文明十八年（公元1486年）元夜寅时上刻（3时左右），头戴乌帽子、身披甲胄、外罩素袄的钵屋贺麻党一行，高唱万岁、敲着太鼓，来到了月山富田城下。因为这是每年的惯例，城兵未加详细盘查就放他们进城了。贺麻党中隐藏的尼子经久及其部下一进城就四面放火，然后突然袭击前来救火的城守兵。月山富田城中大乱，盐冶扫部介自杀——就这样，仅仅被追放3年后，尼子经久重新成为月山富田城主，时年为29岁。
阴阳一太守
取得月山富田城的尼子经久，开始重新征服云州的战争。此时，摆在他面前的最大障碍，就是威望素著并且实力强大的三泽氏。尼子经久击垮三泽氏的经过，也许经过后人的反复渲染和加工——因为，实在是太过精彩和戏剧化了。
尼子氏复国的第一功臣山中勘兵卫因为顶撞尼子经久而被判死罪，狼狈逃往三泽氏的领地。经久大怒，将勘兵卫的妻子和老母下狱牢系。勘兵卫出仕三泽氏，前后两年，忠勤无匹；两年后，他向三泽氏家督为国哭诉经久的残暴，说：“请求借给我一支兵马，潜向月山富田，城内有我的故交，里应外合打开城门，就可以救出我的家人，也能给尼子氏以沉重打击。”三泽为国大为感动，将大半兵马交付给他。勘兵卫统兵来到富田近边待机，暗中通知尼子经久，经久立将1千兵马来迎，并于敌后安排埋伏，前后夹击，三泽军大败。不久以后，经久又进军包围了三泽氏本城，主力尽失的三泽为国被迫出城投降。
三泽氏既已降伏，其他的国人领主，如三刀屋、赤穴等，都先后归降尼子经久。经久很快就重新平定了出云，并开始向外扩张。
就在尼子氏势力逐步扩大的时候，其主家京极氏却已经走到了灭亡的边缘。京极家督政经与其弟高清争夺近江守护失败，逃到出云，于永正元年（公元1504年）去世。政经死前，把嫡孙吉童子丸托付给尼子经久和多贺经长。吉童子丸尚幼，经久很快就把出云守护的头衔握到了自己手里（一说到其孙晴久的时候，尼子氏才正式得到这一职衔）。
当时西国最大的势力，乃是大内义兴。尼子经久在安艺诸豪强的帮助下，逐步扩展势力，欲与大内氏一较短长。永正九年（公元1512年），经久命令备后松永的古志为信牵制大内进军。5年后，趁着大内义兴入京的机会，他亲统大军，从备后山内方面南下；与此呼应，备中新见国经开始向美作进军，伯耆的尼子久幸（经久弟）进军牵制大内方各国人领主，安艺守护武田元繁从大内氏侧背展开扰乱行动，濑户内海由杉内氏击破大内水军。等到大内义兴匆忙赶回防、长，局势已经变得几乎不可收拾了。
在此前的永世十年（公元1513年），尼子经久与嫡子政久一起进攻大原郡阿用城的樱井宗的。因为敌方城池坚固，经久决定采取长期包围的策略。政久恐怕将兵在外，士气低落，每夜在城下吹笛，此事被樱井宗的探知，事先准备好大弓，某夜引弓一发，正中政久咽喉。尼子政久当场毙命，年仅26岁——后来武田信玄夜听吹笛被铁炮所伤的传说，怀疑即此事的附会。
大永元年（公元1521年），大内、尼子双雄在石见展开大战，胜负的关键乃是石见国吉见、益田、福屋等有力的国人领主之向背。这些国人好像墙头草一样来回摇摆，经久此次决定干脆强攻，一举解决这一问题。首先，尼子经久攻击都治骏河守的今井城；次年（公元1522年），又攻克福屋一族的乙明城。大内氏派遣的援军与尼子氏得胜之师在滨田决战，难分胜负，只得议和退兵。
而此时在山阳道方面，大内氏名将陶隆房攻克安艺武田氏的镜山城，已故的武田元繁之后继武田光和再次臣服于大内氏。安艺豪族毛利元就在判断了双方实力后，决定背叛大内氏，跟从尼子经久，复夺镜山。元就施计，说降了城将藏田房信的叔父，终于使尼子方大获全胜。经过此战，尼子经久看到了毛利元就智谋的可怕——虽然当时还预料不到，辉煌的尼子家族将会覆灭在此人手上……
且说尼子经久，当时掌握着山阴、山阳两道十一国守护职，人称“阴阳一太守”。尼子的最盛期在他手上，衰亡的发端也由他开始。他曾将盐冶的3千贯领地分给三男兴久，兴久贪得无厌，更要求加增家老龟井秀纲的七百贯领地。秀纲听闻此事，在经久面前屡进谗言，尼子兴久惶恐之下，遂于天文元年（公元1532年）揭起叛旗。父子双方在佐陀城交战，兴久战败，重臣米原小平内、龟井利纲等均殁于阵。兴久逃依岳父、甲山城主山内直通，尼子经久派黑正甚兵卫追击，包围甲山，迫使兴久自杀。
