1916年秋，府院冲突愈演愈烈，孙洪伊与徐树铮各不相让。支持孙的议员吕复、褚辅成等人在国会提出弹劾院秘书长徐树铮案，谓：“徐树铮为淮上鄙夫，略识之无，粗通军事，诩诩然自命为奇才”，实为“段总理之嬖幸及罪大恶极较刘瑾、魏忠贤尤甚，”等等。而拥徐的议员张伯衍、杨润等提出反对意见书，说：“徐在乡里，素重义气，颇近于豪侠一流，其幼年熟读书史，下笔千言，故一时文名大噪。弱冠投笔从戎，由日本士官学校卒业，后尤长于军事学识，自辛亥改革，段以军人领袖请愿共和迄去岁反对帝制，虽系段公卓识，亦徐君赞襄，密勿之力居多，是段公信任徐君之始，夫岂区区乡曲村夫，略识之无，粗通军事者所能肩此任哉”。双方一时唇枪舌战不止。
1917年3月，徐树铮组织安福俱乐部，用以掌控国会，曾直言不讳：“自民元以来，政府为国会操纵，闹得天翻地覆，曷若自个组织，简直和编军队一样，我有子弟，则操纵在我。”
1918年2月，徐树铮得知大批军械由日本驶抵秦皇岛，为总统冯国璋扩充直系部队所用。徐密电张作霖，事先筹划，周密部署，竟在冯国璋派来的接收军械人员的眼皮底下，倒挂车头，把一车军火驶往关外，落入张作霖手中。而段祺瑞对此举甚为不满，斥责徐树铮是“教猱升木。”而徐则应声答道：“长江三督（指的是江苏督军李纯、江西督军陈光远和湖北督军王占元。三人皆冯国璋亲信，段祺瑞准备武力平定西南时，长江三督却突然通电主和，导致北洋军内部分化。）升木，是谁教的他们？”竟让段祺瑞一时语塞，不知如何回答。
陆建章心狠手辣，杀人无算，人称“屠夫”。他要杀人，先请吃饭，酒席终了送客时，再将人从背后一枪打死，所以他的请柬，被称作“阎王帖子”。徐树铮在天津奉军司令部宴请陆建章，饭后约陆去后花园密谈，预伏卫兵将其打死。段祺瑞听说后也惊讶万状，半晌才说：“又铮闯的祸太大了，朗斋（陆字）千错万错，毕竟是北洋袍泽，他怎能如此乱开杀戒？”
张作霖与徐树铮因军队扩编事闹翻。某日，曾毓隽宴请张、徐于天津某军衣庄中，意在为张、徐作和事佬，座中陪客有杨宇霆等。酒至半酣，徐忽对张作霖说：“大哥你现在既有地盘，又有兵力，你不要逞强。我现在兵力单薄，不能征服你；我如实在不行，将来总有一天带日本兵打你。”徐树铮话一说完，举座失色。张作霖闻言，态度甚为冷静，急举杯对徐说：“老弟何至于此，我的兵不就是你的兵吗。干杯！干杯！”
1917年二三月间，总统黎元洪与总理段祺瑞裂痕渐深，“府院之争”势同水火。五月，黎免去段的总理职务。徐树铮赶回徐州，游说张勋，谎称张勋只要同意倒黎，段祺瑞就同意他复辟清室。徐以此为诱饵，策动张勋挥师入京后，将黎元洪赶下台。七月，张勋果真抬出溥仪，上演清朝复辟的闹剧。徐树铮对人说：“张勋是个复辟脑袋，先让他去做，我们的机会就来了。”于是又力助段祺瑞组织讨逆军，仅用十天便平息复辟。
张志潭曾做段祺瑞的秘书长，因王郅隆办永平一带盐务，张未按徐树铮的办法，致使二人交恶，为徐所深恨。段祺瑞在张勋复辟后复任总理，仍以张志潭为秘书长。徐在天津，即转电曾毓隽极力反对。曾向段说：“徐树铮最不满意他，还是不要他做秘书长。”段说：“我用秘书长，徐树铮不能过问。”徐树铮就给张志潭打电报叫他到天津。很多人劝张不要去，张考虑再三，决定当面去和徐解释。见面后，徐历数张志潭的大小罪恶，并问他：“以后改不改？”张答以改。徐又说：“段老总方面的事，你不许参预。”张说：“以后不参预。”这样俯首所命，徐只好让他回京。有人言：张稍微抗命，恐怕脑袋难保。
张志谭，字远伯，河北省丰润人。前清举人，曾任陆军部候郎中。1914年任绥远道尹。1917年任内务部次长。1919年1月任陆军次长。1920年任内务总长。1921年任交通总长。皖系失败后去职，隐居天津。
