在泽拉图和塔萨达尔的努力和牺牲下，最终战胜了虫族主宰。
在凯瑞甘和星灵联合意图杀死新主宰的时候和移除前往萨古拉斯的异虫时。
此时的三大种族已经元气大伤。
“一旦某个文明被发现，就必然遭到其他文明的打击。”
来自地球联合理事会的舰队前来要求接受泰伦帝国的移民地，为了防止异虫和星灵进攻地球，地球联合理事会选择前往科普卢星区并已经开始发展起来。
最强的上将杰拉德.杜加尔和他最好的搭档阿列克谢.斯托克夫对于科普卢星区的三个种族执行了三个策略。
对于星灵：平等外交，不入侵但会反抗入侵。
对于异虫：控制主宰，掌握这个残暴的种族。
对于人类：确立地球地位，推翻原有政权。
因为地球联合理事会没有基地补充，所以选择了以战养战的策略。
在后来为我们所熟知黑暗之神埃蒙的奴仆-萨米尔.杜兰亦或者纳鲁德博士的蛊惑下，偷到了泰伦帝国的武器图纸以及战舰。
在地球联合理事会的探测下发现了前联邦首都塔桑尼斯上面拥有灵能干扰器，可以干扰异虫的指令下达，这是对抗异虫的大杀器。
斯托克夫和杜兰在灵能干扰器上起了冲突，但是杜兰的一阵蛊惑将杜加尔上将相信了杜兰，不能让蒙斯克获得灵能干扰器。
斯托克夫依然防着萨米尔.杜兰，在最终拆除灵能干扰器时，派出了自己的幽灵部队将干扰器保存了起来。
时间已到，地球联合理事会舰队选择进攻克哈，轻易的战胜了泰伦帝国的防线。
但是蒙斯克最终被雷诺带领着的人类星灵混合舰队救出。
地球联合理事会舰队选择了追踪蒙斯克来到了星灵母星艾尔。
突破了异虫和星灵的防线，摧毁了雷诺的指挥中心。
雷诺带着蒙斯克用过折跃门逃走了，萨米尔.杜兰趁机背叛了地球联合理事会舰队放出大量异虫通过防线。
斯托克夫意识到了这一点，将杜加尔上将和杜兰安顿好之后，带着自己的舰队前往了布莱克西斯获取灵能干扰器。
萨米尔.杜兰看到了斯托克夫的表现后知道了不妙，萨米尔.杜兰在舰队上疯狂的说斯托克夫的坏话，并称其违抗了销毁灵能干扰器的命令。杜加尔上将犹豫再三后选择杀死所谓的“叛徒”。
最终杜兰杀死了斯托克夫。
杜加尔在斯托克夫死前了解到了真相，而杜兰则趁此机会赶忙逃跑。
恐怖的异虫冲进了布莱克西斯，但是斯托克夫的牺牲没有白费，在最后的关头，地球联合理事会舰队从异虫手中抢回了灵能干扰器。
地球联合理事会舰队此时前往查尔并利用灵能干扰器控制了查尔星球上的异虫，让舰队顺利的降临到了查尔。
地球联合理事会舰队通过专门针对脑虫和主宰的高能神经毒素控制了主宰以及守卫在旁边的三只脑虫。
此时，稳步推进的地球联合理事会舰队向地球发出了大胜以及控制并正在研究主宰的消息。
科普卢星区的三大种族此时在凯瑞甘雷诺和杜兰等人的推动下，联合在了一起共同反抗地球联合理事会。
而凯瑞甘利用雷诺和星灵摧毁了灵能干扰器，并与蒙斯克交易取得了灵能发射器，吸引并控制异虫。
这时三大种族在抢夺凯莫瑞安联合体的资源后发起了对克哈的进攻。
不成熟的主宰技术和失去灵能干扰器的地球联合理事会舰队节节败退，此时刀锋女王凯瑞甘背刺了人类和星灵杀掉了杜克将军和菲尼克斯。
利用控制的新主宰地球联合理事会舰队发动了对凯瑞甘的突袭，数以百万的异虫入侵了塔桑尼斯的高空轨道，但是不成熟的技术并没有对凯瑞甘造成很大的伤亡。
经此一役，凯瑞甘感受到了新主宰的威胁。
利用了星灵的凯瑞甘成功杀掉了新主宰。
最终，奇幻的战局变成了科普卢星区的人类与星灵们联合地球联合理事会舰队反过头来进攻凯瑞甘。
但是强大的凯瑞甘将地球联合理事会舰队完全消灭，无视了骄傲的杜加尔上将卑躬屈膝的乞求，另一边元气大伤的科普卢星区的星灵和人类选择了潜伏。
母巢之战正式落下帷幕。
地球联合理事会舰队在科普卢星区故事结束了，但是地球联合理事会的故事结束了吗？
显然地球联合理事会的野心并没有因此而收敛，而未来又会发生什么呢？