经此内乱，尼子氏势力衰退，安艺国的有力国人领主，熊谷、宍戸等先后被毛利氏怀柔，山内直通等因怨恨尼子经久杀子的行为，也联络了三吉、多贺山等家族降伏于毛利元就。天文五年（公元1536年），尼子军展开反击，一口气攻克备后、安艺、石见等各处叛反旧领。诸战中，经久嫡孙尼子诠久奋勇当先，甚至突入美作国，掳得大片土地。于是次年，经久将家督之位让于诠久，自己退居二线——此时经久80岁，诠久24岁。
尼子诠久（后改名晴久）乃是一位豪勇之将，他即位初，就从大内氏手里夺回石见银山城，随即击破播磨守护赤松政村，并将之放逐，又攻克别所就治的三木城，所向披靡。天文八年（公元1539年），尼子晴久计划讨伐重归大内的毛利氏。他不顾诸将反对，准备倾重兵杀向安艺吉田郡山城。叔祖尼子久幸急忙跑去和病榻上的经久商议，经久唤来晴久责问，但晴久只用“臆病野洲（久幸任下野守）”一句就冷冷地顶了回去。
郡山和富田的合战
天文九年（公元1540年），“新宫党”尼子国久统率3千兵马，通过备后入侵安艺，但在犬饲平战役中遭到宍戸一族的顽强抵抗而败退。尼子晴久斥退国久，自为统帅，进攻安艺的毛利势。他命久幸、国久等一门众，召集云、石、耆、幡、作、备中诸国共3万大军，几乎倾巢而出，誓将毛利氏一举踏平。
毛利氏当主元就得报，急忙收拢军队，有众8千，准备凭坚固守，同时派遣使者向大内氏求救。九月六日，尼子军杀入石州口，放火烧尽了城下町，随即包围毛利氏的主城吉田郡山。十二日在大田口方向展开激战，尼子方本城信浓守、高桥元纲战殁。二十三日，尼子晴久中了元就的反间计，放弃要害风越山，而将本阵转移到青山、三塚山一线。
大内氏发兵救援安艺，二十六日，尼子侍大将汤原宗纲为先阵攻击大内军，遭到毛利军出城夹击而惨败。宗纲丧生，留下“腹切岩”的古迹。
眼看形势不妙，十月十一日，尼子晴久以一门众诚久为先锋，向吉田郡山城发起总攻。毛利元就放弃笼城，出兵在土取桥与敌决战。双方正在激斗，元就又出奇计，伏兵蜂起，尼子军几近崩溃，大将三泽为幸等为保护尼子晴久而当场战死。晴久被迫后退，战局再度陷入胶着状态。十二月三日，大内氏名将陶隆房率援军一万前来相助，笼城方士气更为高涨。
次年（公元1541年）正月三日，最终决战开始了，毛利、大内联军反复突入，火烧尼子军阵屋。十三日，联军猛将吉川兴经统率3千兵马奇袭驻扎在长尾地方的尼子军阵，守将高尾丰前守战死，黑正甚兵卫亡命奔逃。陶隆房趁着尼子诸军前往救援长尾的机会，突袭尼子本阵。尼子晴久已经做好了战死的准备，多亏叔祖下野守（就是被晴久斥骂为“臆病野洲”和“尼子比丘尼”的尼子久幸）的苦谏才被迫撤离。久幸欣慰地看主君安全离去，才率深野房重等十数骑直冲陶军，力尽而亡。久幸用兵谨慎，也有“避战将军”之名，素来被晴久等年轻武士视为胆怯——战阵之上，何者为勇，何者为怯，尼子晴久就算现在明白过来，也为时太晚了……
尼子败兵在寒冬的深雪中一路败逃，尼子久幸的首级也无人捡回。毛利、大内联军乘胜扫荡整个安艺，臣从于尼子氏的各国人领主纷纷败亡。病榻上的尼子经久闻听败讯，终于再也支撑不住了——殁于是年十一月十三日，享年84岁，和父亲清贞同葬于洞光寺中。
尼子大军败退，毛利元就乘胜追击，攻克佐东银山，城主武田信实逃往出云——一直夹在大内、尼子两个大家族中间左右摇摆的安艺守护武田氏至此灭亡。
一年以后，即天文十一年（公元1542年），甲斐的武田晴信吞并诹访的同一年，陶隆房鼓动大内义隆远征出云，一举扫平尼子残党。大内方总兵力15万，包括毛利、小早川、吉川等安艺豪族，浩浩荡荡向东方杀去。然而大军行进迟缓，三月集中于石见，七月才攻克赤穴光清的赤穴城。十一月，风雪大作，大内义隆将本阵设在马泻的正久寺，而毛利元就父子则在白泻地方安营过冬。
次年（公元1543年）二月，冰雪融化，大军继续前进，大内义隆本阵向经罗木山移动，毛利元就父子直取月山富田城，进出要隘菅谷口，并在莲池绳手地方击破尼子军。
对应大内氏的进攻，已经无力反击的尼子氏遂开始采取分化瓦解策略。四月末，大内方的数家强力豪族，包括三泽、三刀屋、本城等，甚至还有毛利元就的外甥（同时也是妻甥）吉川兴经，都一起背叛大内家，而将军队开入月山富田城，协助尼子势防守。眼看双方的胜负天平突然倾斜，大内义隆无奈，只得仓皇撤军。尼子军于后掩杀，大内军大败亏输，而只有经石见路归国的毛利元就因为防护得当，未受大损，安然撤回居城吉田郡山。
三年内两次大战，进攻方全都铩羽而归，损失惨重，夹在两大势力间的毛利氏反倒趁机稳步壮大。“濑户内智将”毛利元就即将转守为攻，创造比大内氏和尼子氏更为辉煌的业绩！
