此时，阮氏旧恨已雪，位列九卿，志得意满，正是大展宏图之际，却“居数月，复乞归”。为什么呢？阮的狡猾的确超乎同辈。在魏忠贤炙手可热之际，他就敏锐地意识到魏的不足恃，深知权阉不长久而阉人常有，魏阉这棵大树暂栖尚可，久住必祸及自身。因此，他事魏极其谨慎，迫害东林党人也往往暗中下手，而不明火执杖。同时，每进谒，常常厚贿魏阉门人，以笼络感情，培植亲信，便于及时了解情况。天启七年八月，熹宗死，朱由检继位，开始疏远魏阉。不准造生祠，下令停刑，这无疑是今信号。阮自知罪不容诛，魏一倒台，万难保全，便再次乞归，蛰伏避祸。果然不出其所料，同年十一月，魏阉途穷自缢。
炽则借，败则攻，是一切奸佞的惯技常态。为洗脱自己，为邀新宠，魏死后，阮竟送两疏给死党杨维垣：一疏专劾崔、魏；一疏以七年合算，并劾崔、魏与东林，谓天启四年后，乱政者魏而翼以崔，四年前乱政者王安，而翼以东林。并向杨密授机宜：如果时局大变，东林得势，就上劾崔、魏疏；若时局不明朗，就上合算疏。时值杨维垣并参东林与崔、魏为邪党，与编修倪元璐闹对立，接阮疏大喜，于是投合算疏。此举更可洞见阮贼之奸险。为保全自己，不惜以怨报德，对旧主子落井下石，而自家失势还不忘咬东林一口，期望两败俱伤，绝东林日后报复之门径。
阮贼以退为进的策略果然奏效，崇祯元年，阉党如覆巢之卵，阮却获新宠。被召为光禄寺卿。幸亏御史毛羽健上疏弹劾，才罢其官，列入“逆案”，而这个应斩之贼仅仅受“终生不得录用”的轻罚，真是苍天无眼，阮某有幸！
