他先用三天时间重游了灵峰寺、天聪洞、大龙湫等名胜。然后沿小路登雁湖冈。这条路并不险峻，一边是山，一边是海。随着地势的升高，但见东海就在足下。抵达山顶时，可以看到山脉是由东北方最高的地方延伸过来，然后分为四支，四支山脊隐隐隆起，在它们之间低洼之处形成三个洼地。这些山脊都已风化成土，另有横贯南北的山脊隆起，于是将三个洼地分成六个洼地，洼地积水成池。长满青草，即为雁冈湖。
可是，徐霞客发现，无论雁冈湖水向南还是向北流，都与大龙湫风马牛不相及。那么，大龙湫之水到底来自何处呢？
五月初四，徐霞客由连云嶂的左边，经道松洞向右拾级登山，直攀常云峰，发现绝顶南面和常云峰以北夹峙的山涧，即是大龙湫的源头。
霞客存于心中几十年的疑窦终于解开了，他纠正了《大明一统志》
中“大龙湫之源是雁荡湖”的错误，并指出了雁荡山各水源的来龙去脉。
从雁荡山回来后，徐霞客又去拜访故友陈函辉，向他叙述了在雁荡山的发现，让老友一起分享他成功的喜悦。
踏破铁鞋访名岳
在中国的名山当中，要以“五岳”的声名最大，向有“五岳归来不看山”之说。五岳即东岳泰山、西岳华山、南岳衡山、北岳恒山和中岳嵩山。
徐霞客对五岳名山心仪已久，早想一睹为快。除了五岳名山之外，他的游山计划中，还包括佛教圣地五台山、峨眉山，道教圣地太和山，风景绝佳的黄山、庐山等。他曾拟定一个非常宏伟的旅游路线，但因老母年事已高，心有所系，而不得不将行程缩短。
在五岳之中，他率先拜访的是东岳泰山。
徐霞客在22岁初访太湖之后的第三年，即万历三十七年（1609年），不远千里，北上游历齐、鲁、燕、冀地区（今山东、北京、河北）。这次旅行的重点在于游览泰山并参拜孔林。
泰山位于华北平原东侧，今山东泰安县境内。它四周皆为平原，宛若擎天一柱，突兀拔起，直插云天，巍峨雄壮，令人叹为观止。
泰山因地处华夏文明的中心，故被称为“五岳之首”，在五岳名山中地位至尊。历代君王都要到这里“封禅”，举行浩大的仪式。泰山的名胜古迹数不胜数，像岱宗庙、南天门、玉皇顶都是天下闻名。
徐霞客到泰山后，见其雄伟壮观不同凡响，果然名不虚传。泰山雄中藏秀，秀中藏奇，美不胜收。霞客沿十八盘径登泰山绝顶，大诗人杜甫曾写诗盛赞这里“造化钟神秀，阴阳隔昏晓”。从山顶往下看，齐州九点烟，隐隐入指掌间，真有“一览众山小”之感。
下泰山后，他到山东曲阜参拜孔林。这里埋葬着封建社会的圣人，孔子和他的后代，累累的墓冢之间，碑碣林立，石仪成群，遍植数以万计的参天古木，肃穆森严，是古代读书人心中的圣地。然后，徐霞客顺便访问了山东邹县，这里是着名思想家孟子的故里。孟子在封建社会被称为“亚圣”，地位仅次于孔子。霞客参拜了孟庙，并登临邹县的峄山。这座山并不太高，相传孔子曾登临此山东峰——冠子石，有“登峄山而小鲁”之说，所以也比较有名。
相隔十四年之后，即天启三年（1623年），徐霞客才又一次向五岳进发，这次游览的是中岳嵩山、西岳华山，又向南抵达道教圣地太和山（即武当山）。
中岳嵩山横亘中原大地，属伏牛山系的一支，主峰在今河南登封县境内，余脉东及密县。它由两部分组成，东部为太室山，西部为少室山。“两室相望如双眉，然少室嶙峋，而太室雄厉称尊”（徐霞客语）。太室山雄伟庄严，少室山瘦削险峻。太室山有多处洞穴，为古代道士修道和隐士避世之所，还有汉、唐建筑多所，例如登仙台、万岁亭、白鹤观等。少室山也有着名建筑，少林寺即其中之一。
后来，他饱览全国名山之后，有人问四海山川何处最奇，他便答说：“薄海内外，无如徽之黄山，登黄山天下无山，观止矣。”在他看来，黄山的美，已是极致了。
