因为身体不适，需要派官员代祀，让礼部列出代祀官员的名单，并且因为病情迅速加剧，又传谕赦免京城内十恶死罪以外的一切罪犯；初七日凌晨，顺治帝就去世了。
现藏于中国第一历史档案馆的《玉牒》，是清朝皇帝的家谱，其中记录顺治皇帝去世的时间，与《清世祖实录》中的记载完全相同。
顺治病危时，翰林院清孝陵掌院学士王熙奉命起草遗诏。王熙在其《王文靖集·自撰年谱》中记录了此事的详细经过：顺治十八年元旦，朝臣应援旧例庆贺朝见，朝廷突然下令朝臣免见，然而顺治却在养心殿破例召见了王熙，并赐座、赐茶。初二日，顺治帝自觉病情严重，再次召王熙进宫，并与他进行了长谈，直到晚上才出宫。初三日，顺治又在养心殿召见了他，并破例让他坐在龙床上，两人说话多时。初六日子夜，又召王熙到养心殿，对他说：“朕患痘，势将不起。尔可详听朕言，速撰诏书。”王熙退到乾清门下西围屏内，根据顺治的意思撰写遗诏，每写完一条，即呈送一条。共断断续续写了一天一夜，三次进览，顺治又三次改定，至七日傍晚总算修改完毕。当天夜里，顺治就去世了。
另据《青集》记载，正月初二，皇帝曾到悯忠寺观看太监吴良辅削发为僧的仪式。初四，九卿大臣到皇宫问安，方知顺治帝染病。初五，早朝的大臣们发现宫廷有些异样，庆祝春节的对联、门神已全部撤掉。初七晚，朝廷下大赦令，刑狱囚犯几尽一空，同时传令民间不要炒豆，不要点灯，不要泼水——这正是当时民间祈福天花患者的风俗。顺治死后，继位者是已经出过天花的康熙。这一切都表明顺治确实死于天花。
《清世祖实录》还记载，安放顺治帝遗体的棺材，于顺治十八年二月初二日被移放到景山寿皇殿，康熙皇帝即位后即前往致祭。四月十七日，康熙来到景山寿皇殿，在举行过百日致祭礼以后，将顺治的神位奉入乾清宫，以等待选择吉日奉入太庙。二十一日，则举行了“奉安宝宫礼”。“宝宫”即骨灰罐的意思。这说明，至四月二十一日，顺治已经被火化了。而至康熙二年（1663）四月二十四日，顺治的骨灰罐被启程移奉孝陵，同孝康皇后和端敬皇后的骨灰罐一起，被安放在地宫的石床上并掩上石门。
关于顺治皇帝被火化的详细记录，《旅庵和尚奏录》中写得很详细。顺治临终对近身的僧侣嘱托说：“祖制火浴，朕今留心禅理，须得秉炬法语……”表示祖制是火葬，而自己又信奉佛禅，所以希望也能火化入葬。旅庵和尚是宁波天童寺主持木陈忞的弟子，木陈忞应召入京时将他带在身边，一起为顺治宣讲佛法。顺治临终时还希望由茆溪森和尚主持火化，如果茆赶不到，则由位于北京的善果寺和隆安寺来主持。茆溪森是湖州报恩寺主持玉林琇的弟子，他对佛法的阐释曾深深打动顺治，并由此赢得顺治的信任。据《五灯全书》记载，茆溪森在接到旨意后立刻赶抵北京，于四月十七日一百天祭日这天，在景山寿王殿为顺治举行了火化仪式。茆溪森死后，他的门人编辑他的语录《敕赐圆照溪森禅师语录》，书中也记载了这件事。这些记录都与《清世祖实录》所记载的百日祭奠、逢迎神位和安放宝宫等完全吻合。由此可以断定，顺治确是死了，而根本不像民间传说那样出家了。
这样看来，关于顺治帝离宫出家、朝廷以其病逝为托词的猜度，只不过是一个充满想像力的传奇故事而已。但顺治皇帝生前曾经举行过皈依佛门的净发仪式，削发为僧却是事实。这件事情，在《大觉普济能仁国师年谱》、《旅庵和尚奏录》、《敕赐圆照茆溪森禅师语录》、《北游集》、《续指月录》等僧侣书籍中都有记录。这些着书立说的僧侣，都是应顺治之邀入宫阐释佛法的高僧，他们曾经与顺治皇帝有过非常近距离及密切的接触，而且在各自的着作中不约而同记录下相同的内容，说明此事的真实性极高，正因为如此，也普遍为今天的史学研究者所认可。
早在顺治的祖父努尔哈赤时代，藏传佛教就已传到赫图阿拉（今辽宁新宾西，1616年努尔哈赤即汗位建立金国时定都于此），在赫图阿拉建有佛寺，努尔哈赤还常手持念珠，表示对佛教的信奉。到顺治的父亲皇太极时，藏传佛教对金国已具有很大的影响。顺治的生母孝庄太后是蒙古族人，自幼便受到佛教熏陶，又年轻寡居，以信佛解脱内心的孤独与苦闷。在这样的社会环境下，顺治也很早就信奉了佛教。顺治不仅自己亲往佛寺向和尚请教佛法，并先后召见憨璞聪、玉林琇、木陈忞、茆溪森等和尚，让他们在宫里论经说法，顺治还给自己取法名“行痴”、法号“痴道人”。玉林琇称赞顺治是“佛心天子”，顺治则在这些和尚面前自称弟子，非常虔诚。
顺治曾经不止一次萌生剃度出家的念头。有一次，他对木陈忞说：“腾想前身一定是僧人，所以一到佛寺，见僧家窗明几净，就不愿意再回到宫里。要不是怕皇太后罣念，朕早就出家了！痛丧爱子，又失爱妃董鄂氏，顺治万念俱灰，决心遁入空门。据记载，他在短短两个月内先后38次访高僧馆舍，彻夜论禅。顺治还命茆溪森为他净发，表示要放弃皇位，孑身修道。茆先是劝阻，顺治却说什么也不听，于是便净了发。这一下孝庄太后着急了，火速叫人把茆溪森的师傅大觉禅师玉林琇召回京城。玉林琇回到北京后谆谆规劝，并命人架起柴堆，以烧死弟子茆溪森相要挟。顺治无奈，只好又留俗了。后来茆溪森作偈语说：“大清国里度天子，金銮殿上说禅道！”就是讲自己与顺治皇帝的特殊关系。
