第三阶段：扎扎实实地实施《方案》。这时，各部门根据《方案》的总体要求，制订本部门的改革方案，提出取消的审批、核准项目；对拟保留的审批、核准事项进行规范化。然后将各单位的改革方案提交审改办审查。审改办再提出修改意见。这个过程进行的很艰难，据说，每减少一项审批，都要做许多协调工作。审批的减少，带来权力的减少或削弱，带来利益的减少或实惠的减少，存在一些利益冲突和改革阻力可以想象。但是深圳力排艰难终于取得重要进展。
二、《深圳市审批制度改革若干规定》正式实施
1998年8月25日，深圳召开了市政府第二届111次常务会议，审议通过了《深圳市审批制度改革若干规定》（以下简称《规定》）。1999年2月13日，以深圳市人民政府令的方式正式发布了这一《规定》。1999年3月2日市政府召开了深圳市审批制度改革新闻发布会，在会上，常务副市长李德成宣布《深圳市审批制度改革若干规定》正式实施，即宣布：市政府部门原有审批事项723项减少为305项，比原来减少418项。原有核准事项368项，减少为323项，比原来减少45项。原有审批与核准事项合计1091项，拟保留628项，减少463项（其中取消286项，合并、调整减少19项），减少43%。（《深圳特区报》1999年3月2日第1版。）
《规定》颁布实施了近一年，其成效怎么样？据体改办提供的资料看，目前，《规定》已基本实施到位，改革圆满完成，达到了预期目的。
（一）审批事项减少一半已实施到位
市政府42个部门和单位按照《规定》的要求，将减少审批作为一项严肃的政治任务来抓，层层动员、突出重点，专人负责，任务到人，保证每项改革有目标、有措施、有效果，真正落实到位。另外，对市政府取消了263项审批与核准事项，各有关部门都作为重点工作来抓，该取消的坚决取消，取消后还要能够管好、管住。为了使取消的事项切实落到实处，各部门采取四种方式管理。
第一，将202项放开由市场调节，由企业、社会团体、个人自主决定。这种情况主要是对应属企业自主权的事项，或者国家和广东省未明确规定实行行政管制的事项。第二，对6项实行公开招标、拍卖。这种情况主要是对应经营性指标和配额，如旅行社三类社、部分出口商品配额、道路客运线路经营权等。第三，将41项下放到各区政府有关部门管理或归口到市政府其他部门管理。第四，对确实需要市政府部门进行行政监管、行政统计、存案管理的事项，实行政府备案管理制度，事前不再报批。按有关规定，属于禁止行为，或数量已饱和，停止审批。（傅伦博主编：《建设社会主义法制城市——深圳市依法治市的探索与实践》第129页。深圳海天出版社2000年10月出版。）
（二）审批与核准的规范化程度明显提高
审批规范化是指审批要有法律和政策依据；审批要有明确的程序规定，即审批要公布审批的依据、规定审批的条件、审批的环节、审批的时限等。《深圳市审批制度改革若干规定》对审批的规范化做了明确要求，根据这些要求，这次改革对拟保留的审批与核准程序进行了规定，使其规范化程度明显地提高。
第一，依法确立审批与核准事项。在保留的628项审批和核准中，94.3%的事项有国家和省的法律、法规、规章依据。另有5.7%的事项，依据深圳市颁布的法规、规章和规范性文件设立。
从《保留的审批与核准事项目录》中可以看出，每一项审批与核准都列出了明确的法律或政策依据。
第二，对保留的每一审批事项，各部门都明确规定了审批对象、审批条件、审批程序、审批时限等，对审批和核准的条件进一步细化、量化，增强了审批和核准事项的操作性。还对其中的251项审批和核准程序作了适当的简化和调整，尤其是部门内部的审批环节，比过去有明显减少。市政府各部门还加强了后续监管，公布服务标准，并在部门内部按职能分工分解细化，实行审批人员岗位责任制度，促进了审批管理工作的科学化、规范化和制度化。比如，市运输局、教育局、建设局、人事局、农业局、贸发局、计划局、经发局、科技局、司法局、工商局、统计信息局、外资局等部门，出台了比较详细的审批和核准业务管理办法，操作规程，办事指南等。市环保局形成了从项目受理、环保审批到环保设备验收共6种典型的环保批文范例、13项操作规范、86项批复标准语句的审批规范体系。（傅伦博主编：《建设社会主义法制城市——深圳市依法治市的探索和实践》第132～133页。深圳海天出版社2000年10月出版。）