霞客五次入闽中
福建又称闽，位于祖国的东南，境内多奇山丽水，是徐霞客游历、考察的重点地区。在1616年至1633年的十七年间，霞客先后五次入闽。
第一次是在万历四十四年（1616年），徐霞客在冒雪游白岳山和黄山之后，兴致未尽，到福建寻访武彝山（又名武夷山）。
武夷山通常有广、狭义之分。广义的是指位于江西、福建两省交界之处的武夷山，海拔一千米左右，是赣江与闽江的分水岭。徐霞客所要寻访的武夷山，则是指狭义的武夷山，它位于崇安县西南十公里处，是由红色砂丘构成的，海拔六百米左右的低山。它方圆百里，不与外山相连。主要风景向称“三三六六”，即“溪曲三三水”，“山环六六峰”。原来，武夷山有一条弯弯曲曲、清流如带的九曲溪水，萦绕着两岸三十六座秀拔奇伟、千姿百态的赤色山峰，水映山光，山挟水转，构成一幅碧水丹山的绝妙画卷。
古人有诗赞曰：“三十六峰真奇绝，一溪九曲碧涟漪；白云遮眼不知处，人间仙境在武夷。”
这年二月二十三日，徐霞客乘船来到崇溪与武夷溪的会合处。武夷溪即九曲溪，溪口矗立着进入武夷山的第一峰大王峰。徐霞客打算先游九曲，所以弃其他名胜不游，沿九曲溪口逆流而进，从一曲、二曲、三曲……直到六曲。但见两岸千峰竞秀，水光映照，如在画中游。在三曲，霞客注意到，在溪流左边壁立千仞的大藏峰崖端的空隙里，插着许多木板，上面斜放一只木舟，这就是所谓“架壑舟”。又叫悬棺、仙船、仙脱，是秦汉以前古代越族的一种葬具。古越部族生活在水上，船是他们日常生活中主要工具，为让死者在幽冥之中继续享用，故用船棺作葬具。
船至六曲，水急滩险，不能再行，霞客便舍舟登岸，进入接笋峰和仙掌峰之间的“云窝”。寻找登临隐屏峰的路径。这里的路十分难走，他只能沿石壁间的小径向上攀登。到了绝壁之处，“悬大木为梯，贴壁直竖云间”。这个木梯共有三截，八十一级。木梯尽处，又有铁索横系山腰，崖壁上凿了一个个可以容足的斜坎。霞客就这样攀索扶壁而上，一直登上隐屏山顶。在这四面悬崖的峰顶，居然有亭子踞立其巅，周围还长着青青的翠竹，犹如仙境一般。
从隐屏峰下来，霞客乘兴再登天游峰。天游峰号称“武夷第一胜地”。
登临峰顶，极目四望，千峰拥翠，青紫万状。凭空下眺。九溪环碧，萦回如带，山上山下，如同天上人间，两相隔绝。
第二天，霞客沿九曲溪向前，饱览沿岸的美景。他先到座落在七曲溪以北的三仰峰下面的“小桃源”。这是一个乱石崩崖堆成的天然门洞、由洞口躬身而入，即是四面被丛山环抱的盆地，中间有平整的农田和曲折的溪流，四周是苍松翠竹。鸡声人语相闻，俨然世外桃源，令人乐而忘返。
徐霞客一直走到九曲溪的尽头，忽然发现北面有一座十分奇特的山崖，上下都是绝壁，唯有一道狭窄的缝隙横贯其间，必须要趴下像蛇那样爬行，才能通过。霞客好奇心大起，又想去试试，便从缝隙中穿行。不一会儿，这道缝隙渐渐变窄，绝壁也更险峻。转弯之处，上下七寸高，宽仅一尺五寸，身外便是万丈悬崖。霞客没有退缩，他匍匐前进，身体紧靠崖壁，周旋了半天方才脱险。
因为九曲已尽，徐霞客又乘舟回返。在四曲，霞客游览了虎啸岩南面的一线天。这是一座陡岩，如同被利剑劈开，形成一个深一百尺、宽仅三尺的岩缝，自岩下仰望，天只有一根线那么大，故得名“一线天”。
最后一天，霞客游览了换骨岩、水帘洞等风景点。水帘洞是武夷山最大的岩洞，岩顶有两条泉水，“千丝万缕，悬空倾泻”，非常壮观。
徐霞客第一次入闽，仅用三天时间游览武夷山，便自浙江返回。
泰昌元年（1620年），徐霞客第二次入闽，游览九鲤湖。