陈调元曾回忆说，某次他到北京办公事，在朋友做东的宴席上遇到徐树铮。经朋友介绍双方认识后，徐树铮即表示看到他的公文了，同时指出他是要求补充多少枪、多少发子弹，及要多少军饷等。陈调元听罢大惊，觉得自己都没对方记得那么清楚。几天后，陈调元到陆军部拜访徐树铮。只见徐树铮一边批公文，一边与他谈话，中间电话响起，又拿起话筒。陈调元不自觉地把话停了下来，但徐树铮告诉他：“没关系，你继续说。”经过这次交往，陈调元确信徐树铮真有五官并用之能。
陈调元(1886－1943)，字雪喧，河北安新人。保定陆军军官学校毕业，历任宪兵营长、第47旅旅长、江苏第五混成旅旅长、徐海镇守使等职。1923年任安徽督军，后投奉系，任第六师师长，1925年任皖军总司令、安徽督办。率部参加国民革命军，任第37军军长、第一集团军第二军团军团长、山东省主席。
1919年3月徐树铮母丧，回家守丧只过了头七，便被大总统徐世昌急电召回。徐树铮送灵到醴泉村，返徐州当晚便回京供职，临行前去和大哥徐树衔话别，因见大哥正横在床上抽鸦片，徐见状，一声不响走近床前，把玻璃灯罩轻轻取下，然后把黄铜烟灯座和鸦片烟枪往地上一摔，出门上车就走。徐树衔追到门外跳脚大骂，嚷着要闹到北京大总统府告他“犯上作乱”。
1919年春，日本也垂涎外蒙，想组成一个由其控制的“大蒙古国”，外蒙的王公们深怕日本，便又想重新依附中国。六月，中国政府任命徐树铮为西北筹边使、西北边防军总司令。他前往库伦（今乌兰巴托），终于使库伦当局同意撤消独立，复归中国。徐树铮除向政府报告外，还将此事电告正在上海的孙中山。孙中山复电说：“比得来电，谂知外蒙回心内向。吾国久无班超傅介子其人，执事（指徐）于旬日间建此奇功，以方古人，未知孰愈？外蒙纠纷，亦既七年，一旦归复，重见五族共和之盛，此宜举国欢欣鼓舞者也。”
1919年10月，徐树铮率领中国东北边防军第一师，计步兵二旅，骑兵一团，挥师出塞，向库伦进发。徐定谋于“柔不可守”，“弱者示以强”，虚张声势，效仿孔明增灶，一路上旌旗招展、大肆张扬，自谓作左宗棠收复新疆之第二，直取库伦。
直皖大战中，直军在长辛店获胜进逼北京城时，徐树铮乘坐乌佛兰敞蓬汽车，出北京宣武门，至其主持的殖边银行提取现款，转赴琉璃厂书店还欠，时直军瞬将入城，店主惊愕，频说此等小事，何劳总司令大驾，徐笑说：“此刻不来还，就成倒帐。”待赶至东交民巷，直军已追踪而来，徐即避入日本使馆。
直皖大战结束，吴佩孚即电令警察总监吴炳湘，缉拿祸首，计有徐树铮、段芝贵、曾毓隽、朱深、梁鸿志、姚震、姚国桢、李思浩、王郅隆、丁士源等人。吴炳湘本与段派接近，又与徐树铮私交甚笃，以未奉政府命令为由，拖延两日，使被通缉之人均由日本使馆以政治避难为由，送入日本兵营加以庇护。但徐树铮进入日本兵营后，却急于脱身南下，联络皖系剩余势力，以图雪耻复仇。徐备了一个日本人装行李用的大号柳条筐，蜷伏于内伪作行李，让两个日兵抬到车站，进入三等车箱，由日兵看守，凌晨车抵天津站后，方出筐外，盖蜷缩于柳条筐内已逾三个小时。
1921年12月4日，孙中山以非常大总统名义，在桂林组织大本营，准备出师北伐曹锟、吴佩孚。12月25日，梁士诒在张作霖的支持下组成内阁。为了抵制直系对他的控制，对直皖战争后被通缉的皖系要员实行大赦。徐树铮收到隐居天津的段祺瑞给他的密电，让他南下与孙中山商谈孙、段、张三方联合，共同对付直系一事。徐接电后于次年1月1日赴广州，时孙中山正在桂林，孙委派廖仲恺、汪精卫、******为代表与徐树铮会谈。1月3日，徐树铮又前往桂林拜会孙中山。未到之前，孙中山曾写信给******说：“徐君此来，慰我多年渴望。”二人见面后晤谈融洽，徐树铮对孙中山十分倾倒，孙对徐也非常赏识，甚至希望他能留下来作自己的参谋长。徐只好委婉地表示：我在北方帮助孙先生，会比在孙先生身边帮助更大。
