沙皇俄国本来和中国并不接壤。直到1632年扩张到达勒拿河时，才听说有黑龙江地区存在。他利用清兵入关、后方空虚的机会，侵入黑龙江流域，残酷屠杀中国人。
康熙皇帝刚刚平定了三藩之乱，又听到了沙俄军占领黑龙江北岸尼布楚、雅克萨的消息，内乱已平，外患又至，康熙决定连续作战。
经过一段时间的勘察和部署，征讨沙俄侵略者的准备工作基本就绪。
有战争就会有牺牲。康熙皇帝并不愿意看到血淋淋的凄惨情形，于是他派人送信给俄国沙皇，表示愿意和平解决两国争端。沙皇迟迟不予答复，而且向雅克萨大量增兵。这一表现令康熙皇帝很气愤，他只好发布了进攻的命令。
1685年，康熙皇帝派彭春为都统，率领水陆共15000人浩浩荡荡兵发雅克萨，把这个并不太大的小城围了个水泄不通。
雅克萨城堡修得十分牢固，如果强行进攻，必定代价惨重。彭春观察地形之后，果断做出了佯攻巧取的作战方案。他首先命令士兵在城南筑起了一座土山，然后让将士站在土山上往城里放弩箭。城里的沙俄军顿时慌乱起来，以为清兵要从城南进攻，就把大部分兵力拉到了城南。城里城外对攻起来，战斗并不激烈。
这时候，彭春正指挥清兵主力悄悄移到了城北，乘这里防守空虚，突然向城里轰起炮来。炮弹呼啸着飞向城里，在各处炸响，城楼被炮弹击中了，燃起了熊熊大火。彭春又命令士兵在城下堆起了柴草，准备以火烧城。柴草刚刚堆好，就见城头上伸出了白旗。
沙俄军投降了。
彭春下令停止攻击，并按照康熙皇帝事前的嘱咐，把弃城投降的俄军全部释放回本土。
不多久，遭到惨败的沙俄军听说清兵回师的消息，又卷土重来，溜回雅克萨，重新实施他们的侵略行动。
康熙帝得知后，恼怒万分，下令全力征讨侵略军，并要求将其彻底消灭。
1686年，第二次自卫反击战中，清军的炮火打得更猛，将士的表现更为英勇，侵略军头目托尔布津被击毙，沙俄军眼看就要身遭灭顶之灾。
沙俄政府胆怯了，慌忙派使者要求和谈。
康熙皇帝见教训沙俄的目的已经达到，便下令停止了攻城。
雅克萨战争的胜利，大长了清朝政府的威风。经过谈判，双方签订了第一个平等的《中俄尼布楚条约》。
韦小宝攻雅克萨
著名武侠小说家金庸的《鹿鼎记》中韦小宝攻雅克萨城，因雅克萨工事坚固，炮轰无太大效应，何佑率一千军士攻城，反而死了三四百人；萨布素攻城，反为火枪所伤，幸被林兴珠救回，挖地道又给俄军发现，且冬天已到，攻城之灾表露无遗。原本韦小宝用水龙将热尿射向城头，只是气愤胡闹，却因此妙计陡生，想出“水漫雅克萨，冰冻鹿鼎山”，以“白龙水炮”不费一兵一卒取下了雅克萨。
《尼布楚条约》共分6款，明确规定了中俄两国的东段边界，从法律上肯定了黑龙江、乌苏里江流域的广大地区是中国的领土，俄国将其侵占的一部分领土交还中国；与此同时，俄国通过条约将中国让予的贝加尔湖以东尼布楚一举纳入它的版图，将乌第河与外兴安岭之间的地方划为待议地区，并获得重大的通商利益。