九鲤湖位于福建仙游县，面积不大，风景绝佳。相传有何氏九仙在湖中骑鲤鱼而升天，故名九鲤湖。武夷山以山景闻名，而九鲤湖以水色着称，尤其是随山势而形成的九条瀑布，形态各异，动人心魄。当地人称之为九漈。
六月初七，徐霞客和他的叔父率几名仆人来到福建兴化府（今莆田），进入山岭中寻访九鲤湖。当时正是盛夏，烈日炎炎，把人晒得发晕，可走了好久也没有见到湖的影子，大家都怀疑可能是走错了路。
突然，他们听见了巨大的声音，循声音走过去，见一条清亮的溪流平静地流着、流着，然后蓦地消失，原来是下泄到一个湖中。平静的溪水欢快地冲下去，似万马奔腾，有雷霆万钧之势，发出巨大的声响，这就是九漈中的第一漈——雷轰漈。
九鲤湖就在眼前，霞客和他的游伴顿觉凉爽了不少。湖没有浩荡气势，但在万山之中，出现这一泓澄碧，真让人感叹造物主之匠心独运！
雷轰漈的西边，建有一个九仙祠，用来祭祀乘鱼飞去的仙人。晚上霞客就寄居这里。这天夜晚，他坐祠前纳凉，抬头望见一轮新月挂在峰顶之上，清辉投射在湖面上，令人神清气爽，顿时、所有的疲劳和郁闷均被一扫而光。
山中异常幽静，只有飞瀑的声音。这一夜，他睡得格外香甜。
第二漈正对九仙祠，是湖水流出形成的瀑布。徐霞客记述得极生动：“湖穷而由此飞坠深峡，峡石如劈，两崖壁立万仞。水初出湖，为石所扼，势不得出，怒从空坠，飞喷冲激，水石各极壮观。”
第三漈名叫珠帘泉，它和另一道瀑布同时奔涌而出，如两条飞舞的玉龙，在空中交相辉映。泉水下泄成潭，清澈幽碧，别有风致，此为第四漈。
徐霞客这时完全被大自然的美迷住了，不再刻意识别哪是第五漈，哪是第六漈……
崇祯元年（1628年）二月，霞客离开家乡，第四次入闽，直驱将乐县境内的玉华洞。
玉华洞是个石灰岩溶洞，洞内有两条甬道，全长约七公里，由藏禾洞、雷公洞、果子洞、溪源洞、黄泥洞、白云洞等六个洞穴组成，并有三条地下河。霞客和向导携带点燃的松枝进入洞内，刚历级而下数尺，即遇地下河。
他们溯流而上，甬道忽宽忽窄。两旁洞壁呈黄色或白色。石钟乳形态各异，有的像一挂挂荔枝，遂称“荔枝柱”，有的像风中的残烛，即名“风泪烛”，有像一面大鼓，就叫“仙鼓”，还有的能让人联想起神奇的故事，如“幔天帐”、“达摩渡江”、“仙人田”等，都惟妙惟肖，美不胜收。临出洞口时，洞壁的钟乳石层层叠叠，像重重楼阁一般，形成一景——“九重楼”。霞客认为此洞之美，堪比张公洞。
崇祯三年七月，徐霞客游浙江青湖时，有个叫刘对予的告诉他有一座浮盖山岩石奇诡，不可不游，他便临时决定去访此山。
浮盖山位于浙、闽、赣三省交界处，“怪石拏云，飞霞削翠”。
霞客到时正逢下雨，八月初四，他冒雨探访此山有名的龙洞。
所谓的龙洞不过是一个岩缝而已，非常狭窄，就像是武夷山的“一线天”，区别仅在于上面是封闭的，连一线的天空也见不到。霞客和一个僧人一起进入此洞，一开始还能走动，到后来要侧身才能勉强走进，后来干脆脱下衣服往里一点点挤。等到他们看完了洞内景观后想出洞，就更加困难了。因为出洞是自下侧身而上，胸背贴着石壁，膝盖也无法伸屈，手和脚都无处着力，而且越急越动弹不得。费了九牛二虎之力挣扎出来时，两人相对而笑，好像是死里逃生一般。
出龙洞后，霞客登浮盖山绝顶，心情为之开朗，游龙洞时的种种险状早已跑到九霄云外去了。
崇祯六年（1633年），徐霞客第五次入闽，这次他不是游山玩水、实地考察，而是来寻访一个人——“闽中大师”黄道周。
