里甲之编成并未破坏自然村落的社会结构，也未强迫户口从此地搬到彼地，以补充110户的需要。理论上，里甲的编成建立了一个新的乡村结构，不管自然乡村的范围有多大，都把民户每10户组成一甲，10甲组成一里。但是这仅仅是为了赋税之征收、劳役之分配及地方上治安之维持而设立的一种无形的组织。实际上，里甲制并没有改变地方自然乡村的社会结构。上面曾经谈到全国各地，里的名称有不同的称呼，可以证明里甲制的设立不得不与地方上的自然环境妥协，进一步更可证明里甲制并未破坏自然乡村的社会结构。
里甲制设立之后，明太祖为了教化的目的，又在里甲之内设立了老人制。敬老尊贤是中国传统的一种美德，历代的地方官也常常请教这些老人来解决地方上的纠纷。明太祖很重视这些老人所扮演的角色，所以在洪武二十七年（1394年），设立了老人制。规定在里甲之内，凡年龄在50岁以上，有德行、有见识，而为大众所敬服者，每里推选3名、5名或10名为老人，负责解决地方上的纠纷，督导人民勤务农桑，并且劝告人民遵守“孝顺父母，尊敬长上，和睦乡里，教训子孙，各安生理，毋作非为”等六论之教训。这种劝人为善及勤务农桑的职责，有点像元代社长的任务。但是明代的老人的权力比社长大，他们拥有些微小的司法权，可以处理地方上的小争端。明太祖对老人也相当礼遇，常常召见这些人。有功的老人，也常给予出仕的机会。明太祖可以说是历代帝王中最重视老人教化功能的一位皇帝。
除了里甲之外，明代又有乡约及保甲的组织。明代的乡约与宋代并无太大的不同，不再赘述，在此仅谈保甲组织。明代政府因有里甲制，所以未行保甲制。但有些地方官，为了治安的需要，仍然组织民众，以保卫乡里，王守仁就是其中的一位。明武宗正德十五至二十年（1517~1520年）之间，王守仁平朱宸濠之乱时，曾经设立10家牌法。规定10家注册成一牌，每天轮流由1人持牌，调查10家之内有无可疑之人，随时向地方官报告。不过，这种保甲组织仅仅是地区性的组织，并未遍及全国。所以明代地区性的保甲制与宋、清两代在全国实施的保甲制有很大的不同。到了清代，不仅把宋以来的保甲制施行于全国，甚至把乡约法及里甲制也实施于全国各地。