第三，加强了审批的监督和监管。加强审批监督和监管的重要方式，是实行审批公开制度。实行审批公开制度，是这次改革的一项重要内容，各有关部门基本做到了将每项审批的对象、条件、程序、手续、时限以及需提供的资料对外公布。其形式主要有：在办公场所明文公布，以部门规范性文件形式公布，在办事窗口设立大屏幕和触摸屏公布，通过亿通声讯台等声讯系统公布，通过互联网公布等。市劳动局、市外资局、市经发局、市高新办、福田保税区等部门，还通过举办讲座、答疑会等形式，为企业介绍审批制度改革的有关政策法规，效果好，很受欢迎。除了实行审批公开制度以外，还继续推行社会举报制度、年检年审制度、行政稽查制度、岗位交流制度、持证上岗制度、审批分级负责制度。许多部门还进一步实施和完善公文督办制度、审监分离制度，实行一审一监，加强部门内部监督检查；推行行政过错责任追究制度，强化审批责任制和相应的奖惩、考核办法。
（三）改进了审批方式，提高了审批效率
第一，广泛实行部门内部“窗口式办文”。据统计，审批和核准事项较多的21个部门，已经实行或即将实行“窗口办文”方式，以规范审批程序，提高审批效率。
第二，采用联合审批制或定期会签制。比如户外广告审批，工商、规划国土、城管、交管已实行定期会签制，下一步将继续改进和完善。
第三，实行社会咨询听证制度。工商、运输两个部门在审批与公众利益联系密切的收费项目和公交线路、站台设置时，已试行社会听证制，充分听取社会各有关方面的意见，尤其是公众的意见，然后再进行审批决策。这两个局拟在更多的项目和更大的范围内实行这项制度，其他一些与公众利益联系密切的审批部门也将推行这项制度，以促进政府决策的民主化和科学化。
第四，实行专家审查、咨询制度。对技术性、专业性比较强的验收、评审、许可等事项，请专家提供咨询、进行审查，提高政府决策的科学性。卫生、科技、建设、计划、规划国土、环保、教育、水务等8个部门的19项审批和核准采用了这种方式。比如，市卫生局医疗机构开业许可，将过去由个别行政领导决定，改为由医学专家和管理专家共同讨论、集体审查的办法，并成立了市医疗机构专家评议委员会，以解决医疗机构盲目审批、审批过滥、审批行为不规范的问题。
（四）加强监督与协调，促进《规定》实施到位
为促进《规定》的有效实施，市政府审批制度改革办公室先后到审批事项较多的23个部门和单位及其下属机构，检查《规定》的落实情况，并就有关部门、社会公众和企业提出的问题，进行调查研究，协调解决。比如，市公安局过去是审批和核准事项最多的部门，也是多年来社会反映行政审批存在问题较多的一个部门。这次改革，市政府将该局作为重点部门来抓，《规定》颁布实施10多天后，一个企业向市审改办反映，市政府《规定》已经很明确，开办旅馆取消市贸发局和市公安局审批，不再实行特营许可证管理，但市公安局治安分局还在审批，有些公安分局和派出所还以旅店在本所管辖范围内为由，要求申请人向派出所报批。市审改办获悉这一情况后，马上与市公安局改革领导小组联系，要求公安局改革领导小组加强督察力度，不折不扣地执行市政府规定，市公安局有关部门及其基层组织立即停止了审批。
《规定》实施以后，有些部门开始对工作不太适应，不知道取消审批后怎么管理。比如，市工商行政管理部门反映，取消一部分行业主管部门前置审批后，该局在直接登记注册时存在衔接问题和登记条件的把握问题。市审改办马上依法做出说明和解释，并进行了必要的协调，使问题很快得到了解决。《规定》颁布实施后，市建设局对涉及园林绿化企业、白蚁防治施工企业资质管理等方面的审批职能提出异议。审改办与有关部门反复协调，并征求了国务院有关部门的意见，最后根据市领导的指示，在基本维持市政府《规定》的前提下，对个别事项进行了调整，适当解决了几个部门的事权划分问题。
三、审批制度改革成效与影响评价
深圳审批制度改革产生了良好效果，政府职能转变上了一个新台阶。正如深圳市审改办认为的那样，这项改革力度大、影响大、意义大，使政府部门较好地从繁忙的审批业务中解脱出来，转到了依法加强宏观调控、制订市场规则上来。进一步扩大了企业自主权、更好地发挥了市场机制的作用，解放和发展了生产力。