黄道周（1584—1646年），字幼立、细遵，号石斋，福建漳州人。他学贯古今，名重一时。《明史》称他“以文章风节高天下，严冷方刚，不谐俗流，公卿多畏而忌之”。
由于陈继儒的介绍，徐霞客在崇祯元年（1628年）曾专程拜访黄道周，两人一起议论政局、品评学问、诗词赠答，一见如故，结为知交。
这年的夏秋之交，徐霞客还在山西的五台山和恒山旅行，得知黄道周行迹之后，不远万里，奔赴福建。黄道周见老友远程来访，十分高兴，写了许多诗相赠。今日尚存其中的《五言古风四首》，有许多诗句豪情万丈，表达了对时局的不满和济世救国的壮志。下面是摘取的长诗片断：
一夫食千耳，久痼无百药。
谁能洗众胃？慨然秉吾卓。
不畏明镜蚀，所畏白日曜。
唐俗无足谈，贤者何不扩。
扼腕教姬孔，掩眦放鼠雀。
人生得一知己足矣。徐霞客在以后的岁月中，从黄道周身上汲取了可贵的精神力量，这使他在那个时代，能够目光敏锐、志向坚定，比其他人走得更远，看得更远。
为探幽奇万里行
天启五年（1625年），徐霞客的老母去世。徐霞客悲痛万分，三年不肯出家门一步，为母亲守丧。
但是，从另一方面说，母亲的死也为霞客卸去了一个精神上的包袱。以往旅行，他总是心系老母，不敢在外耽搁太久，所以像广西桂林、四川峨眉这些他最向往的地方，都因为路途遥远而不得不作罢。现在，他感到一身轻松，可以毫无顾忌地实现他的远游计划了。
母亲的去世是徐霞客旅行考察生涯的一个转折点。后期的徐霞客旅行路线更远，行踪不定，考察也更细致，取得了非常大的成就。
徐霞客经过长期的准备，一个空前浩大的远行计划诞生了，他要在有生之年完成这个计划。
崇祯九年（1636年），徐霞客已经年过半百。他深感自己已老了，不能耽搁了，便毅然上路，踏上了他一生中最后一次，也是最为出色的万里征程。
这次万里远游，前后持续了四年之久，经过的地区包括浙江、江西、湖南、广西的平原、丘陵、山区，直至贵州和云南的高山峻岭，有许多是人迹罕至的荒僻区域。主要的目标集中在探测长江上游的渊源，南北盘江的源流，“桂林千笋”（西南岩溶地貌），澜沧江、怒江的源流、“三大龙脉”中南龙的分布，还要登览着名的鸡足山。
四年之中，这个年逾半百的老人雄心勃勃，显示了惊人的意志和毅力，克服了常人难以想象的种种困难，终于创造了人间奇迹。
崇祯九年九月十九日，秋高气爽，正是外出旅行的好季节。徐霞客一行上路了。和他同行的有两个仆人，一个姓顾，一个姓王。还有一个南京迎福寺的和尚，名叫静闻，他想去云南佛教圣地鸡足山，便与徐霞客结伴而行。
霞客一行乘小舟取水路，经无锡、苏州、昆山至青浦余山，访陈继儒，请他作书寄鸡足山僧人。小舟于二十八日至杭州。十月初一，游飞来峰、灵隐寺。灵隐寺的罗汉殿尚未完工。有一老僧如枯木盘坐，仰望天空，眼睛一眨不眨。恰巧一群丽妆佳人来此游玩，燕语莺声，流香婉转，与老僧相映成趣。
初二日自杭州西行，经余杭、临安至洞山。在临安，遇到一位曾去过日本的僧人，他的日本见闻让霞客颇为神往。在洞山，无意之间得游明幽二洞，一为干洞，一为水洞，洞中景物极美。“及出洞，半日之间，已若隔世”。
十月初五，那个姓王的仆人逃之夭夭。此时正值乱世，清兵入犯，北部告急。而此次游历山高路远，那个仆人感到恐惧，便私下逃跑。万里远征刚开始，霞客便遭到了打击。
十月十七，霞客进入江西境内。次日经过铅山的旁罗时，见南面耸立着一座高峰，“峭削天际”，这正是二十年前游武夷山途中见过的鹅峰。青山依旧在，几度夕阳红。一种沧桑感占据了霞客的心头。“人寿几何，江山如昨，能不令人有秉烛之思耶！”他多希望能在有生之年游遍祖国的山山水水啊！