孙中山督师北伐，驻节桂林，徐树铮受段祺瑞之命，往商同盟之策。孙中山召集护法各省首脑会议，陈炯明独不往，徐心知有异，私下对马君武说：“孙公祸将不久了！”徐乃匆匆北返，不久，陈炯明部叛变。
徐树铮操一口地道的徐州话，家中所雇男女仆人也都一律说徐州话。每日必有一顿饭要吃徐州烙馍，开始由夏夫人来做，后换成从徐州雇来的女佣。吃烙馍时卷的几种家常菜有：黄豆芽烧粉丝、萝卜丝煎的萝卜鱼、馓子加辣椒酱或椒盐大葱。每次在家里吃到这些饭食，却谓胜过山珍海味。
徐树铮天赋极高，又勤于苦读。他回忆幼年时说：“父设帐郡城，伏腊归省，闲以树铮往来。尝于风雪中，攀附驴背，口授诗歌，亦戏令效其句。”
徐树铮年少聪颖，精书法，擅长诗词古文，从政后仍手不释卷，对桐城派大师姚鼐的《古文辞类纂》爱不释手，总是随身携带，以为经国大计、治事律身之道都可在书中找到。余暇所交往的人，有前清状元张謇、国学家林琴南、柯绍忞、马通伯，王晋卿等人，均为饱学宿儒，一时俊彦。
徐树铮曾赋《谢龚郅初赠倭刀》一诗，其武健本色显露无遗，诗云：横海归来壮，风云变态多。宝刀堪赠我，世事竟如何？击楫会宵舞，逢人莫浩歌。为君勤拂拭，明日斫蛟鼍。
徐树铮用人，须是学有所长，能胜任职守者。他的二哥徐树鐄，看到张伯英去北京任职，心想外人你都能给官做，自己的哥哥还有什么说的。于是电告徐树铮，他也要择日进京。徐知其兄文不能文，武不能武，除了抽大烟没别的本事。于是急电山东督军靳云鹏，让他设法将二哥留在济南，万勿使其入京。靳云鹏忠于所托，在济南车站接来徐树鐄后，命手下军官轮流陪他，遍游济南的风景名胜，并由督军府出钱，换着馆子宴请他。盘桓两月，实在找不出理由再留他，只能眼睁睁地看着徐树鐄上了北去的火车。
张伯英（1871—1949），字匀圃，号云龙山人，祖籍浙江绍兴，出生于徐州。受业于徐葵南，并与其子徐树铮同窗。1914年，被徐树铮聘为陆军部秘书，1924年任北京临时执政府副秘书长，徐树铮遇刺后辞职，不再涉足政坛。
徐树铮正在北京家中剃头（徐历来留光头），刚剃了一半，只听门房来报，说是二大人到了。徐树铮一听，顾不得头没剃完，拔腿就跑，找个地方藏了起来。徐州老一辈人提起这事就当作笑谈，说徐树铮宁愿剃个阴阳头，也不给他哥哥找官做。
曾毓隽说过：“大徐（指徐世昌）最怕小徐，但有时亦爱小徐，且想利用小徐，而小徐终其身，只接受其怕，不接受其爱，更谈不到利用。而合肥则不然，能使小徐终其身不见其爱，只见其信任。不见其怕，更不见其利用。信任矣，爱何加焉。利用矣，怕必随之。然则大徐之智出合肥下矣。”
国史馆总纂王晋卿评徐树铮：“其论文导源班、马，而以唐宋八家为正宗，以近代方、姚为入门之的。诗嗜少陵，词嗜白石、梦窗。”徐树铮留下来的诗大约200首，词60首。他带兵收复外蒙时，在库仑写下的一首《念奴娇1笳》：砉然长啸，带边气，孤奏荒茫无拍。坐起徘徊，声过处，愁数南冠晨夕。夜月吹寒，疏风破晓，断梦休重觅。雄鸡遥动，此时天下将白。
遥想中夜哀歌，唾壶敲缺，剩怨填胸臆。空外流音，才睡浓，胡遽乌乌惊逼。商妇琵琶，阳陶觱篥，万感真横集。琱戈推枕，问君今日何日？
1923年9月，张勋病故，徐树铮撰写一副挽联：
仗匹夫节，挽九庙灵，其志堪哀，其愚不可及也；
有六尺孤，无一抔土，斯人已死，斯事谁复为之？