这次改革是一次市场经济观念教育和法制教育，促进了公务员思想观念的转变，强化了政府部门对依法行政的认识。例如，有一位局领导说，“过去我不大清楚我们局具体管了多少事情，只是有个大概印象，通过这次依法清理审批事项，全局上下反复讨论，才真正弄明白我们管了些什么，哪些该管，哪些不该管，该管的怎么管。”
这次改革大大减少了政府日常审批事务，简化了审批环节，提高了办事效率。例如，市外资局对企业合同、发起人协议、公司章程和企业变更审批，由过去30个工作日减少到15个工作日内完成，办理核准不超过5个工作日。市国资办取消市属国有企业资产评估结果确认和部分国有资产转让产（股）权审批，将使一大批中小企业产（股）权转让减少两个环节，审批时间明显缩短。市环保局对环境基本没有影响的I类建设项目，在5个工作日内完成审批，这使40％的审批将比过去减少9个工作日，手续也大大简化。据初步统计，在拟保留的审批和核准事项中，有346项的审批时限比过去平均缩短了5.6天，许多事项低于国家和省规定的时限。
这次改革理顺了一些部门间的业务交叉关系（如贸发局与工商局、体育发展中心、农业局的业务交叉问题得到解决），明确了市区在部分行业的事权划分。（上述资料来自深圳审批制度改革办公室。）
但由于审批制度改革的复杂性、艰巨性，决定了这项改革不可能一步到位。一方面，一些政府部门仍热衷于通过行政审批干预经济及社会活动，影响了市场经济的健康有序发展，影响了政府宏观管理效果。另一方面，受国家现行行政管理体制和法律法规体系的约束，决定了地方政府对一些审批事项尽管想取消但又取消不了，制约了地方政府职能转变。当前，改革后的政府审批制度还存在一些问题。如，审批和核准事项仍然偏多，许多事项尽管保留的必要性不大，但仍继续保留；审批事项取消后，机构和人员编制未能及时做出调整；审批方式仍不够规范，审批的公开化、科学化、制度化程度仍不够高，存在主观随意性，行政监督制约机制不完善。另外一个突出问题就是，多环节、多部门审批依然存在。这主要表现在房地产开发建设项目和其他建设项目，要报十多个部门审批，环节多，时间长，涉及面广，业务量大，为了进一步简化手续，减少环节，提高效率，审批制度改革办公室曾经建议：对房地产开发建设项目实行联审制，由市规划国土局牵头，房地产和其他建设项目从计划立项、规划设计到竣工验收所涉及的所有部门和单位，采取联合办公的方式，实行“一条龙”审批和服务。但这个建议暂时未能采纳。我们相信，随着深圳行政改革的深化，这个难题迟早要解决。深圳这次审批制度改革具有明显的过渡性。许多问题这次还解决不了，随着深圳行政改革的深化，审批制度改革也将深化。
审批制度改革对深圳下一轮的机构改革也产生了积极影响：一是清理了政府各部门的职能，规范了政府各部门的审批职责，为下一轮“三定”和机构改革做了前期准备。二是审批制度改革拉动了对第六次机构改革的需求。一些部门审批的减少，明显意味着一些机构需要撤并。审批制度改革之后，会推动深圳机构改革。
深圳审批制度改革不仅受到深圳社会各界的肯定和支持，而且在国内引起了广泛关注，产生了强烈反响。中央、地方和香港的很多报刊以及国家和省领导给予了较高的评价，认为深圳转变政府职能改革有新的突破，在全国开了一个好头，体现了特区敢闯敢干的精神。国家领导人李铁映、邹家华就深圳市的审批制度改革思路，专门给国家有关部门作了批示，要求给予足够的重视和借鉴。全国人大法律委员会用一期《法制工作简报》，专门介绍深圳的审批制度改革情况，并给予充分肯定。广东省将深圳审批制度改革经验在全省推广，进行了广东省政府审批制度改革，促进了全省政府职能转变。目前，已有北京、上海、辽宁、河南、哈尔滨、长春、石家庄、海口、宁波、珠海、佛山、东莞、牡丹江、株州、顺德等地，在深圳的影响下，已着手进行政府审批制度改革。而且，中央也对许多审批事项下放。现在，审批制度改革推向全国，这表明，深圳这项改革在国内起到了良好的示范和辐射效应。
附件一：
《深圳市政府审批制度改革实施方案》（1998年1月25日）
深发[1998]1号
